Protein–RNA interactions for Protein: Q06625

GDB1, Glycogen debranching enzyme, yeastyeast

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Length 1,536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GDB1Q06625 AQY1YPR192W 918 nt16.27■□□□□ 0.2
GDB1Q06625 TRM5YHR070W 1500 nt16.27■□□□□ 0.19
GDB1Q06625 GAL1YBR020W 1587 nt16.26■□□□□ 0.19
GDB1Q06625 SWC5YBR231C 912 nt16.23■□□□□ 0.19
GDB1Q06625 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt16.19■□□□□ 0.18
GDB1Q06625 YNL195CYNL195C 786 nt16.19■□□□□ 0.18
GDB1Q06625 VPS75YNL246W 795 nt16.18■□□□□ 0.18
GDB1Q06625 GLR1YPL091W 1452 nt16.17■□□□□ 0.18
GDB1Q06625 CCT4YDL143W 1587 nt16.16■□□□□ 0.18
GDB1Q06625 STB1YNL309W 1263 nt16.14■□□□□ 0.18
GDB1Q06625 SIM1YIL123W 1431 nt16.14■□□□□ 0.17
GDB1Q06625 YHL050CYHL050C 2094 nt16.11■□□□□ 0.17
GDB1Q06625 ATF2YGR177C 1608 nt16.1■□□□□ 0.17
GDB1Q06625 DAT1YML113W 747 nt16.09■□□□□ 0.17
GDB1Q06625 VPS60YDR486C 690 nt16.09■□□□□ 0.17
GDB1Q06625 GPI16YHR188C 1833 nt16.08■□□□□ 0.16
GDB1Q06625 SPC25YER018C 666 nt16.08■□□□□ 0.16
GDB1Q06625 ALG3YBL082C 1377 nt16.07■□□□□ 0.16
GDB1Q06625 RBG2YGR173W 1107 nt16.06■□□□□ 0.16
GDB1Q06625 PAU7YAR020C 168 nt16.03■□□□□ 0.16
GDB1Q06625 DDR2YOL052C-A 186 nt16.01■□□□□ 0.15
GDB1Q06625 NDI1YML120C 1542 nt15.99■□□□□ 0.15
GDB1Q06625 YGL034CYGL034C 366 nt15.98■□□□□ 0.15
GDB1Q06625 SPT8YLR055C 1809 nt15.98■□□□□ 0.15
GDB1Q06625 SHB17YKR043C 816 nt15.94■□□□□ 0.14
GDB1Q06625 CRR1YLR213C 1269 nt15.93■□□□□ 0.14
GDB1Q06625 UBA4YHR111W 1323 nt15.92■□□□□ 0.14
GDB1Q06625 RBG1YAL036C 1110 nt15.92■□□□□ 0.14
GDB1Q06625 ERF2YLR246W 1080 nt15.89■□□□□ 0.13
GDB1Q06625 YFL067WYFL067W 528 nt15.87■□□□□ 0.13
GDB1Q06625 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt15.84■□□□□ 0.13
GDB1Q06625 XYL2YLR070C 1071 nt15.84■□□□□ 0.13
GDB1Q06625 TIM17YJL143W 477 nt15.84■□□□□ 0.13
GDB1Q06625 YSR3YKR053C 1215 nt15.83■□□□□ 0.12
GDB1Q06625 ANP1YEL036C 1503 nt15.81■□□□□ 0.12
GDB1Q06625 FEN2YCR028C 1539 nt15.8■□□□□ 0.12
GDB1Q06625 MIC10YCL057C-A 294 nt15.79■□□□□ 0.12
GDB1Q06625 SGT2YOR007C 1041 nt15.73■□□□□ 0.11
GDB1Q06625 YDR010CYDR010C 333 nt15.73■□□□□ 0.11
GDB1Q06625 RAD51YER095W 1203 nt15.73■□□□□ 0.11
GDB1Q06625 SNG1YGR197C 1644 nt15.72■□□□□ 0.11
GDB1Q06625 SHM2YLR058C 1410 nt15.66■□□□□ 0.1
GDB1Q06625 PHO89YBR296C 1725 nt15.65■□□□□ 0.1
GDB1Q06625 AIM45YPR004C 1035 nt15.64■□□□□ 0.09
GDB1Q06625 HEM12YDR047W 1089 nt15.62■□□□□ 0.09
GDB1Q06625 YIR016WYIR016W 798 nt15.62■□□□□ 0.09
GDB1Q06625 SAM1YLR180W 1149 nt15.61■□□□□ 0.09
GDB1Q06625 XDJ1YLR090W 1380 nt15.6■□□□□ 0.09
GDB1Q06625 RET2YFR051C 1641 nt15.59■□□□□ 0.09
GDB1Q06625 BDF1YLR399C 2061 nt15.58■□□□□ 0.08
GDB1Q06625 LYS4YDR234W 2082 nt15.58■□□□□ 0.08
GDB1Q06625 NCP1YHR042W 2076 nt15.55■□□□□ 0.08
GDB1Q06625 NIT1YIL164C 600 nt15.54■□□□□ 0.08
GDB1Q06625 YCR087WYCR087W 516 nt15.53■□□□□ 0.08
GDB1Q06625 SEC11YIR022W 504 nt15.51■□□□□ 0.07
GDB1Q06625 RPM1RPM1 483 nt15.51■□□□□ 0.07
GDB1Q06625 YLR111WYLR111W 333 nt15.48■□□□□ 0.07
GDB1Q06625 PCH2YBR186W 1695 nt15.47■□□□□ 0.07
GDB1Q06625 TAT1YBR069C 1860 nt15.46■□□□□ 0.07
GDB1Q06625 SDH5YOL071W 489 nt15.43■□□□□ 0.06
GDB1Q06625 COQ2YNR041C 1119 nt15.42■□□□□ 0.06
GDB1Q06625 YMR226CYMR226C 804 nt15.4■□□□□ 0.06
GDB1Q06625 GUT2YIL155C 1950 nt15.35■□□□□ 0.05
GDB1Q06625 MRP20YDR405W 792 nt15.34■□□□□ 0.05
GDB1Q06625 YNR029CYNR029C 1290 nt15.34■□□□□ 0.05
GDB1Q06625 GDH3YAL062W 1374 nt15.33■□□□□ 0.04
GDB1Q06625 BNA2YJR078W 1362 nt15.32■□□□□ 0.04
GDB1Q06625 ADH7YCR105W 1086 nt15.29■□□□□ 0.04
GDB1Q06625 CAB5YDR196C 726 nt15.28■□□□□ 0.04
GDB1Q06625 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt15.27■□□□□ 0.03
GDB1Q06625 MIC12YBR262C 321 nt15.27■□□□□ 0.03
GDB1Q06625 YLR349WYLR349W 507 nt15.26■□□□□ 0.03
GDB1Q06625 PIB2YGL023C 1908 nt15.26■□□□□ 0.03
GDB1Q06625 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt15.25■□□□□ 0.03
GDB1Q06625 RTF1YGL244W 1677 nt15.25■□□□□ 0.03
GDB1Q06625 BOP3YNL042W 1191 nt15.24■□□□□ 0.03
GDB1Q06625 SFA1YDL168W 1161 nt15.22■□□□□ 0.03
GDB1Q06625 YGR201CYGR201C 678 nt15.22■□□□□ 0.03
GDB1Q06625 YLR279WYLR279W 390 nt15.22■□□□□ 0.03
GDB1Q06625 STE4YOR212W 1272 nt15.22■□□□□ 0.03
GDB1Q06625 AVT6YER119C 1347 nt15.21■□□□□ 0.03
GDB1Q06625 RPS14BYJL191W 417 nt15.15■□□□□ 0.02
GDB1Q06625 PAU15YIR041W 375 nt15.13■□□□□ 0.01
GDB1Q06625 RPL4BYDR012W 1089 nt15.11■□□□□ 0.01
GDB1Q06625 RPL4AYBR031W 1089 nt15.11■□□□□ 0.01
GDB1Q06625 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt15.1■□□□□ 0.01
GDB1Q06625 HHO1YPL127C 777 nt15.1■□□□□ 0.01
GDB1Q06625 DUT1YBR252W 444 nt15.05■□□□□ -0
GDB1Q06625 PTK1YKL198C 1989 nt15.03■□□□□ -0
GDB1Q06625 AGP1YCL025C 1902 nt15.01□□□□□ -0.01
GDB1Q06625 YGR012WYGR012W 1182 nt15.01□□□□□ -0.01
GDB1Q06625 SHH4YLR164W 507 nt15.01□□□□□ -0.01
GDB1Q06625 RAX1YOR301W 1308 nt15□□□□□ -0.01
GDB1Q06625 RAD23YEL037C 1197 nt14.99□□□□□ -0.01
GDB1Q06625 GOR1YNL274C 1053 nt14.93□□□□□ -0.02
GDB1Q06625 YCR102CYCR102C 1107 nt14.92□□□□□ -0.02
GDB1Q06625 PEX2YJL210W 816 nt14.92□□□□□ -0.02
GDB1Q06625 FUN14YAL008W 597 nt14.92□□□□□ -0.02
GDB1Q06625 GPN2YOR262W 1044 nt14.91□□□□□ -0.02
GDB1Q06625 CLB6YGR109C 1143 nt14.9□□□□□ -0.02
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