Protein–RNA interactions for Protein: Q05016

YMR226C, NADP-dependent 3-hydroxy acid dehydrogenase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR226CQ05016 SNG1YGR197C 1644 nt10.45□□□□□ -0.74
YMR226CQ05016 DPS1YLL018C 1674 nt10.43□□□□□ -0.74
YMR226CQ05016 FRD1YEL047C 1413 nt10.42□□□□□ -0.74
YMR226CQ05016 YKR040CYKR040C 504 nt10.42□□□□□ -0.74
YMR226CQ05016 FTR1YER145C 1215 nt10.41□□□□□ -0.74
YMR226CQ05016 LPX1YOR084W 1164 nt10.41□□□□□ -0.74
YMR226CQ05016 BMT6YLR063W 1098 nt10.4□□□□□ -0.74
YMR226CQ05016 DDR2YOL052C-A 186 nt10.37□□□□□ -0.75
YMR226CQ05016 GAL1YBR020W 1587 nt10.35□□□□□ -0.75
YMR226CQ05016 TRM5YHR070W 1500 nt10.35□□□□□ -0.75
YMR226CQ05016 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.34□□□□□ -0.75
YMR226CQ05016 NAR1YNL240C 1476 nt10.34□□□□□ -0.75
YMR226CQ05016 YKR005CYKR005C 1578 nt10.34□□□□□ -0.75
YMR226CQ05016 WSC2YNL283C 1512 nt10.33□□□□□ -0.76
YMR226CQ05016 BNA2YJR078W 1362 nt10.32□□□□□ -0.76
YMR226CQ05016 DIC1YLR348C 897 nt10.3□□□□□ -0.76
YMR226CQ05016 ANP1YEL036C 1503 nt10.29□□□□□ -0.76
YMR226CQ05016 YCL074WYCL074W 927 nt10.27□□□□□ -0.77
YMR226CQ05016 AQY1YPR192W 918 nt10.27□□□□□ -0.77
YMR226CQ05016 MIC12YBR262C 321 nt10.27□□□□□ -0.77
YMR226CQ05016 BIO5YNR056C 1686 nt10.25□□□□□ -0.77
YMR226CQ05016 SNF1YDR477W 1902 nt10.24□□□□□ -0.77
YMR226CQ05016 YGR259CYGR259C 441 nt10.23□□□□□ -0.77
YMR226CQ05016 IRC24YIR036C 792 nt10.23□□□□□ -0.77
YMR226CQ05016 DUS1YML080W 1272 nt10.23□□□□□ -0.77
YMR226CQ05016 AGP1YCL025C 1902 nt10.21□□□□□ -0.77
YMR226CQ05016 PBP1YGR178C 2169 nt10.2□□□□□ -0.78
YMR226CQ05016 CYT2YKL087C 675 nt10.2□□□□□ -0.78
YMR226CQ05016 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.17□□□□□ -0.78
YMR226CQ05016 SPC25YER018C 666 nt10.17□□□□□ -0.78
YMR226CQ05016 STB1YNL309W 1263 nt10.17□□□□□ -0.78
YMR226CQ05016 HHO1YPL127C 777 nt10.17□□□□□ -0.78
YMR226CQ05016 FEN2YCR028C 1539 nt10.17□□□□□ -0.78
YMR226CQ05016 GPI16YHR188C 1833 nt10.14□□□□□ -0.79
YMR226CQ05016 YGR201CYGR201C 678 nt10.1□□□□□ -0.79
YMR226CQ05016 PTH1YHR189W 573 nt10.09□□□□□ -0.79
YMR226CQ05016 YIR016WYIR016W 798 nt10.09□□□□□ -0.79
YMR226CQ05016 YLR235CYLR235C 399 nt10.08□□□□□ -0.8
YMR226CQ05016 TIM23YNR017W 669 nt10.08□□□□□ -0.8
YMR226CQ05016 XDJ1YLR090W 1380 nt10.05□□□□□ -0.8
YMR226CQ05016 YLR179CYLR179C 606 nt10.05□□□□□ -0.8
YMR226CQ05016 VPS60YDR486C 690 nt10.04□□□□□ -0.8
YMR226CQ05016 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.03□□□□□ -0.8
YMR226CQ05016 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.03□□□□□ -0.8
YMR226CQ05016 STR3YGL184C 1398 nt10.02□□□□□ -0.8
YMR226CQ05016 CCT4YDL143W 1587 nt10.02□□□□□ -0.81
YMR226CQ05016 SPP1YPL138C 1062 nt10.02□□□□□ -0.81
YMR226CQ05016 CMP2YML057W 1815 nt10□□□□□ -0.81
YMR226CQ05016 RPM1RPM1 483 nt10□□□□□ -0.81
YMR226CQ05016 AHT1YHR093W 549 nt9.99□□□□□ -0.81
YMR226CQ05016 SWC5YBR231C 912 nt9.97□□□□□ -0.81
YMR226CQ05016 ALG3YBL082C 1377 nt9.97□□□□□ -0.81
YMR226CQ05016 MOT3YMR070W 1473 nt9.96□□□□□ -0.82
YMR226CQ05016 RTN2YDL204W 1182 nt9.95□□□□□ -0.82
YMR226CQ05016 YKL030WYKL030W 606 nt9.92□□□□□ -0.82
YMR226CQ05016 GOR1YNL274C 1053 nt9.92□□□□□ -0.82
YMR226CQ05016 DUT1YBR252W 444 nt9.92□□□□□ -0.82
YMR226CQ05016 AQY2YLL052C 450 nt9.91□□□□□ -0.82
YMR226CQ05016 AVT6YER119C 1347 nt9.89□□□□□ -0.83
YMR226CQ05016 NDI1YML120C 1542 nt9.89□□□□□ -0.83
YMR226CQ05016 YPR064WYPR064W 420 nt9.89□□□□□ -0.83
YMR226CQ05016 YAT1YAR035W 2064 nt9.87□□□□□ -0.83
YMR226CQ05016 GDH3YAL062W 1374 nt9.86□□□□□ -0.83
YMR226CQ05016 TAD3YLR316C 969 nt9.83□□□□□ -0.84
YMR226CQ05016 HSL7YBR133C 2484 nt9.78□□□□□ -0.84
YMR226CQ05016 SPT20YOL148C 1815 nt9.76□□□□□ -0.85
YMR226CQ05016 BDH1YAL060W 1149 nt9.73□□□□□ -0.85
YMR226CQ05016 SHM2YLR058C 1410 nt9.72□□□□□ -0.85
YMR226CQ05016 INA1YLR413W 2028 nt9.72□□□□□ -0.85
YMR226CQ05016 DAT1YML113W 747 nt9.71□□□□□ -0.86
YMR226CQ05016 PLB1YMR008C 1995 nt9.7□□□□□ -0.86
YMR226CQ05016 HIF1YLL022C 1158 nt9.7□□□□□ -0.86
YMR226CQ05016 ARP6YLR085C 1317 nt9.7□□□□□ -0.86
YMR226CQ05016 ALD4YOR374W 1560 nt9.7□□□□□ -0.86
YMR226CQ05016 YLR415CYLR415C 339 nt9.69□□□□□ -0.86
YMR226CQ05016 TIM17YJL143W 477 nt9.68□□□□□ -0.86
YMR226CQ05016 RTG1YOL067C 534 nt9.67□□□□□ -0.86
YMR226CQ05016 RPC82YPR190C 1965 nt9.66□□□□□ -0.86
YMR226CQ05016 NBP35YGL091C 987 nt9.65□□□□□ -0.86
YMR226CQ05016 PRM5YIL117C 957 nt9.64□□□□□ -0.87
YMR226CQ05016 YCR102CYCR102C 1107 nt9.63□□□□□ -0.87
YMR226CQ05016 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.62□□□□□ -0.87
YMR226CQ05016 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.61□□□□□ -0.87
YMR226CQ05016 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.61□□□□□ -0.87
YMR226CQ05016 YSP3YOR003W 1437 nt9.6□□□□□ -0.87
YMR226CQ05016 NIT1YIL164C 600 nt9.6□□□□□ -0.87
YMR226CQ05016 ZRT3YKL175W 1512 nt9.56□□□□□ -0.88
YMR226CQ05016 SAM35YHR083W 990 nt9.54□□□□□ -0.88
YMR226CQ05016 UTR1YJR049C 1593 nt9.53□□□□□ -0.88
YMR226CQ05016 SGT2YOR007C 1041 nt9.52□□□□□ -0.89
YMR226CQ05016 LSC2YGR244C 1284 nt9.5□□□□□ -0.89
YMR226CQ05016 HUA1YGR268C 597 nt9.48□□□□□ -0.89
YMR226CQ05016 GAP1YKR039W 1809 nt9.47□□□□□ -0.89
YMR226CQ05016 HEL2YDR266C 1920 nt9.47□□□□□ -0.89
YMR226CQ05016 YNL115CYNL115C 1935 nt9.46□□□□□ -0.89
YMR226CQ05016 TIR3YIL011W 810 nt9.46□□□□□ -0.9
YMR226CQ05016 RIM8YGL045W 1629 nt9.45□□□□□ -0.9
YMR226CQ05016 YGL114WYGL114W 2178 nt9.43□□□□□ -0.9
YMR226CQ05016 PEX25YPL112C 1185 nt9.42□□□□□ -0.9
YMR226CQ05016 MUP1YGR055W 1725 nt9.41□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.8 ms