Protein–RNA interactions for Protein: P53158

KXD1, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit KXD1, yeastyeast

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
KXD1P53158 PCH2YBR186W 1695 nt10.95□□□□□ -0.66
KXD1P53158 snR78snR78 87 nt10.94□□□□□ -0.66
KXD1P53158 SKG1YKR100C 1068 nt10.92□□□□□ -0.66
KXD1P53158 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt10.92□□□□□ -0.66
KXD1P53158 SNF6YHL025W 999 nt10.91□□□□□ -0.66
KXD1P53158 GUT2YIL155C 1950 nt10.89□□□□□ -0.67
KXD1P53158 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.89□□□□□ -0.67
KXD1P53158 YEL076CYEL076C 651 nt10.89□□□□□ -0.67
KXD1P53158 YLR464WYLR464W 651 nt10.89□□□□□ -0.67
KXD1P53158 YLR235CYLR235C 399 nt10.87□□□□□ -0.67
KXD1P53158 AI3Q0060 1248 nt10.86□□□□□ -0.67
KXD1P53158 PTH1YHR189W 573 nt10.86□□□□□ -0.67
KXD1P53158 YIH1YCR059C 777 nt10.84□□□□□ -0.67
KXD1P53158 ADO1YJR105W 1023 nt10.84□□□□□ -0.67
KXD1P53158 YNR068CYNR068C 819 nt10.84□□□□□ -0.67
KXD1P53158 YHM2YMR241W 945 nt10.83□□□□□ -0.68
KXD1P53158 RNQ1YCL028W 1218 nt10.82□□□□□ -0.68
KXD1P53158 YKL030WYKL030W 606 nt10.8□□□□□ -0.68
KXD1P53158 DIC1YLR348C 897 nt10.8□□□□□ -0.68
KXD1P53158 LCB1YMR296C 1677 nt10.79□□□□□ -0.68
KXD1P53158 SIM1YIL123W 1431 nt10.78□□□□□ -0.68
KXD1P53158 BIO4YNR057C 714 nt10.78□□□□□ -0.68
KXD1P53158 NCP1YHR042W 2076 nt10.77□□□□□ -0.69
KXD1P53158 PIB2YGL023C 1908 nt10.75□□□□□ -0.69
KXD1P53158 YJR154WYJR154W 1041 nt10.74□□□□□ -0.69
KXD1P53158 HUA1YGR268C 597 nt10.73□□□□□ -0.69
KXD1P53158 TIM23YNR017W 669 nt10.73□□□□□ -0.69
KXD1P53158 RTF1YGL244W 1677 nt10.73□□□□□ -0.69
KXD1P53158 BOP3YNL042W 1191 nt10.72□□□□□ -0.69
KXD1P53158 YLL053CYLL053C 459 nt10.71□□□□□ -0.69
KXD1P53158 YJL225CYJL225C 5277 nt10.69□□□□□ -0.7
KXD1P53158 URE2YNL229C 1065 nt10.68□□□□□ -0.7
KXD1P53158 FRE6YLL051C 2139 nt10.66□□□□□ -0.7
KXD1P53158 FTR1YER145C 1215 nt10.66□□□□□ -0.7
KXD1P53158 YLR179CYLR179C 606 nt10.66□□□□□ -0.7
KXD1P53158 YPL041CYPL041C 624 nt10.63□□□□□ -0.71
KXD1P53158 GAL1YBR020W 1587 nt10.62□□□□□ -0.71
KXD1P53158 ERF2YLR246W 1080 nt10.62□□□□□ -0.71
KXD1P53158 AQY1YPR192W 918 nt10.62□□□□□ -0.71
KXD1P53158 YPL168WYPL168W 1293 nt10.61□□□□□ -0.71
KXD1P53158 WSC2YNL283C 1512 nt10.6□□□□□ -0.71
KXD1P53158 AHT1YHR093W 549 nt10.6□□□□□ -0.71
KXD1P53158 CRR1YLR213C 1269 nt10.59□□□□□ -0.71
KXD1P53158 LYS4YDR234W 2082 nt10.58□□□□□ -0.72
KXD1P53158 FTH1YBR207W 1398 nt10.58□□□□□ -0.72
KXD1P53158 YPR064WYPR064W 420 nt10.58□□□□□ -0.72
KXD1P53158 TRM5YHR070W 1500 nt10.58□□□□□ -0.72
KXD1P53158 PTK1YKL198C 1989 nt10.57□□□□□ -0.72
KXD1P53158 ATF2YGR177C 1608 nt10.57□□□□□ -0.72
KXD1P53158 YFL067WYFL067W 528 nt10.55□□□□□ -0.72
KXD1P53158 PAB1YER165W 1734 nt10.54□□□□□ -0.72
KXD1P53158 THP3YPR045C 1413 nt10.53□□□□□ -0.72
KXD1P53158 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.53□□□□□ -0.72
KXD1P53158 Q0142Q0142 177 nt10.53□□□□□ -0.72
KXD1P53158 TAD3YLR316C 969 nt10.53□□□□□ -0.72
KXD1P53158 COG1YGL223C 1254 nt10.52□□□□□ -0.73
KXD1P53158 YJL107CYJL107C 1164 nt10.52□□□□□ -0.73
KXD1P53158 SPC25YER018C 666 nt10.51□□□□□ -0.73
KXD1P53158 STB1YNL309W 1263 nt10.5□□□□□ -0.73
KXD1P53158 DDR2YOL052C-A 186 nt10.5□□□□□ -0.73
KXD1P53158 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.49□□□□□ -0.73
KXD1P53158 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.49□□□□□ -0.73
KXD1P53158 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.47□□□□□ -0.73
KXD1P53158 YDR094WYDR094W 336 nt10.47□□□□□ -0.73
KXD1P53158 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.46□□□□□ -0.73
KXD1P53158 UBX6YJL048C 1191 nt10.46□□□□□ -0.73
KXD1P53158 SNG1YGR197C 1644 nt10.46□□□□□ -0.74
KXD1P53158 ANP1YEL036C 1503 nt10.45□□□□□ -0.74
KXD1P53158 HEM12YDR047W 1089 nt10.45□□□□□ -0.74
KXD1P53158 YEL074WYEL074W 339 nt10.45□□□□□ -0.74
KXD1P53158 LSM12YHR121W 564 nt10.44□□□□□ -0.74
KXD1P53158 GPI16YHR188C 1833 nt10.44□□□□□ -0.74
KXD1P53158 CCT4YDL143W 1587 nt10.43□□□□□ -0.74
KXD1P53158 MIC10YCL057C-A 294 nt10.43□□□□□ -0.74
KXD1P53158 BNS1YGR230W 414 nt10.41□□□□□ -0.74
KXD1P53158 YTH1YPR107C 627 nt10.4□□□□□ -0.74
KXD1P53158 RSM23YGL129C 1353 nt10.39□□□□□ -0.75
KXD1P53158 FEN2YCR028C 1539 nt10.39□□□□□ -0.75
KXD1P53158 VPS60YDR486C 690 nt10.39□□□□□ -0.75
KXD1P53158 BDH1YAL060W 1149 nt10.39□□□□□ -0.75
KXD1P53158 KTR3YBR205W 1215 nt10.38□□□□□ -0.75
KXD1P53158 NEM1YHR004C 1341 nt10.37□□□□□ -0.75
KXD1P53158 YFR018CYFR018C 1092 nt10.37□□□□□ -0.75
KXD1P53158 YFL054CYFL054C 1941 nt10.37□□□□□ -0.75
KXD1P53158 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.36□□□□□ -0.75
KXD1P53158 AIR1YIL079C 1083 nt10.36□□□□□ -0.75
KXD1P53158 MOD5YOR274W 1287 nt10.35□□□□□ -0.75
KXD1P53158 ALG3YBL082C 1377 nt10.35□□□□□ -0.75
KXD1P53158 Q0255Q0255 1419 nt10.34□□□□□ -0.75
KXD1P53158 YGL118CYGL118C 438 nt10.34□□□□□ -0.75
KXD1P53158 SWC5YBR231C 912 nt10.34□□□□□ -0.75
KXD1P53158 YSP3YOR003W 1437 nt10.33□□□□□ -0.76
KXD1P53158 YLR415CYLR415C 339 nt10.33□□□□□ -0.76
KXD1P53158 YGL188CYGL188C 174 nt10.32□□□□□ -0.76
KXD1P53158 AST1YBL069W 1290 nt10.32□□□□□ -0.76
KXD1P53158 YIR016WYIR016W 798 nt10.3□□□□□ -0.76
KXD1P53158 ATP6Q0085 780 nt10.29□□□□□ -0.76
KXD1P53158 PIC2YER053C 903 nt10.29□□□□□ -0.76
KXD1P53158 SPT8YLR055C 1809 nt10.28□□□□□ -0.76
KXD1P53158 PEX25YPL112C 1185 nt10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 47.6 ms