Protein–RNA interactions for Protein: Q02959

HOS3, Histone deacetylase HOS3, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HOS3Q02959 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.84□□□□□ -0.51
HOS3Q02959 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.84□□□□□ -0.51
HOS3Q02959 YFL067WYFL067W 528 nt11.84□□□□□ -0.51
HOS3Q02959 FTR1YER145C 1215 nt11.8□□□□□ -0.52
HOS3Q02959 PBP1YGR178C 2169 nt11.79□□□□□ -0.52
HOS3Q02959 IMP2'YIL154C 1041 nt11.79□□□□□ -0.52
HOS3Q02959 WSC2YNL283C 1512 nt11.78□□□□□ -0.52
HOS3Q02959 TRM5YHR070W 1500 nt11.77□□□□□ -0.52
HOS3Q02959 FMP45YDL222C 930 nt11.77□□□□□ -0.53
HOS3Q02959 GAL1YBR020W 1587 nt11.76□□□□□ -0.53
HOS3Q02959 PUS2YGL063W 1113 nt11.75□□□□□ -0.53
HOS3Q02959 DDR2YOL052C-A 186 nt11.75□□□□□ -0.53
HOS3Q02959 CYT2YKL087C 675 nt11.74□□□□□ -0.53
HOS3Q02959 FRD1YEL047C 1413 nt11.73□□□□□ -0.53
HOS3Q02959 AGP1YCL025C 1902 nt11.73□□□□□ -0.53
HOS3Q02959 YGR259CYGR259C 441 nt11.71□□□□□ -0.53
HOS3Q02959 BNA2YJR078W 1362 nt11.7□□□□□ -0.54
HOS3Q02959 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.7□□□□□ -0.54
HOS3Q02959 DUS1YML080W 1272 nt11.7□□□□□ -0.54
HOS3Q02959 YCL074WYCL074W 927 nt11.69□□□□□ -0.54
HOS3Q02959 ANP1YEL036C 1503 nt11.68□□□□□ -0.54
HOS3Q02959 IRC24YIR036C 792 nt11.67□□□□□ -0.54
HOS3Q02959 YPR011CYPR011C 981 nt11.67□□□□□ -0.54
HOS3Q02959 DIC1YLR348C 897 nt11.66□□□□□ -0.54
HOS3Q02959 MIC12YBR262C 321 nt11.66□□□□□ -0.54
HOS3Q02959 ERV46YAL042W 1248 nt11.62□□□□□ -0.55
HOS3Q02959 YKR040CYKR040C 504 nt11.61□□□□□ -0.55
HOS3Q02959 LPX1YOR084W 1164 nt11.61□□□□□ -0.55
HOS3Q02959 CMP2YML057W 1815 nt11.58□□□□□ -0.56
HOS3Q02959 HHO1YPL127C 777 nt11.56□□□□□ -0.56
HOS3Q02959 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.53□□□□□ -0.56
HOS3Q02959 AQY1YPR192W 918 nt11.53□□□□□ -0.56
HOS3Q02959 FEN2YCR028C 1539 nt11.52□□□□□ -0.57
HOS3Q02959 STB1YNL309W 1263 nt11.52□□□□□ -0.57
HOS3Q02959 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.51□□□□□ -0.57
HOS3Q02959 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.51□□□□□ -0.57
HOS3Q02959 SPC25YER018C 666 nt11.49□□□□□ -0.57
HOS3Q02959 MRPL8YJL063C 717 nt11.49□□□□□ -0.57
HOS3Q02959 YAT1YAR035W 2064 nt11.48□□□□□ -0.57
HOS3Q02959 XDJ1YLR090W 1380 nt11.48□□□□□ -0.57
HOS3Q02959 STR3YGL184C 1398 nt11.46□□□□□ -0.57
HOS3Q02959 YIR016WYIR016W 798 nt11.45□□□□□ -0.58
HOS3Q02959 HSL7YBR133C 2484 nt11.43□□□□□ -0.58
HOS3Q02959 GPI16YHR188C 1833 nt11.43□□□□□ -0.58
HOS3Q02959 DUT1YBR252W 444 nt11.42□□□□□ -0.58
HOS3Q02959 YGR201CYGR201C 678 nt11.41□□□□□ -0.58
HOS3Q02959 VPS60YDR486C 690 nt11.4□□□□□ -0.58
HOS3Q02959 NDI1YML120C 1542 nt11.36□□□□□ -0.59
HOS3Q02959 AQY2YLL052C 450 nt11.35□□□□□ -0.59
HOS3Q02959 ALG3YBL082C 1377 nt11.34□□□□□ -0.59
HOS3Q02959 YLR179CYLR179C 606 nt11.34□□□□□ -0.59
HOS3Q02959 TIM23YNR017W 669 nt11.34□□□□□ -0.59
HOS3Q02959 CCT4YDL143W 1587 nt11.33□□□□□ -0.6
HOS3Q02959 PTH1YHR189W 573 nt11.33□□□□□ -0.6
HOS3Q02959 ADO1YJR105W 1023 nt11.32□□□□□ -0.6
HOS3Q02959 RTN2YDL204W 1182 nt11.3□□□□□ -0.6
HOS3Q02959 GDH3YAL062W 1374 nt11.28□□□□□ -0.6
HOS3Q02959 UBX6YJL048C 1191 nt11.26□□□□□ -0.61
HOS3Q02959 SWC5YBR231C 912 nt11.26□□□□□ -0.61
HOS3Q02959 YLR235CYLR235C 399 nt11.25□□□□□ -0.61
HOS3Q02959 AVT6YER119C 1347 nt11.25□□□□□ -0.61
HOS3Q02959 GOR1YNL274C 1053 nt11.24□□□□□ -0.61
HOS3Q02959 SPT20YOL148C 1815 nt11.23□□□□□ -0.61
HOS3Q02959 AHT1YHR093W 549 nt11.23□□□□□ -0.61
HOS3Q02959 RPC82YPR190C 1965 nt11.18□□□□□ -0.62
HOS3Q02959 RDN25-1RDN25-1 3396 nt11.16□□□□□ -0.62
HOS3Q02959 RDN25-2RDN25-2 3396 nt11.16□□□□□ -0.62
HOS3Q02959 NME1NME1 340 nt11.15□□□□□ -0.62
HOS3Q02959 INA1YLR413W 2028 nt11.14□□□□□ -0.63
HOS3Q02959 HIF1YLL022C 1158 nt11.13□□□□□ -0.63
HOS3Q02959 SPP1YPL138C 1062 nt11.1□□□□□ -0.63
HOS3Q02959 YPR064WYPR064W 420 nt11.09□□□□□ -0.63
HOS3Q02959 PLB1YMR008C 1995 nt11.08□□□□□ -0.64
HOS3Q02959 PRM5YIL117C 957 nt11.07□□□□□ -0.64
HOS3Q02959 HEL2YDR266C 1920 nt11.07□□□□□ -0.64
HOS3Q02959 ALD4YOR374W 1560 nt11.06□□□□□ -0.64
HOS3Q02959 YKL030WYKL030W 606 nt11.03□□□□□ -0.64
HOS3Q02959 RTG1YOL067C 534 nt11.03□□□□□ -0.64
HOS3Q02959 SHM2YLR058C 1410 nt11.01□□□□□ -0.65
HOS3Q02959 RIM8YGL045W 1629 nt11□□□□□ -0.65
HOS3Q02959 TAD3YLR316C 969 nt11□□□□□ -0.65
HOS3Q02959 ARP6YLR085C 1317 nt10.99□□□□□ -0.65
HOS3Q02959 YGR139WYGR139W 339 nt10.98□□□□□ -0.65
HOS3Q02959 NBP35YGL091C 987 nt10.96□□□□□ -0.65
HOS3Q02959 DAT1YML113W 747 nt10.96□□□□□ -0.65
HOS3Q02959 MUP1YGR055W 1725 nt10.94□□□□□ -0.66
HOS3Q02959 BDH1YAL060W 1149 nt10.93□□□□□ -0.66
HOS3Q02959 HUA1YGR268C 597 nt10.92□□□□□ -0.66
HOS3Q02959 YDR094WYDR094W 336 nt10.91□□□□□ -0.66
HOS3Q02959 YGL114WYGL114W 2178 nt10.9□□□□□ -0.66
HOS3Q02959 NIT1YIL164C 600 nt10.89□□□□□ -0.67
HOS3Q02959 UTR1YJR049C 1593 nt10.89□□□□□ -0.67
HOS3Q02959 TIM17YJL143W 477 nt10.88□□□□□ -0.67
HOS3Q02959 YLR415CYLR415C 339 nt10.88□□□□□ -0.67
HOS3Q02959 ZRT3YKL175W 1512 nt10.88□□□□□ -0.67
HOS3Q02959 YCR102CYCR102C 1107 nt10.87□□□□□ -0.67
HOS3Q02959 HOL1YNR055C 1761 nt10.85□□□□□ -0.67
HOS3Q02959 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.84□□□□□ -0.67
HOS3Q02959 YJL067WYJL067W 351 nt10.8□□□□□ -0.68
HOS3Q02959 SGT2YOR007C 1041 nt10.8□□□□□ -0.68
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