Protein–RNA interactions for Protein: P47108

URB2, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
URB2P47108 GLK1YCL040W 1503 nt11.27□□□□□ -0.61
URB2P47108 FUR4YBR021W 1902 nt11.27□□□□□ -0.61
URB2P47108 DDR2YOL052C-A 186 nt11.26□□□□□ -0.61
URB2P47108 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.22□□□□□ -0.61
URB2P47108 PTH1YHR189W 573 nt11.2□□□□□ -0.62
URB2P47108 ANP1YEL036C 1503 nt11.19□□□□□ -0.62
URB2P47108 SPP1YPL138C 1062 nt11.19□□□□□ -0.62
URB2P47108 AQY1YPR192W 918 nt11.15□□□□□ -0.62
URB2P47108 STB1YNL309W 1263 nt11.13□□□□□ -0.63
URB2P47108 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.12□□□□□ -0.63
URB2P47108 TIM23YNR017W 669 nt11.12□□□□□ -0.63
URB2P47108 ALG12YNR030W 1656 nt11.11□□□□□ -0.63
URB2P47108 SPC25YER018C 666 nt11.1□□□□□ -0.63
URB2P47108 YLR235CYLR235C 399 nt11.1□□□□□ -0.63
URB2P47108 MIC12YBR262C 321 nt11.1□□□□□ -0.63
URB2P47108 BNA2YJR078W 1362 nt11.1□□□□□ -0.63
URB2P47108 FEN2YCR028C 1539 nt11.09□□□□□ -0.63
URB2P47108 AGP1YCL025C 1902 nt11.09□□□□□ -0.63
URB2P47108 YLR179CYLR179C 606 nt11.09□□□□□ -0.63
URB2P47108 PRP4YPR178W 1398 nt11.08□□□□□ -0.64
URB2P47108 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.06□□□□□ -0.64
URB2P47108 YEL076CYEL076C 651 nt11.06□□□□□ -0.64
URB2P47108 YLR464WYLR464W 651 nt11.06□□□□□ -0.64
URB2P47108 GPI16YHR188C 1833 nt11.04□□□□□ -0.64
URB2P47108 WSC2YNL283C 1512 nt11.03□□□□□ -0.64
URB2P47108 DPS1YLL018C 1674 nt11.02□□□□□ -0.64
URB2P47108 VPS60YDR486C 690 nt11.02□□□□□ -0.65
URB2P47108 AHT1YHR093W 549 nt11□□□□□ -0.65
URB2P47108 YIR016WYIR016W 798 nt11□□□□□ -0.65
URB2P47108 CCT4YDL143W 1587 nt10.99□□□□□ -0.65
URB2P47108 HHO1YPL127C 777 nt10.99□□□□□ -0.65
URB2P47108 MCH5YOR306C 1566 nt10.99□□□□□ -0.65
URB2P47108 ALG3YBL082C 1377 nt10.98□□□□□ -0.65
URB2P47108 DUS1YML080W 1272 nt10.97□□□□□ -0.65
URB2P47108 AAC1YMR056C 930 nt10.97□□□□□ -0.65
URB2P47108 YKR005CYKR005C 1578 nt10.97□□□□□ -0.65
URB2P47108 YKL030WYKL030W 606 nt10.96□□□□□ -0.65
URB2P47108 YCL074WYCL074W 927 nt10.94□□□□□ -0.66
URB2P47108 XDJ1YLR090W 1380 nt10.91□□□□□ -0.66
URB2P47108 SWC5YBR231C 912 nt10.91□□□□□ -0.66
URB2P47108 SNF1YDR477W 1902 nt10.9□□□□□ -0.66
URB2P47108 BMT6YLR063W 1098 nt10.9□□□□□ -0.66
URB2P47108 YPR064WYPR064W 420 nt10.89□□□□□ -0.67
URB2P47108 DUT1YBR252W 444 nt10.88□□□□□ -0.67
URB2P47108 YGR201CYGR201C 678 nt10.87□□□□□ -0.67
URB2P47108 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.86□□□□□ -0.67
URB2P47108 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.86□□□□□ -0.67
URB2P47108 YGR259CYGR259C 441 nt10.86□□□□□ -0.67
URB2P47108 BIO5YNR056C 1686 nt10.85□□□□□ -0.67
URB2P47108 TAD3YLR316C 969 nt10.83□□□□□ -0.68
URB2P47108 STR3YGL184C 1398 nt10.82□□□□□ -0.68
URB2P47108 NAR1YNL240C 1476 nt10.81□□□□□ -0.68
URB2P47108 IRC24YIR036C 792 nt10.76□□□□□ -0.69
URB2P47108 BDH1YAL060W 1149 nt10.75□□□□□ -0.69
URB2P47108 RTG1YOL067C 534 nt10.75□□□□□ -0.69
URB2P47108 AVT6YER119C 1347 nt10.75□□□□□ -0.69
URB2P47108 GDH3YAL062W 1374 nt10.75□□□□□ -0.69
URB2P47108 PBP1YGR178C 2169 nt10.74□□□□□ -0.69
URB2P47108 AQY2YLL052C 450 nt10.72□□□□□ -0.69
URB2P47108 GOR1YNL274C 1053 nt10.72□□□□□ -0.69
URB2P47108 YLR415CYLR415C 339 nt10.67□□□□□ -0.7
URB2P47108 SHM2YLR058C 1410 nt10.67□□□□□ -0.7
URB2P47108 CYT2YKL087C 675 nt10.65□□□□□ -0.7
URB2P47108 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.62□□□□□ -0.71
URB2P47108 RTN2YDL204W 1182 nt10.61□□□□□ -0.71
URB2P47108 YSP3YOR003W 1437 nt10.6□□□□□ -0.71
URB2P47108 TIM17YJL143W 477 nt10.58□□□□□ -0.72
URB2P47108 NIT1YIL164C 600 nt10.57□□□□□ -0.72
URB2P47108 DAT1YML113W 747 nt10.55□□□□□ -0.72
URB2P47108 NBP35YGL091C 987 nt10.5□□□□□ -0.73
URB2P47108 HUA1YGR268C 597 nt10.5□□□□□ -0.73
URB2P47108 SGT2YOR007C 1041 nt10.5□□□□□ -0.73
URB2P47108 PLB1YMR008C 1995 nt10.49□□□□□ -0.73
URB2P47108 YNL115CYNL115C 1935 nt10.48□□□□□ -0.73
URB2P47108 YAT1YAR035W 2064 nt10.46□□□□□ -0.73
URB2P47108 YCR102CYCR102C 1107 nt10.45□□□□□ -0.74
URB2P47108 ARP6YLR085C 1317 nt10.44□□□□□ -0.74
URB2P47108 RPM1RPM1 483 nt10.43□□□□□ -0.74
URB2P47108 PEX25YPL112C 1185 nt10.41□□□□□ -0.74
URB2P47108 PRM5YIL117C 957 nt10.4□□□□□ -0.74
URB2P47108 YFL066CYFL066C 1179 nt10.38□□□□□ -0.75
URB2P47108 HIF1YLL022C 1158 nt10.37□□□□□ -0.75
URB2P47108 CMP2YML057W 1815 nt10.37□□□□□ -0.75
URB2P47108 MRPL8YJL063C 717 nt10.34□□□□□ -0.75
URB2P47108 VPS75YNL246W 795 nt10.34□□□□□ -0.75
URB2P47108 ALD4YOR374W 1560 nt10.32□□□□□ -0.76
URB2P47108 UTR1YJR049C 1593 nt10.31□□□□□ -0.76
URB2P47108 ADO1YJR105W 1023 nt10.31□□□□□ -0.76
URB2P47108 SHH4YLR164W 507 nt10.3□□□□□ -0.76
URB2P47108 NDI1YML120C 1542 nt10.28□□□□□ -0.76
URB2P47108 TIR3YIL011W 810 nt10.27□□□□□ -0.77
URB2P47108 GAP1YKR039W 1809 nt10.26□□□□□ -0.77
URB2P47108 PRO1YDR300C 1287 nt10.24□□□□□ -0.77
URB2P47108 LSC2YGR244C 1284 nt10.24□□□□□ -0.77
URB2P47108 YFR018CYFR018C 1092 nt10.22□□□□□ -0.77
URB2P47108 RPC82YPR190C 1965 nt10.22□□□□□ -0.77
URB2P47108 HSL7YBR133C 2484 nt10.22□□□□□ -0.77
URB2P47108 PRE6YOL038W 765 nt10.21□□□□□ -0.77
URB2P47108 SPT20YOL148C 1815 nt10.19□□□□□ -0.78
URB2P47108 POM34YLR018C 900 nt10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.8 ms