Protein–RNA interactions for Protein: Q06336

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, yeastyeast

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GGA1Q06336 CMP2YML057W 1815 nt10.68□□□□□ -0.7
GGA1Q06336 RAX1YOR301W 1308 nt10.65□□□□□ -0.7
GGA1Q06336 SNG1YGR197C 1644 nt10.65□□□□□ -0.7
GGA1Q06336 TRM5YHR070W 1500 nt10.64□□□□□ -0.71
GGA1Q06336 DDR2YOL052C-A 186 nt10.64□□□□□ -0.71
GGA1Q06336 GAL1YBR020W 1587 nt10.64□□□□□ -0.71
GGA1Q06336 MET2YNL277W 1461 nt10.63□□□□□ -0.71
GGA1Q06336 GLK1YCL040W 1503 nt10.6□□□□□ -0.71
GGA1Q06336 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.6□□□□□ -0.71
GGA1Q06336 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.6□□□□□ -0.71
GGA1Q06336 CCA1YER168C 1641 nt10.6□□□□□ -0.71
GGA1Q06336 YAT1YAR035W 2064 nt10.59□□□□□ -0.71
GGA1Q06336 SFP1YLR403W 2052 nt10.59□□□□□ -0.71
GGA1Q06336 GID7YCL039W 2238 nt10.58□□□□□ -0.72
GGA1Q06336 FUR4YBR021W 1902 nt10.57□□□□□ -0.72
GGA1Q06336 PTH1YHR189W 573 nt10.57□□□□□ -0.72
GGA1Q06336 BNA2YJR078W 1362 nt10.56□□□□□ -0.72
GGA1Q06336 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.55□□□□□ -0.72
GGA1Q06336 NPP1YCR026C 2229 nt10.55□□□□□ -0.72
GGA1Q06336 AQY1YPR192W 918 nt10.53□□□□□ -0.72
GGA1Q06336 YLR235CYLR235C 399 nt10.5□□□□□ -0.73
GGA1Q06336 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.49□□□□□ -0.73
GGA1Q06336 TIM23YNR017W 669 nt10.49□□□□□ -0.73
GGA1Q06336 ANP1YEL036C 1503 nt10.48□□□□□ -0.73
GGA1Q06336 YLR179CYLR179C 606 nt10.48□□□□□ -0.73
GGA1Q06336 STB1YNL309W 1263 nt10.47□□□□□ -0.73
GGA1Q06336 SPP1YPL138C 1062 nt10.47□□□□□ -0.73
GGA1Q06336 DUS1YML080W 1272 nt10.45□□□□□ -0.74
GGA1Q06336 GPI16YHR188C 1833 nt10.43□□□□□ -0.74
GGA1Q06336 Q0182Q0182 405 nt10.43□□□□□ -0.74
GGA1Q06336 PRP4YPR178W 1398 nt10.42□□□□□ -0.74
GGA1Q06336 FEN2YCR028C 1539 nt10.42□□□□□ -0.74
GGA1Q06336 SPC25YER018C 666 nt10.41□□□□□ -0.74
GGA1Q06336 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.39□□□□□ -0.75
GGA1Q06336 YEL076CYEL076C 651 nt10.39□□□□□ -0.75
GGA1Q06336 YLR464WYLR464W 651 nt10.39□□□□□ -0.75
GGA1Q06336 MIC12YBR262C 321 nt10.39□□□□□ -0.75
GGA1Q06336 BMT6YLR063W 1098 nt10.38□□□□□ -0.75
GGA1Q06336 HHO1YPL127C 777 nt10.38□□□□□ -0.75
GGA1Q06336 VPS60YDR486C 690 nt10.36□□□□□ -0.75
GGA1Q06336 SWC5YBR231C 912 nt10.36□□□□□ -0.75
GGA1Q06336 DPS1YLL018C 1674 nt10.34□□□□□ -0.75
GGA1Q06336 YKL030WYKL030W 606 nt10.34□□□□□ -0.75
GGA1Q06336 AAC1YMR056C 930 nt10.34□□□□□ -0.75
GGA1Q06336 AGP1YCL025C 1902 nt10.34□□□□□ -0.75
GGA1Q06336 CCT4YDL143W 1587 nt10.34□□□□□ -0.75
GGA1Q06336 MOT3YMR070W 1473 nt10.33□□□□□ -0.76
GGA1Q06336 YCL074WYCL074W 927 nt10.32□□□□□ -0.76
GGA1Q06336 YIR016WYIR016W 798 nt10.32□□□□□ -0.76
GGA1Q06336 CYT2YKL087C 675 nt10.32□□□□□ -0.76
GGA1Q06336 WSC2YNL283C 1512 nt10.32□□□□□ -0.76
GGA1Q06336 YKR005CYKR005C 1578 nt10.31□□□□□ -0.76
GGA1Q06336 YPR064WYPR064W 420 nt10.31□□□□□ -0.76
GGA1Q06336 PBP1YGR178C 2169 nt10.31□□□□□ -0.76
GGA1Q06336 AHT1YHR093W 549 nt10.29□□□□□ -0.76
GGA1Q06336 ALG3YBL082C 1377 nt10.28□□□□□ -0.76
GGA1Q06336 ESBP6YNL125C 2022 nt10.27□□□□□ -0.77
GGA1Q06336 YGR201CYGR201C 678 nt10.26□□□□□ -0.77
GGA1Q06336 FRE6YLL051C 2139 nt10.25□□□□□ -0.77
GGA1Q06336 YGR259CYGR259C 441 nt10.24□□□□□ -0.77
GGA1Q06336 HMG2YLR450W 3138 nt10.24□□□□□ -0.77
GGA1Q06336 TPO4YOR273C 1980 nt10.22□□□□□ -0.77
GGA1Q06336 MAE1YKL029C 2010 nt10.22□□□□□ -0.77
GGA1Q06336 XDJ1YLR090W 1380 nt10.19□□□□□ -0.78
GGA1Q06336 TAD3YLR316C 969 nt10.19□□□□□ -0.78
GGA1Q06336 AVT6YER119C 1347 nt10.17□□□□□ -0.78
GGA1Q06336 AQY2YLL052C 450 nt10.17□□□□□ -0.78
GGA1Q06336 BIO5YNR056C 1686 nt10.17□□□□□ -0.78
GGA1Q06336 GOR1YNL274C 1053 nt10.16□□□□□ -0.78
GGA1Q06336 ILV2YMR108W 2064 nt10.16□□□□□ -0.78
GGA1Q06336 DUT1YBR252W 444 nt10.15□□□□□ -0.78
GGA1Q06336 UGA4YDL210W 1716 nt10.15□□□□□ -0.78
GGA1Q06336 SNF1YDR477W 1902 nt10.15□□□□□ -0.79
GGA1Q06336 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.13□□□□□ -0.79
GGA1Q06336 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.13□□□□□ -0.79
GGA1Q06336 GDH3YAL062W 1374 nt10.13□□□□□ -0.79
GGA1Q06336 RIM8YGL045W 1629 nt10.12□□□□□ -0.79
GGA1Q06336 IRC24YIR036C 792 nt10.12□□□□□ -0.79
GGA1Q06336 STR3YGL184C 1398 nt10.12□□□□□ -0.79
GGA1Q06336 URA8YJR103W 1737 nt10.11□□□□□ -0.79
GGA1Q06336 BSP1YPR171W 1731 nt10.1□□□□□ -0.79
GGA1Q06336 YLR415CYLR415C 339 nt10.09□□□□□ -0.79
GGA1Q06336 NDI1YML120C 1542 nt10.08□□□□□ -0.8
GGA1Q06336 DTR1YBR180W 1719 nt10.07□□□□□ -0.8
GGA1Q06336 GTB1YDR221W 2109 nt10.06□□□□□ -0.8
GGA1Q06336 UBX6YJL048C 1191 nt10.06□□□□□ -0.8
GGA1Q06336 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.04□□□□□ -0.8
GGA1Q06336 BDH1YAL060W 1149 nt10.04□□□□□ -0.8
GGA1Q06336 RTG1YOL067C 534 nt10.04□□□□□ -0.8
GGA1Q06336 RTN2YDL204W 1182 nt10.03□□□□□ -0.8
GGA1Q06336 TIM17YJL143W 477 nt10.03□□□□□ -0.8
GGA1Q06336 SHM2YLR058C 1410 nt10.03□□□□□ -0.8
GGA1Q06336 RFC1YOR217W 2586 nt10.01□□□□□ -0.81
GGA1Q06336 YGL114WYGL114W 2178 nt9.97□□□□□ -0.81
GGA1Q06336 GAL2YLR081W 1725 nt9.96□□□□□ -0.82
GGA1Q06336 HUA1YGR268C 597 nt9.95□□□□□ -0.82
GGA1Q06336 ACO2YJL200C 2370 nt9.94□□□□□ -0.82
GGA1Q06336 YSP3YOR003W 1437 nt9.91□□□□□ -0.82
GGA1Q06336 DAT1YML113W 747 nt9.9□□□□□ -0.82
GGA1Q06336 NIT1YIL164C 600 nt9.89□□□□□ -0.83
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