Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 ASB13-203ENST00000479033 2565 ntTSL 226.19■■□□□ 1.782e-14■■■■■ 50
HNRNPMP52272 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.672e-14■■■■■ 50
HNRNPMP52272 ASB13-202ENST00000459912 2780 ntTSL 1 (best)23.76■■□□□ 1.392e-14■■■■■ 50
HNRNPMP52272 ZFC3H1-201ENST00000378743 7285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.051e-14■■■■■ 50
HNRNPMP52272 ZFC3H1-212ENST00000552994 7597 ntTSL 1 (best)14.88□□□□□ -0.031e-14■■■■■ 50
HNRNPMP52272 ZFC3H1-208ENST00000550712 571 ntTSL 47.07□□□□□ -1.281e-14■■■■■ 50
HNRNPMP52272 COG5-210ENST00000605888 576 ntAPPRIS ALT2 TSL 221.62■■□□□ 1.053e-8■■■■■ 49.9
HNRNPMP52272 GLMN-206ENST00000495852 891 ntTSL 55.65□□□□□ -1.57e-12■■■■■ 49.8
HNRNPMP52272 UGGT1-202ENST00000376723 6682 ntTSL 1 (best)19.32■□□□□ 0.682e-7■■■■■ 49.6
HNRNPMP52272 UGGT1-205ENST00000438277 3113 ntTSL 1 (best)17.31■□□□□ 0.362e-7■■■■■ 49.6
HNRNPMP52272 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.22e-7■■■■■ 49.6
HNRNPMP52272 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.083e-7■■■■■ 48.9
HNRNPMP52272 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.893e-7■■■■■ 48.9
HNRNPMP52272 SRCIN1-211ENST00000612431 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)34.3■■■■□ 3.081e-6■■■■■ 48.9
HNRNPMP52272 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.521e-6■■■■■ 48.9
HNRNPMP52272 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.971e-6■■■■■ 48.9
HNRNPMP52272 CDC14A-205ENST00000469387 818 ntTSL 39.62□□□□□ -0.871e-12■■■■■ 48.6
HNRNPMP52272 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.924e-10■■■■■ 48.5
HNRNPMP52272 ZNF292-208ENST00000518845 277 ntTSL 332.87■■■□□ 2.854e-10■■■■■ 48.5
HNRNPMP52272 ZNF292-203ENST00000369578 1732 ntTSL 225.9■■□□□ 1.744e-10■■■■■ 48.5
HNRNPMP52272 ZNF292-207ENST00000496806 770 ntTSL 322.61■■□□□ 1.214e-10■■■■■ 48.5
HNRNPMP52272 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.964e-10■■■■■ 48.5
HNRNPMP52272 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.154e-10■■■■■ 48.5
HNRNPMP52272 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.593e-7■■■■■ 48.2
HNRNPMP52272 PFKFB3-205ENST00000379789 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.123e-7■■■■■ 48.2
HNRNPMP52272 PFKFB3-218ENST00000639949 587 ntTSL 413.96□□□□□ -0.173e-7■■■■■ 48.2
HNRNPMP52272 ARHGAP18-203ENST00000483367 460 ntTSL 38.14□□□□□ -1.118e-10■■■■■ 48.1
HNRNPMP52272 ARHGAP18-202ENST00000463225 464 ntTSL 35.53□□□□□ -1.528e-10■■■■■ 48.1
HNRNPMP52272 CEP83-207ENST00000547232 2166 ntTSL 1 (best)18.56■□□□□ 0.563e-7■■■■■ 47.9
HNRNPMP52272 CEP83-201ENST00000339839 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.343e-7■■■■■ 47.9
HNRNPMP52272 CEP83-203ENST00000397809 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.283e-7■■■■■ 47.9
HNRNPMP52272 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.773e-7■■■■■ 47.9
HNRNPMP52272 MAGI1-209ENST00000476403 622 ntTSL 233.04■■■□□ 2.883e-8■■■■■ 47.2
HNRNPMP52272 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.293e-12■■■■■ 47.2
HNRNPMP52272 BCAT1-206ENST00000539780 1360 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.223e-12■■■■■ 47.2
HNRNPMP52272 BCAT1-201ENST00000261192 9674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.233e-12■■■■■ 47.2
HNRNPMP52272 BCAT1-202ENST00000342945 4319 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.663e-12■■■■■ 47.2
HNRNPMP52272 BCAT1-209ENST00000546285 549 ntTSL 45.32□□□□□ -1.563e-12■■■■■ 47.2
HNRNPMP52272 PRKCZ-217ENST00000481140 713 ntTSL 411.22□□□□□ -0.613e-7■■■■■ 47.2
HNRNPMP52272 SUN1-235ENST00000497943 2824 ntTSL 224.06■■□□□ 1.449e-7■■■■■ 47.2
HNRNPMP52272 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC41.7■■■■■ 4.273e-14■■■■■ 47.1
HNRNPMP52272 HGH1-203ENST00000530074 702 ntTSL 336.91■■■■□ 3.53e-14■■■■■ 47.1
HNRNPMP52272 KIF13A-211ENST00000507576 529 ntTSL 336.27■■■■□ 3.43e-14■■■■■ 47.1
HNRNPMP52272 HGH1-205ENST00000533266 2106 ntTSL 231.51■■■□□ 2.633e-14■■■■■ 47.1
HNRNPMP52272 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.073e-14■■■■■ 47.1
HNRNPMP52272 KIF13A-201ENST00000259711 5941 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.383e-14■■■■■ 47.1
HNRNPMP52272 KIF13A-213ENST00000636847 5538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.533e-14■■■■■ 47.1
HNRNPMP52272 KIF13A-204ENST00000378826 5747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.613e-14■■■■■ 47.1
HNRNPMP52272 KIF13A-203ENST00000378814 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.623e-14■■■■■ 47.1
HNRNPMP52272 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.933e-14■■■■■ 47.1
HNRNPMP52272 KIF13A-209ENST00000505588 212 ntTSL 53.67□□□□□ -1.823e-14■■■■■ 47.1
HNRNPMP52272 CABIN1-206ENST00000454754 1321 ntTSL 1 (best)32.03■■■□□ 2.729e-7■■■■■ 46.9
HNRNPMP52272 CABIN1-205ENST00000445422 1472 ntTSL 230.23■■■□□ 2.439e-7■■■■■ 46.9
HNRNPMP52272 COQ8A-209ENST00000489044 941 ntTSL 329.33■■■□□ 2.294e-14■■■■■ 46.8
HNRNPMP52272 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.314e-14■■■■■ 46.8
HNRNPMP52272 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.134e-14■■■■■ 46.8
HNRNPMP52272 COQ8A-205ENST00000478406 3612 ntTSL 220.49■□□□□ 0.874e-14■■■■■ 46.8
HNRNPMP52272 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.414e-14■■■■■ 46.8
HNRNPMP52272 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.236e-10■■■■■ 46.8
HNRNPMP52272 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.716e-10■■■■■ 46.8
HNRNPMP52272 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.026e-14■■■■■ 46.6
HNRNPMP52272 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.866e-14■■■■■ 46.6
HNRNPMP52272 MRPS18A-203ENST00000427312 803 ntTSL 1 (best)26.49■■□□□ 1.836e-14■■■■■ 46.6
HNRNPMP52272 ST7-215ENST00000438863 1005 ntTSL 543.03■■■■■ 4.484e-23■■■■■ 46.6
HNRNPMP52272 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.544e-23■■■■■ 46.6
HNRNPMP52272 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.524e-23■■■■■ 46.6
HNRNPMP52272 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.494e-23■■■■■ 46.6
HNRNPMP52272 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.494e-23■■■■■ 46.6
HNRNPMP52272 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.174e-23■■■■■ 46.6
HNRNPMP52272 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.744e-23■■■■■ 46.6
HNRNPMP52272 ST7-OT4-202ENST00000397751 754 ntTSL 314.98□□□□□ -0.014e-23■■■■■ 46.6
HNRNPMP52272 ST7-216ENST00000443979 805 ntTSL 511.36□□□□□ -0.594e-23■■■■■ 46.6
HNRNPMP52272 ST7-217ENST00000446490 1694 ntTSL 511.19□□□□□ -0.624e-23■■■■■ 46.6
HNRNPMP52272 ST7-209ENST00000417919 577 ntTSL 47.8□□□□□ -1.164e-23■■■■■ 46.6
HNRNPMP52272 ST7-OT4-205ENST00000471110 591 ntTSL 47.38□□□□□ -1.234e-23■■■■■ 46.6
HNRNPMP52272 ST7-211ENST00000421345 531 ntTSL 43.87□□□□□ -1.794e-23■■■■■ 46.6
HNRNPMP52272 ST7-OT4-204ENST00000470996 416 ntTSL 23.76□□□□□ -1.814e-23■■■■■ 46.6
HNRNPMP52272 PTTG1IP-205ENST00000474737 580 ntTSL 325.38■■□□□ 1.653e-8■■■■■ 46.5
HNRNPMP52272 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.38e-24■■■■■ 46.3
HNRNPMP52272 PANK2-204ENST00000471830 622 ntTSL 310.34□□□□□ -0.751e-9■■■■■ 46
HNRNPMP52272 SEPT10-211ENST00000468616 531 ntTSL 45.59□□□□□ -1.512e-13■■■■■ 46
HNRNPMP52272 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.253e-7■■■■■ 45.9
HNRNPMP52272 PRELID2-208ENST00000515161 419 ntTSL 314.49□□□□□ -0.097e-12■■■■■ 45.9
HNRNPMP52272 PRELID2-206ENST00000510594 552 ntTSL 312.68□□□□□ -0.387e-12■■■■■ 45.9
HNRNPMP52272 PRELID2-205ENST00000510259 525 ntTSL 34.95□□□□□ -1.627e-12■■■■■ 45.9
HNRNPMP52272 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.732e-8■■■■■ 45.8
HNRNPMP52272 ERMARD-208ENST00000586341 543 ntTSL 520.34■□□□□ 0.852e-8■■■■■ 45.8
HNRNPMP52272 ERMARD-215ENST00000592580 568 ntTSL 420.34■□□□□ 0.852e-8■■■■■ 45.8
HNRNPMP52272 ERMARD-216ENST00000592745 552 ntTSL 418.46■□□□□ 0.552e-8■■■■■ 45.8
HNRNPMP52272 ERMARD-204ENST00000392095 1908 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.252e-8■■■■■ 45.8
HNRNPMP52272 ERMARD-209ENST00000588437 547 ntTSL 516.34■□□□□ 0.212e-8■■■■■ 45.8
HNRNPMP52272 ERMARD-205ENST00000418781 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.252e-8■■■■■ 45.8
HNRNPMP52272 ERMARD-214ENST00000592367 551 ntTSL 412.97□□□□□ -0.332e-8■■■■■ 45.8
HNRNPMP52272 ERMARD-203ENST00000366773 2141 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.352e-8■■■■■ 45.8
HNRNPMP52272 ERMARD-212ENST00000590711 556 ntTSL 412.43□□□□□ -0.422e-8■■■■■ 45.8
HNRNPMP52272 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.862e-8■■■■■ 45.8
HNRNPMP52272 ERMARD-213ENST00000592315 552 ntTSL 47.01□□□□□ -1.292e-8■■■■■ 45.8
HNRNPMP52272 PRKCZ-215ENST00000479263 1747 ntTSL 232.04■■■□□ 2.722e-6■■■■■ 45.8
HNRNPMP52272 PRKCZ-226ENST00000505322 1859 ntTSL 226.7■■□□□ 1.872e-6■■■■■ 45.8
HNRNPMP52272 PRKCZ-214ENST00000478770 1542 ntTSL 223.05■■□□□ 1.282e-6■■■■■ 45.8
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 712 ms