Protein–RNA interactions for Protein: Q06063

DUS4, tRNA-dihydrouridine(20a/20b) synthase [NAD(P)+], yeastyeast

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DUS4Q06063 GLK1YCL040W 1503 nt12.17□□□□□ -0.46
DUS4Q06063 SEC11YIR022W 504 nt12.17□□□□□ -0.46
DUS4Q06063 YLR415CYLR415C 339 nt12.16□□□□□ -0.46
DUS4Q06063 PCH2YBR186W 1695 nt12.16□□□□□ -0.46
DUS4Q06063 MSF1YPR047W 1410 nt12.14□□□□□ -0.47
DUS4Q06063 TRM5YHR070W 1500 nt12.13□□□□□ -0.47
DUS4Q06063 SIM1YIL123W 1431 nt12.12□□□□□ -0.47
DUS4Q06063 MIR1YJR077C 936 nt12.12□□□□□ -0.47
DUS4Q06063 GUT2YIL155C 1950 nt12.11□□□□□ -0.47
DUS4Q06063 SPC25YER018C 666 nt12.1□□□□□ -0.47
DUS4Q06063 STB1YNL309W 1263 nt12.1□□□□□ -0.47
DUS4Q06063 CCT4YDL143W 1587 nt12.09□□□□□ -0.47
DUS4Q06063 THI74YDR438W 1113 nt12.09□□□□□ -0.47
DUS4Q06063 NCP1YHR042W 2076 nt12.04□□□□□ -0.48
DUS4Q06063 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt12.04□□□□□ -0.48
DUS4Q06063 YMR244WYMR244W 1068 nt12.04□□□□□ -0.48
DUS4Q06063 VPS75YNL246W 795 nt12.03□□□□□ -0.48
DUS4Q06063 PIB2YGL023C 1908 nt12.03□□□□□ -0.48
DUS4Q06063 ATF2YGR177C 1608 nt12.02□□□□□ -0.49
DUS4Q06063 GPI16YHR188C 1833 nt12.02□□□□□ -0.49
DUS4Q06063 VPS60YDR486C 690 nt12.01□□□□□ -0.49
DUS4Q06063 SWC5YBR231C 912 nt11.99□□□□□ -0.49
DUS4Q06063 ALG3YBL082C 1377 nt11.98□□□□□ -0.49
DUS4Q06063 DDR2YOL052C-A 186 nt11.98□□□□□ -0.49
DUS4Q06063 YFL067WYFL067W 528 nt11.95□□□□□ -0.5
DUS4Q06063 DAT1YML113W 747 nt11.94□□□□□ -0.5
DUS4Q06063 SPT8YLR055C 1809 nt11.93□□□□□ -0.5
DUS4Q06063 ERF2YLR246W 1080 nt11.93□□□□□ -0.5
DUS4Q06063 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.92□□□□□ -0.5
DUS4Q06063 RTF1YGL244W 1677 nt11.91□□□□□ -0.5
DUS4Q06063 FEN2YCR028C 1539 nt11.91□□□□□ -0.5
DUS4Q06063 CRR1YLR213C 1269 nt11.9□□□□□ -0.5
DUS4Q06063 GLR1YPL091W 1452 nt11.89□□□□□ -0.51
DUS4Q06063 ANP1YEL036C 1503 nt11.89□□□□□ -0.51
DUS4Q06063 BOP3YNL042W 1191 nt11.87□□□□□ -0.51
DUS4Q06063 LYS4YDR234W 2082 nt11.87□□□□□ -0.51
DUS4Q06063 YGL034CYGL034C 366 nt11.86□□□□□ -0.51
DUS4Q06063 PAU7YAR020C 168 nt11.83□□□□□ -0.52
DUS4Q06063 UBA4YHR111W 1323 nt11.83□□□□□ -0.52
DUS4Q06063 SNG1YGR197C 1644 nt11.82□□□□□ -0.52
DUS4Q06063 PTK1YKL198C 1989 nt11.81□□□□□ -0.52
DUS4Q06063 RBG2YGR173W 1107 nt11.79□□□□□ -0.52
DUS4Q06063 YIR016WYIR016W 798 nt11.79□□□□□ -0.52
DUS4Q06063 SHB17YKR043C 816 nt11.78□□□□□ -0.52
DUS4Q06063 MIC10YCL057C-A 294 nt11.77□□□□□ -0.53
DUS4Q06063 TIM17YJL143W 477 nt11.76□□□□□ -0.53
DUS4Q06063 HEM12YDR047W 1089 nt11.75□□□□□ -0.53
DUS4Q06063 YSR3YKR053C 1215 nt11.74□□□□□ -0.53
DUS4Q06063 NDI1YML120C 1542 nt11.74□□□□□ -0.53
DUS4Q06063 XYL2YLR070C 1071 nt11.71□□□□□ -0.53
DUS4Q06063 YDR010CYDR010C 333 nt11.7□□□□□ -0.54
DUS4Q06063 RBG1YAL036C 1110 nt11.7□□□□□ -0.54
DUS4Q06063 SHM2YLR058C 1410 nt11.69□□□□□ -0.54
DUS4Q06063 Q0182Q0182 405 nt11.63□□□□□ -0.55
DUS4Q06063 XDJ1YLR090W 1380 nt11.63□□□□□ -0.55
DUS4Q06063 NIT1YIL164C 600 nt11.62□□□□□ -0.55
DUS4Q06063 SGT2YOR007C 1041 nt11.62□□□□□ -0.55
DUS4Q06063 RET2YFR051C 1641 nt11.6□□□□□ -0.55
DUS4Q06063 PHO89YBR296C 1725 nt11.58□□□□□ -0.56
DUS4Q06063 YCR087WYCR087W 516 nt11.56□□□□□ -0.56
DUS4Q06063 AIM45YPR004C 1035 nt11.56□□□□□ -0.56
DUS4Q06063 YFL054CYFL054C 1941 nt11.55□□□□□ -0.56
DUS4Q06063 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.55□□□□□ -0.56
DUS4Q06063 YMR226CYMR226C 804 nt11.54□□□□□ -0.56
DUS4Q06063 MIC12YBR262C 321 nt11.52□□□□□ -0.57
DUS4Q06063 GDH3YAL062W 1374 nt11.52□□□□□ -0.57
DUS4Q06063 SAM1YLR180W 1149 nt11.5□□□□□ -0.57
DUS4Q06063 BNA2YJR078W 1362 nt11.49□□□□□ -0.57
DUS4Q06063 COQ2YNR041C 1119 nt11.44□□□□□ -0.58
DUS4Q06063 MRP20YDR405W 792 nt11.42□□□□□ -0.58
DUS4Q06063 RAX1YOR301W 1308 nt11.41□□□□□ -0.58
DUS4Q06063 YGR201CYGR201C 678 nt11.41□□□□□ -0.58
DUS4Q06063 RAD51YER095W 1203 nt11.4□□□□□ -0.58
DUS4Q06063 HHO1YPL127C 777 nt11.38□□□□□ -0.59
DUS4Q06063 SFA1YDL168W 1161 nt11.37□□□□□ -0.59
DUS4Q06063 YLR111WYLR111W 333 nt11.35□□□□□ -0.59
DUS4Q06063 AVT6YER119C 1347 nt11.35□□□□□ -0.59
DUS4Q06063 SWE1YJL187C 2460 nt11.33□□□□□ -0.6
DUS4Q06063 CCA1YER168C 1641 nt11.3□□□□□ -0.6
DUS4Q06063 AGP1YCL025C 1902 nt11.29□□□□□ -0.6
DUS4Q06063 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt11.28□□□□□ -0.6
DUS4Q06063 RPL4BYDR012W 1089 nt11.27□□□□□ -0.61
DUS4Q06063 RPL4AYBR031W 1089 nt11.27□□□□□ -0.61
DUS4Q06063 YCR102CYCR102C 1107 nt11.26□□□□□ -0.61
DUS4Q06063 GOR1YNL274C 1053 nt11.25□□□□□ -0.61
DUS4Q06063 DUT1YBR252W 444 nt11.24□□□□□ -0.61
DUS4Q06063 RPS14BYJL191W 417 nt11.23□□□□□ -0.61
DUS4Q06063 RPM1RPM1 483 nt11.23□□□□□ -0.61
DUS4Q06063 CAB5YDR196C 726 nt11.22□□□□□ -0.61
DUS4Q06063 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt11.22□□□□□ -0.61
DUS4Q06063 SDH5YOL071W 489 nt11.22□□□□□ -0.61
DUS4Q06063 RAD23YEL037C 1197 nt11.2□□□□□ -0.62
DUS4Q06063 SHH4YLR164W 507 nt11.19□□□□□ -0.62
DUS4Q06063 YNR029CYNR029C 1290 nt11.19□□□□□ -0.62
DUS4Q06063 YLR349WYLR349W 507 nt11.18□□□□□ -0.62
DUS4Q06063 CLB6YGR109C 1143 nt11.17□□□□□ -0.62
DUS4Q06063 STE4YOR212W 1272 nt11.17□□□□□ -0.62
DUS4Q06063 UTH1YKR042W 1098 nt11.13□□□□□ -0.63
DUS4Q06063 NBP35YGL091C 987 nt11.12□□□□□ -0.63
DUS4Q06063 TIR3YIL011W 810 nt11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 58.5 ms