Protein–RNA interactions for Protein: P53847

DSL1, Protein transport protein DSL1, yeast

Predictions only

Length 754 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSL1	P53847	ATF2	YGR177C	1608 nt		10.54	□□□□□ -0.72
DSL1	P53847	RAX1	YOR301W	1308 nt		10.54	□□□□□ -0.72
DSL1	P53847	BMT6	YLR063W	1098 nt		10.53	□□□□□ -0.72
DSL1	P53847	FTR1	YER145C	1215 nt		10.52	□□□□□ -0.73
DSL1	P53847	MIC10	YCL057C-A	294 nt		10.51	□□□□□ -0.73
DSL1	P53847	SNG1	YGR197C	1644 nt		10.51	□□□□□ -0.73
DSL1	P53847	RDN25-1	RDN25-1	3396 nt		10.5	□□□□□ -0.73
DSL1	P53847	RDN25-2	RDN25-2	3396 nt		10.5	□□□□□ -0.73
DSL1	P53847	YEL076C-A	YEL076C-A	651 nt		10.5	□□□□□ -0.73
DSL1	P53847	YEL076C	YEL076C	651 nt		10.5	□□□□□ -0.73
DSL1	P53847	YLR464W	YLR464W	651 nt		10.5	□□□□□ -0.73
DSL1	P53847	DDR2	YOL052C-A	186 nt		10.5	□□□□□ -0.73
DSL1	P53847	DIC1	YLR348C	897 nt		10.49	□□□□□ -0.73
DSL1	P53847	TRM5	YHR070W	1500 nt		10.48	□□□□□ -0.73
DSL1	P53847	GAL1	YBR020W	1587 nt		10.48	□□□□□ -0.73
DSL1	P53847	CMP2	YML057W	1815 nt		10.47	□□□□□ -0.73
DSL1	P53847	DPS1	YLL018C	1674 nt		10.46	□□□□□ -0.74
DSL1	P53847	CCA1	YER168C	1641 nt		10.45	□□□□□ -0.74
DSL1	P53847	YDL086C-A	YDL086C-A	435 nt		10.43	□□□□□ -0.74
DSL1	P53847	BNA2	YJR078W	1362 nt		10.41	□□□□□ -0.74
DSL1	P53847	AQY1	YPR192W	918 nt		10.41	□□□□□ -0.74
DSL1	P53847	CYT2	YKL087C	675 nt		10.39	□□□□□ -0.75
DSL1	P53847	ANP1	YEL036C	1503 nt		10.37	□□□□□ -0.75
DSL1	P53847	HEL2	YDR266C	1920 nt		10.36	□□□□□ -0.75
DSL1	P53847	PBP1	YGR178C	2169 nt		10.36	□□□□□ -0.75
DSL1	P53847	SSN3	YPL042C	1668 nt		10.35	□□□□□ -0.75
DSL1	P53847	YLR235C	YLR235C	399 nt		10.33	□□□□□ -0.76
DSL1	P53847	STB1	YNL309W	1263 nt		10.32	□□□□□ -0.76
DSL1	P53847	BIO5	YNR056C	1686 nt		10.31	□□□□□ -0.76
DSL1	P53847	YDR524C-B	YDR524C-B	201 nt		10.31	□□□□□ -0.76
DSL1	P53847	PTH1	YHR189W	573 nt		10.31	□□□□□ -0.76
DSL1	P53847	TIM23	YNR017W	669 nt		10.3	□□□□□ -0.76
DSL1	P53847	SPC25	YER018C	666 nt		10.29	□□□□□ -0.76
DSL1	P53847	YLR179C	YLR179C	606 nt		10.29	□□□□□ -0.76
DSL1	P53847	GPI16	YHR188C	1833 nt		10.28	□□□□□ -0.76
DSL1	P53847	FEN2	YCR028C	1539 nt		10.28	□□□□□ -0.76
DSL1	P53847	MIC12	YBR262C	321 nt		10.28	□□□□□ -0.76
DSL1	P53847	YKR005C	YKR005C	1578 nt		10.27	□□□□□ -0.76
DSL1	P53847	FRE6	YLL051C	2139 nt		10.26	□□□□□ -0.77
DSL1	P53847	DUS1	YML080W	1272 nt		10.26	□□□□□ -0.77
DSL1	P53847	HHO1	YPL127C	777 nt		10.25	□□□□□ -0.77
DSL1	P53847	GID7	YCL039W	2238 nt		10.25	□□□□□ -0.77
DSL1	P53847	WSC2	YNL283C	1512 nt		10.23	□□□□□ -0.77
DSL1	P53847	YCL074W	YCL074W	927 nt		10.21	□□□□□ -0.77
DSL1	P53847	IRC24	YIR036C	792 nt		10.21	□□□□□ -0.77
DSL1	P53847	SNF1	YDR477W	1902 nt		10.21	□□□□□ -0.78
DSL1	P53847	YIR016W	YIR016W	798 nt		10.2	□□□□□ -0.78
DSL1	P53847	SPP1	YPL138C	1062 nt		10.2	□□□□□ -0.78
DSL1	P53847	AGP1	YCL025C	1902 nt		10.19	□□□□□ -0.78
DSL1	P53847	CCT4	YDL143W	1587 nt		10.19	□□□□□ -0.78
DSL1	P53847	VPS60	YDR486C	690 nt		10.18	□□□□□ -0.78
DSL1	P53847	SWC5	YBR231C	912 nt		10.17	□□□□□ -0.78
DSL1	P53847	YGR259C	YGR259C	441 nt		10.16	□□□□□ -0.78
DSL1	P53847	AHT1	YHR093W	549 nt		10.16	□□□□□ -0.78
DSL1	P53847	YKL030W	YKL030W	606 nt		10.16	□□□□□ -0.78
DSL1	P53847	YGR201C	YGR201C	678 nt		10.15	□□□□□ -0.78
DSL1	P53847	YPR064W	YPR064W	420 nt		10.15	□□□□□ -0.78
DSL1	P53847	NDI1	YML120C	1542 nt		10.15	□□□□□ -0.78
DSL1	P53847	YAT1	YAR035W	2064 nt		10.14	□□□□□ -0.79
DSL1	P53847	MET2	YNL277W	1461 nt		10.13	□□□□□ -0.79
DSL1	P53847	ALG3	YBL082C	1377 nt		10.1	□□□□□ -0.79
DSL1	P53847	SFP1	YLR403W	2052 nt		10.08	□□□□□ -0.8
DSL1	P53847	NPP1	YCR026C	2229 nt		10.08	□□□□□ -0.8
DSL1	P53847	XDJ1	YLR090W	1380 nt		10.05	□□□□□ -0.8
DSL1	P53847	TAD3	YLR316C	969 nt		10.04	□□□□□ -0.8
DSL1	P53847	GOR1	YNL274C	1053 nt		10.03	□□□□□ -0.8
DSL1	P53847	STR3	YGL184C	1398 nt		10.02	□□□□□ -0.8
DSL1	P53847	BSP1	YPR171W	1731 nt		10.01	□□□□□ -0.81
DSL1	P53847	RDN18-1	RDN18-1	1800 nt		10	□□□□□ -0.81
DSL1	P53847	RDN18-2	RDN18-2	1800 nt		10	□□□□□ -0.81
DSL1	P53847	AVT6	YER119C	1347 nt		10	□□□□□ -0.81
DSL1	P53847	GDH3	YAL062W	1374 nt		9.99	□□□□□ -0.81
DSL1	P53847	AQY2	YLL052C	450 nt		9.98	□□□□□ -0.81
DSL1	P53847	DUT1	YBR252W	444 nt		9.98	□□□□□ -0.81
DSL1	P53847	ESBP6	YNL125C	2022 nt		9.98	□□□□□ -0.81
DSL1	P53847	MAE1	YKL029C	2010 nt		9.96	□□□□□ -0.81
DSL1	P53847	SPT20	YOL148C	1815 nt		9.95	□□□□□ -0.82
DSL1	P53847	YLR415C	YLR415C	339 nt		9.93	□□□□□ -0.82
DSL1	P53847	RTN2	YDL204W	1182 nt		9.91	□□□□□ -0.82
DSL1	P53847	RIM8	YGL045W	1629 nt		9.89	□□□□□ -0.83
DSL1	P53847	BDH1	YAL060W	1149 nt		9.89	□□□□□ -0.83
DSL1	P53847	YGL114W	YGL114W	2178 nt		9.89	□□□□□ -0.83
DSL1	P53847	ILV2	YMR108W	2064 nt		9.88	□□□□□ -0.83
DSL1	P53847	HMG2	YLR450W	3138 nt		9.88	□□□□□ -0.83
DSL1	P53847	INA1	YLR413W	2028 nt		9.87	□□□□□ -0.83
DSL1	P53847	TIM17	YJL143W	477 nt		9.87	□□□□□ -0.83
DSL1	P53847	SHM2	YLR058C	1410 nt		9.87	□□□□□ -0.83
DSL1	P53847	tL(GAG)G	tL(GAG)G	82 nt		9.86	□□□□□ -0.83
DSL1	P53847	UBX6	YJL048C	1191 nt		9.84	□□□□□ -0.83
DSL1	P53847	TPO4	YOR273C	1980 nt		9.83	□□□□□ -0.84
DSL1	P53847	RTG1	YOL067C	534 nt		9.83	□□□□□ -0.84
DSL1	P53847	RFC1	YOR217W	2586 nt		9.81	□□□□□ -0.84
DSL1	P53847	DAT1	YML113W	747 nt		9.79	□□□□□ -0.84
DSL1	P53847	UGA4	YDL210W	1716 nt		9.79	□□□□□ -0.84
DSL1	P53847	DTR1	YBR180W	1719 nt		9.77	□□□□□ -0.85
DSL1	P53847	YCR102C	YCR102C	1107 nt		9.76	□□□□□ -0.85
DSL1	P53847	HUA1	YGR268C	597 nt		9.76	□□□□□ -0.85
DSL1	P53847	YSP3	YOR003W	1437 nt		9.75	□□□□□ -0.85
DSL1	P53847	ACO2	YJL200C	2370 nt		9.73	□□□□□ -0.85
DSL1	P53847	NIT1	YIL164C	600 nt		9.73	□□□□□ -0.85

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