Protein–RNA interactions for Protein: Q08438

VHS3, Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase subunit VHS3, yeastyeast

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS3Q08438 YLR235CYLR235C 399 nt11.1□□□□□ -0.63
VHS3Q08438 HSP60YLR259C 1719 nt11.09□□□□□ -0.63
VHS3Q08438 ANP1YEL036C 1503 nt11.06□□□□□ -0.64
VHS3Q08438 UME6YDR207C 2511 nt11.06□□□□□ -0.64
VHS3Q08438 CCA1YER168C 1641 nt11.05□□□□□ -0.64
VHS3Q08438 GLK1YCL040W 1503 nt11.04□□□□□ -0.64
VHS3Q08438 TIM23YNR017W 669 nt11.04□□□□□ -0.64
VHS3Q08438 PTH1YHR189W 573 nt11.03□□□□□ -0.64
VHS3Q08438 BNA2YJR078W 1362 nt11.03□□□□□ -0.64
VHS3Q08438 SPC25YER018C 666 nt11.02□□□□□ -0.65
VHS3Q08438 STB1YNL309W 1263 nt11.02□□□□□ -0.65
VHS3Q08438 FUR4YBR021W 1902 nt11.01□□□□□ -0.65
VHS3Q08438 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11□□□□□ -0.65
VHS3Q08438 YLR179CYLR179C 606 nt11□□□□□ -0.65
VHS3Q08438 SPP1YPL138C 1062 nt10.98□□□□□ -0.65
VHS3Q08438 GPI16YHR188C 1833 nt10.98□□□□□ -0.65
VHS3Q08438 MIC12YBR262C 321 nt10.97□□□□□ -0.65
VHS3Q08438 FEN2YCR028C 1539 nt10.96□□□□□ -0.65
VHS3Q08438 YKL030WYKL030W 606 nt10.93□□□□□ -0.66
VHS3Q08438 AHT1YHR093W 549 nt10.91□□□□□ -0.66
VHS3Q08438 CCT4YDL143W 1587 nt10.89□□□□□ -0.67
VHS3Q08438 PRP4YPR178W 1398 nt10.89□□□□□ -0.67
VHS3Q08438 YIR016WYIR016W 798 nt10.88□□□□□ -0.67
VHS3Q08438 HHO1YPL127C 777 nt10.88□□□□□ -0.67
VHS3Q08438 YPR064WYPR064W 420 nt10.88□□□□□ -0.67
VHS3Q08438 VPS60YDR486C 690 nt10.87□□□□□ -0.67
VHS3Q08438 WSC2YNL283C 1512 nt10.87□□□□□ -0.67
VHS3Q08438 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.86□□□□□ -0.67
VHS3Q08438 YEL076CYEL076C 651 nt10.86□□□□□ -0.67
VHS3Q08438 YLR464WYLR464W 651 nt10.86□□□□□ -0.67
VHS3Q08438 ALG12YNR030W 1656 nt10.85□□□□□ -0.67
VHS3Q08438 SWC5YBR231C 912 nt10.83□□□□□ -0.68
VHS3Q08438 YGR201CYGR201C 678 nt10.82□□□□□ -0.68
VHS3Q08438 YCL074WYCL074W 927 nt10.81□□□□□ -0.68
VHS3Q08438 AAC1YMR056C 930 nt10.81□□□□□ -0.68
VHS3Q08438 AGP1YCL025C 1902 nt10.81□□□□□ -0.68
VHS3Q08438 BMT6YLR063W 1098 nt10.8□□□□□ -0.68
VHS3Q08438 DUS1YML080W 1272 nt10.8□□□□□ -0.68
VHS3Q08438 DPS1YLL018C 1674 nt10.79□□□□□ -0.68
VHS3Q08438 ALG3YBL082C 1377 nt10.79□□□□□ -0.68
VHS3Q08438 TAD3YLR316C 969 nt10.78□□□□□ -0.68
VHS3Q08438 YKR005CYKR005C 1578 nt10.77□□□□□ -0.69
VHS3Q08438 MCH5YOR306C 1566 nt10.74□□□□□ -0.69
VHS3Q08438 XDJ1YLR090W 1380 nt10.7□□□□□ -0.7
VHS3Q08438 YGR259CYGR259C 441 nt10.7□□□□□ -0.7
VHS3Q08438 RTG1YOL067C 534 nt10.67□□□□□ -0.7
VHS3Q08438 IRC24YIR036C 792 nt10.65□□□□□ -0.7
VHS3Q08438 GOR1YNL274C 1053 nt10.64□□□□□ -0.71
VHS3Q08438 STR3YGL184C 1398 nt10.64□□□□□ -0.71
VHS3Q08438 GDH3YAL062W 1374 nt10.64□□□□□ -0.71
VHS3Q08438 YLR415CYLR415C 339 nt10.63□□□□□ -0.71
VHS3Q08438 AVT6YER119C 1347 nt10.62□□□□□ -0.71
VHS3Q08438 BDH1YAL060W 1149 nt10.62□□□□□ -0.71
VHS3Q08438 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.61□□□□□ -0.71
VHS3Q08438 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.59□□□□□ -0.71
VHS3Q08438 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.59□□□□□ -0.71
VHS3Q08438 DUT1YBR252W 444 nt10.59□□□□□ -0.71
VHS3Q08438 SNF1YDR477W 1902 nt10.57□□□□□ -0.72
VHS3Q08438 HUA1YGR268C 597 nt10.55□□□□□ -0.72
VHS3Q08438 BIO5YNR056C 1686 nt10.54□□□□□ -0.72
VHS3Q08438 TIM17YJL143W 477 nt10.54□□□□□ -0.72
VHS3Q08438 AQY2YLL052C 450 nt10.54□□□□□ -0.72
VHS3Q08438 SHM2YLR058C 1410 nt10.53□□□□□ -0.72
VHS3Q08438 RTN2YDL204W 1182 nt10.52□□□□□ -0.73
VHS3Q08438 NAR1YNL240C 1476 nt10.52□□□□□ -0.73
VHS3Q08438 YSP3YOR003W 1437 nt10.5□□□□□ -0.73
VHS3Q08438 DAT1YML113W 747 nt10.47□□□□□ -0.73
VHS3Q08438 MRPL8YJL063C 717 nt10.46□□□□□ -0.73
VHS3Q08438 ADO1YJR105W 1023 nt10.43□□□□□ -0.74
VHS3Q08438 CYT2YKL087C 675 nt10.43□□□□□ -0.74
VHS3Q08438 PBP1YGR178C 2169 nt10.42□□□□□ -0.74
VHS3Q08438 NIT1YIL164C 600 nt10.42□□□□□ -0.74
VHS3Q08438 YCR102CYCR102C 1107 nt10.41□□□□□ -0.74
VHS3Q08438 YNL115CYNL115C 1935 nt10.37□□□□□ -0.75
VHS3Q08438 NBP35YGL091C 987 nt10.36□□□□□ -0.75
VHS3Q08438 SGT2YOR007C 1041 nt10.35□□□□□ -0.75
VHS3Q08438 PEX25YPL112C 1185 nt10.35□□□□□ -0.75
VHS3Q08438 ARP6YLR085C 1317 nt10.34□□□□□ -0.75
VHS3Q08438 VPS75YNL246W 795 nt10.33□□□□□ -0.76
VHS3Q08438 PLB1YMR008C 1995 nt10.3□□□□□ -0.76
VHS3Q08438 RPM1RPM1 483 nt10.29□□□□□ -0.76
VHS3Q08438 LSC2YGR244C 1284 nt10.24□□□□□ -0.77
VHS3Q08438 YFL066CYFL066C 1179 nt10.22□□□□□ -0.77
VHS3Q08438 TIR3YIL011W 810 nt10.22□□□□□ -0.77
VHS3Q08438 YFR018CYFR018C 1092 nt10.21□□□□□ -0.77
VHS3Q08438 ALD4YOR374W 1560 nt10.2□□□□□ -0.78
VHS3Q08438 FRE6YLL051C 2139 nt10.18□□□□□ -0.78
VHS3Q08438 HIF1YLL022C 1158 nt10.17□□□□□ -0.78
VHS3Q08438 PRM5YIL117C 957 nt10.16□□□□□ -0.78
VHS3Q08438 PAU7YAR020C 168 nt10.16□□□□□ -0.78
VHS3Q08438 GAP1YKR039W 1809 nt10.14□□□□□ -0.79
VHS3Q08438 SAM35YHR083W 990 nt10.14□□□□□ -0.79
VHS3Q08438 UTR1YJR049C 1593 nt10.13□□□□□ -0.79
VHS3Q08438 CMP2YML057W 1815 nt10.12□□□□□ -0.79
VHS3Q08438 NDI1YML120C 1542 nt10.1□□□□□ -0.79
VHS3Q08438 PRO1YDR300C 1287 nt10.09□□□□□ -0.79
VHS3Q08438 POM34YLR018C 900 nt10.09□□□□□ -0.79
VHS3Q08438 YML089CYML089C 369 nt10.09□□□□□ -0.79
VHS3Q08438 SHH4YLR164W 507 nt10.08□□□□□ -0.8
VHS3Q08438 YAT1YAR035W 2064 nt10.08□□□□□ -0.8
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