Protein–RNA interactions for Protein: Q04174

SMP3, GPI mannosyltransferase 4, yeastyeast

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMP3Q04174 LPX1YOR084W 1164 nt10.35□□□□□ -0.75
SMP3Q04174 SNG1YGR197C 1644 nt10.35□□□□□ -0.75
SMP3Q04174 FRD1YEL047C 1413 nt10.33□□□□□ -0.76
SMP3Q04174 YJL225CYJL225C 5277 nt10.33□□□□□ -0.76
SMP3Q04174 RNQ1YCL028W 1218 nt10.33□□□□□ -0.76
SMP3Q04174 YKR005CYKR005C 1578 nt10.31□□□□□ -0.76
SMP3Q04174 PBP1YGR178C 2169 nt10.31□□□□□ -0.76
SMP3Q04174 YKR040CYKR040C 504 nt10.3□□□□□ -0.76
SMP3Q04174 BMT6YLR063W 1098 nt10.27□□□□□ -0.77
SMP3Q04174 FTR1YER145C 1215 nt10.24□□□□□ -0.77
SMP3Q04174 YFL067WYFL067W 528 nt10.23□□□□□ -0.77
SMP3Q04174 CYT2YKL087C 675 nt10.23□□□□□ -0.77
SMP3Q04174 AGP1YCL025C 1902 nt10.23□□□□□ -0.77
SMP3Q04174 TRM5YHR070W 1500 nt10.22□□□□□ -0.77
SMP3Q04174 WSC2YNL283C 1512 nt10.22□□□□□ -0.77
SMP3Q04174 GAL1YBR020W 1587 nt10.22□□□□□ -0.77
SMP3Q04174 DIC1YLR348C 897 nt10.21□□□□□ -0.77
SMP3Q04174 YGR259CYGR259C 441 nt10.17□□□□□ -0.78
SMP3Q04174 DDR2YOL052C-A 186 nt10.16□□□□□ -0.78
SMP3Q04174 DUS1YML080W 1272 nt10.15□□□□□ -0.78
SMP3Q04174 YCL074WYCL074W 927 nt10.14□□□□□ -0.79
SMP3Q04174 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.14□□□□□ -0.79
SMP3Q04174 ANP1YEL036C 1503 nt10.12□□□□□ -0.79
SMP3Q04174 IRC24YIR036C 792 nt10.12□□□□□ -0.79
SMP3Q04174 MIC12YBR262C 321 nt10.11□□□□□ -0.79
SMP3Q04174 BNA2YJR078W 1362 nt10.11□□□□□ -0.79
SMP3Q04174 CMP2YML057W 1815 nt10.1□□□□□ -0.79
SMP3Q04174 YAT1YAR035W 2064 nt10.06□□□□□ -0.8
SMP3Q04174 AQY1YPR192W 918 nt10.06□□□□□ -0.8
SMP3Q04174 HSL7YBR133C 2484 nt10.05□□□□□ -0.8
SMP3Q04174 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.04□□□□□ -0.8
SMP3Q04174 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.04□□□□□ -0.8
SMP3Q04174 PTH1YHR189W 573 nt10.03□□□□□ -0.8
SMP3Q04174 STB1YNL309W 1263 nt10.03□□□□□ -0.8
SMP3Q04174 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.02□□□□□ -0.81
SMP3Q04174 HHO1YPL127C 777 nt10.01□□□□□ -0.81
SMP3Q04174 SPC25YER018C 666 nt10□□□□□ -0.81
SMP3Q04174 XDJ1YLR090W 1380 nt10□□□□□ -0.81
SMP3Q04174 FEN2YCR028C 1539 nt9.99□□□□□ -0.81
SMP3Q04174 TIM23YNR017W 669 nt9.99□□□□□ -0.81
SMP3Q04174 SPP1YPL138C 1062 nt9.98□□□□□ -0.81
SMP3Q04174 YLR179CYLR179C 606 nt9.97□□□□□ -0.81
SMP3Q04174 YLR235CYLR235C 399 nt9.97□□□□□ -0.81
SMP3Q04174 DUT1YBR252W 444 nt9.97□□□□□ -0.81
SMP3Q04174 STR3YGL184C 1398 nt9.96□□□□□ -0.82
SMP3Q04174 GPI16YHR188C 1833 nt9.96□□□□□ -0.82
SMP3Q04174 VPS60YDR486C 690 nt9.92□□□□□ -0.82
SMP3Q04174 YIR016WYIR016W 798 nt9.92□□□□□ -0.82
SMP3Q04174 ALG3YBL082C 1377 nt9.89□□□□□ -0.83
SMP3Q04174 CCT4YDL143W 1587 nt9.89□□□□□ -0.83
SMP3Q04174 NDI1YML120C 1542 nt9.88□□□□□ -0.83
SMP3Q04174 AHT1YHR093W 549 nt9.88□□□□□ -0.83
SMP3Q04174 YGR201CYGR201C 678 nt9.86□□□□□ -0.83
SMP3Q04174 AQY2YLL052C 450 nt9.85□□□□□ -0.83
SMP3Q04174 SWC5YBR231C 912 nt9.83□□□□□ -0.84
SMP3Q04174 YKL030WYKL030W 606 nt9.82□□□□□ -0.84
SMP3Q04174 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.8□□□□□ -0.84
SMP3Q04174 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.8□□□□□ -0.84
SMP3Q04174 GDH3YAL062W 1374 nt9.78□□□□□ -0.84
SMP3Q04174 SPT20YOL148C 1815 nt9.78□□□□□ -0.84
SMP3Q04174 RTN2YDL204W 1182 nt9.78□□□□□ -0.84
SMP3Q04174 YPR064WYPR064W 420 nt9.78□□□□□ -0.84
SMP3Q04174 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.77□□□□□ -0.85
SMP3Q04174 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.77□□□□□ -0.85
SMP3Q04174 RPC82YPR190C 1965 nt9.76□□□□□ -0.85
SMP3Q04174 AVT6YER119C 1347 nt9.76□□□□□ -0.85
SMP3Q04174 TAD3YLR316C 969 nt9.72□□□□□ -0.85
SMP3Q04174 GOR1YNL274C 1053 nt9.72□□□□□ -0.85
SMP3Q04174 HEL2YDR266C 1920 nt9.7□□□□□ -0.86
SMP3Q04174 HIF1YLL022C 1158 nt9.68□□□□□ -0.86
SMP3Q04174 INA1YLR413W 2028 nt9.68□□□□□ -0.86
SMP3Q04174 BDH1YAL060W 1149 nt9.65□□□□□ -0.86
SMP3Q04174 PRM5YIL117C 957 nt9.64□□□□□ -0.87
SMP3Q04174 PLB1YMR008C 1995 nt9.64□□□□□ -0.87
SMP3Q04174 RIM8YGL045W 1629 nt9.61□□□□□ -0.87
SMP3Q04174 SHM2YLR058C 1410 nt9.61□□□□□ -0.87
SMP3Q04174 ALD4YOR374W 1560 nt9.59□□□□□ -0.87
SMP3Q04174 YLR415CYLR415C 339 nt9.59□□□□□ -0.87
SMP3Q04174 RTG1YOL067C 534 nt9.58□□□□□ -0.88
SMP3Q04174 MUP1YGR055W 1725 nt9.57□□□□□ -0.88
SMP3Q04174 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.53□□□□□ -0.88
SMP3Q04174 TIM17YJL143W 477 nt9.53□□□□□ -0.88
SMP3Q04174 DAT1YML113W 747 nt9.53□□□□□ -0.88
SMP3Q04174 ARP6YLR085C 1317 nt9.52□□□□□ -0.89
SMP3Q04174 YSP3YOR003W 1437 nt9.51□□□□□ -0.89
SMP3Q04174 NBP35YGL091C 987 nt9.51□□□□□ -0.89
SMP3Q04174 NIT1YIL164C 600 nt9.51□□□□□ -0.89
SMP3Q04174 YGL114WYGL114W 2178 nt9.5□□□□□ -0.89
SMP3Q04174 HOL1YNR055C 1761 nt9.47□□□□□ -0.89
SMP3Q04174 UTR1YJR049C 1593 nt9.46□□□□□ -0.89
SMP3Q04174 SGT2YOR007C 1041 nt9.45□□□□□ -0.9
SMP3Q04174 YCR102CYCR102C 1107 nt9.43□□□□□ -0.9
SMP3Q04174 ZRT3YKL175W 1512 nt9.41□□□□□ -0.9
SMP3Q04174 YJL067WYJL067W 351 nt9.4□□□□□ -0.9
SMP3Q04174 YNL115CYNL115C 1935 nt9.39□□□□□ -0.91
SMP3Q04174 MAE1YKL029C 2010 nt9.38□□□□□ -0.91
SMP3Q04174 HUA1YGR268C 597 nt9.37□□□□□ -0.91
SMP3Q04174 PEX25YPL112C 1185 nt9.34□□□□□ -0.91
SMP3Q04174 YNL024CYNL024C 741 nt9.33□□□□□ -0.92
SMP3Q04174 GAP1YKR039W 1809 nt9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 43.4 ms