Protein–RNA interactions for Protein: Q02948

VPS30, Vacuolar protein sorting-associated protein 30, yeastyeast

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS30Q02948 UME6YDR207C 2511 nt12.5□□□□□ -0.41
VPS30Q02948 NCP1YHR042W 2076 nt12.47□□□□□ -0.41
VPS30Q02948 ATF2YGR177C 1608 nt12.47□□□□□ -0.41
VPS30Q02948 RRT5YFR032C 870 nt12.45□□□□□ -0.42
VPS30Q02948 ERF2YLR246W 1080 nt12.45□□□□□ -0.42
VPS30Q02948 SPC25YER018C 666 nt12.44□□□□□ -0.42
VPS30Q02948 STB1YNL309W 1263 nt12.44□□□□□ -0.42
VPS30Q02948 YFL067WYFL067W 528 nt12.42□□□□□ -0.42
VPS30Q02948 BDH1YAL060W 1149 nt12.42□□□□□ -0.42
VPS30Q02948 DDR2YOL052C-A 186 nt12.42□□□□□ -0.42
VPS30Q02948 CRR1YLR213C 1269 nt12.41□□□□□ -0.42
VPS30Q02948 CCT4YDL143W 1587 nt12.4□□□□□ -0.42
VPS30Q02948 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt12.4□□□□□ -0.42
VPS30Q02948 PEX25YPL112C 1185 nt12.4□□□□□ -0.42
VPS30Q02948 YFL066CYFL066C 1179 nt12.39□□□□□ -0.43
VPS30Q02948 YSP3YOR003W 1437 nt12.38□□□□□ -0.43
VPS30Q02948 GPI16YHR188C 1833 nt12.37□□□□□ -0.43
VPS30Q02948 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt12.36□□□□□ -0.43
VPS30Q02948 LYS4YDR234W 2082 nt12.35□□□□□ -0.43
VPS30Q02948 YLR415CYLR415C 339 nt12.35□□□□□ -0.43
VPS30Q02948 YJL225CYJL225C 5277 nt12.35□□□□□ -0.43
VPS30Q02948 VPS60YDR486C 690 nt12.34□□□□□ -0.43
VPS30Q02948 BOP3YNL042W 1191 nt12.34□□□□□ -0.43
VPS30Q02948 RTF1YGL244W 1677 nt12.33□□□□□ -0.44
VPS30Q02948 PIB2YGL023C 1908 nt12.33□□□□□ -0.44
VPS30Q02948 YNL115CYNL115C 1935 nt12.32□□□□□ -0.44
VPS30Q02948 SWC5YBR231C 912 nt12.31□□□□□ -0.44
VPS30Q02948 ANP1YEL036C 1503 nt12.31□□□□□ -0.44
VPS30Q02948 SNG1YGR197C 1644 nt12.3□□□□□ -0.44
VPS30Q02948 FEN2YCR028C 1539 nt12.3□□□□□ -0.44
VPS30Q02948 ALG3YBL082C 1377 nt12.29□□□□□ -0.44
VPS30Q02948 HEM12YDR047W 1089 nt12.28□□□□□ -0.44
VPS30Q02948 MIC10YCL057C-A 294 nt12.27□□□□□ -0.45
VPS30Q02948 BOR1YNL275W 1731 nt12.27□□□□□ -0.45
VPS30Q02948 SBA1YKL117W 651 nt12.18□□□□□ -0.46
VPS30Q02948 SPT8YLR055C 1809 nt12.17□□□□□ -0.46
VPS30Q02948 YIR016WYIR016W 798 nt12.17□□□□□ -0.46
VPS30Q02948 PTK1YKL198C 1989 nt12.16□□□□□ -0.46
VPS30Q02948 NAT4YMR069W 858 nt12.15□□□□□ -0.46
VPS30Q02948 VPS75YNL246W 795 nt12.14□□□□□ -0.47
VPS30Q02948 GLK1YCL040W 1503 nt12.11□□□□□ -0.47
VPS30Q02948 MIR1YJR077C 936 nt12.09□□□□□ -0.47
VPS30Q02948 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt12.07□□□□□ -0.48
VPS30Q02948 MSF1YPR047W 1410 nt12.05□□□□□ -0.48
VPS30Q02948 THI74YDR438W 1113 nt12.05□□□□□ -0.48
VPS30Q02948 MCH5YOR306C 1566 nt12.05□□□□□ -0.48
VPS30Q02948 TIM17YJL143W 477 nt12.04□□□□□ -0.48
VPS30Q02948 BNA2YJR078W 1362 nt12.03□□□□□ -0.48
VPS30Q02948 MIC12YBR262C 321 nt12.01□□□□□ -0.49
VPS30Q02948 SHM2YLR058C 1410 nt12□□□□□ -0.49
VPS30Q02948 XDJ1YLR090W 1380 nt11.99□□□□□ -0.49
VPS30Q02948 RAX1YOR301W 1308 nt11.98□□□□□ -0.49
VPS30Q02948 PAU7YAR020C 168 nt11.98□□□□□ -0.49
VPS30Q02948 YFL054CYFL054C 1941 nt11.96□□□□□ -0.49
VPS30Q02948 DAT1YML113W 747 nt11.93□□□□□ -0.5
VPS30Q02948 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.91□□□□□ -0.5
VPS30Q02948 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.91□□□□□ -0.5
VPS30Q02948 GDH3YAL062W 1374 nt11.91□□□□□ -0.5
VPS30Q02948 NIT1YIL164C 600 nt11.9□□□□□ -0.5
VPS30Q02948 SHB17YKR043C 816 nt11.89□□□□□ -0.51
VPS30Q02948 SGT2YOR007C 1041 nt11.89□□□□□ -0.51
VPS30Q02948 HHO1YPL127C 777 nt11.89□□□□□ -0.51
VPS30Q02948 YGR201CYGR201C 678 nt11.88□□□□□ -0.51
VPS30Q02948 UBA4YHR111W 1323 nt11.87□□□□□ -0.51
VPS30Q02948 YGL034CYGL034C 366 nt11.83□□□□□ -0.52
VPS30Q02948 YDR010CYDR010C 333 nt11.82□□□□□ -0.52
VPS30Q02948 YSR3YKR053C 1215 nt11.8□□□□□ -0.52
VPS30Q02948 ALG12YNR030W 1656 nt11.8□□□□□ -0.52
VPS30Q02948 AVT6YER119C 1347 nt11.79□□□□□ -0.52
VPS30Q02948 CCA1YER168C 1641 nt11.75□□□□□ -0.53
VPS30Q02948 AGP1YCL025C 1902 nt11.75□□□□□ -0.53
VPS30Q02948 XYL2YLR070C 1071 nt11.74□□□□□ -0.53
VPS30Q02948 RET2YFR051C 1641 nt11.73□□□□□ -0.53
VPS30Q02948 YMR244WYMR244W 1068 nt11.72□□□□□ -0.53
VPS30Q02948 GOR1YNL274C 1053 nt11.72□□□□□ -0.53
VPS30Q02948 SWE1YJL187C 2460 nt11.72□□□□□ -0.53
VPS30Q02948 PHO89YBR296C 1725 nt11.7□□□□□ -0.54
VPS30Q02948 DUT1YBR252W 444 nt11.7□□□□□ -0.54
VPS30Q02948 GLR1YPL091W 1452 nt11.69□□□□□ -0.54
VPS30Q02948 RBG1YAL036C 1110 nt11.67□□□□□ -0.54
VPS30Q02948 HSP60YLR259C 1719 nt11.66□□□□□ -0.54
VPS30Q02948 NDI1YML120C 1542 nt11.66□□□□□ -0.54
VPS30Q02948 YCR087WYCR087W 516 nt11.65□□□□□ -0.54
VPS30Q02948 YCR102CYCR102C 1107 nt11.63□□□□□ -0.55
VPS30Q02948 AIM45YPR004C 1035 nt11.61□□□□□ -0.55
VPS30Q02948 SFA1YDL168W 1161 nt11.57□□□□□ -0.56
VPS30Q02948 COQ2YNR041C 1119 nt11.57□□□□□ -0.56
VPS30Q02948 MRP20YDR405W 792 nt11.56□□□□□ -0.56
VPS30Q02948 DUS1YML080W 1272 nt11.53□□□□□ -0.56
VPS30Q02948 NBP35YGL091C 987 nt11.51□□□□□ -0.57
VPS30Q02948 RBG2YGR173W 1107 nt11.51□□□□□ -0.57
VPS30Q02948 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt11.51□□□□□ -0.57
VPS30Q02948 SHH4YLR164W 507 nt11.48□□□□□ -0.57
VPS30Q02948 NAR1YNL240C 1476 nt11.46□□□□□ -0.57
VPS30Q02948 STR3YGL184C 1398 nt11.46□□□□□ -0.57
VPS30Q02948 TIR3YIL011W 810 nt11.45□□□□□ -0.58
VPS30Q02948 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.44□□□□□ -0.58
VPS30Q02948 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.44□□□□□ -0.58
VPS30Q02948 AQY2YLL052C 450 nt11.44□□□□□ -0.58
VPS30Q02948 YCL074WYCL074W 927 nt11.42□□□□□ -0.58
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