Protein–RNA interactions for Protein: P46992

YJL171C, Cell wall protein YJL171C, yeastyeast

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL171CP46992 YPR064WYPR064W 420 nt13.06□□□□□ -0.32
YJL171CP46992 SCC4YER147C 1875 nt13.04□□□□□ -0.32
YJL171CP46992 TAD3YLR316C 969 nt13.01□□□□□ -0.33
YJL171CP46992 SDH1YKL148C 1923 nt13□□□□□ -0.33
YJL171CP46992 ARP10YDR106W 855 nt13□□□□□ -0.33
YJL171CP46992 YFL066CYFL066C 1179 nt13□□□□□ -0.33
YJL171CP46992 RNQ1YCL028W 1218 nt12.98□□□□□ -0.33
YJL171CP46992 KTR3YBR205W 1215 nt12.97□□□□□ -0.33
YJL171CP46992 WSC2YNL283C 1512 nt12.97□□□□□ -0.33
YJL171CP46992 PET20YPL159C 762 nt12.96□□□□□ -0.33
YJL171CP46992 YIH1YCR059C 777 nt12.94□□□□□ -0.34
YJL171CP46992 PHO92YDR374C 921 nt12.94□□□□□ -0.34
YJL171CP46992 AHT1YHR093W 549 nt12.92□□□□□ -0.34
YJL171CP46992 YBR220CYBR220C 1683 nt12.89□□□□□ -0.35
YJL171CP46992 RPM1RPM1 483 nt12.88□□□□□ -0.35
YJL171CP46992 YLL053CYLL053C 459 nt12.85□□□□□ -0.35
YJL171CP46992 YNL195CYNL195C 786 nt12.85□□□□□ -0.35
YJL171CP46992 NEM1YHR004C 1341 nt12.85□□□□□ -0.35
YJL171CP46992 YNR068CYNR068C 819 nt12.84□□□□□ -0.35
YJL171CP46992 PEX25YPL112C 1185 nt12.83□□□□□ -0.36
YJL171CP46992 NAT4YMR069W 858 nt12.82□□□□□ -0.36
YJL171CP46992 RRT12YCR045C 1476 nt12.81□□□□□ -0.36
YJL171CP46992 FAR3YMR052W 615 nt12.81□□□□□ -0.36
YJL171CP46992 YSC84YHR016C 1407 nt12.8□□□□□ -0.36
YJL171CP46992 SSA4YER103W 1929 nt12.78□□□□□ -0.36
YJL171CP46992 YNL115CYNL115C 1935 nt12.78□□□□□ -0.36
YJL171CP46992 FTR1YER145C 1215 nt12.77□□□□□ -0.37
YJL171CP46992 BDH1YAL060W 1149 nt12.77□□□□□ -0.37
YJL171CP46992 YSP3YOR003W 1437 nt12.77□□□□□ -0.37
YJL171CP46992 BIO4YNR057C 714 nt12.76□□□□□ -0.37
YJL171CP46992 GLK1YCL040W 1503 nt12.75□□□□□ -0.37
YJL171CP46992 GAL1YBR020W 1587 nt12.74□□□□□ -0.37
YJL171CP46992 SIM1YIL123W 1431 nt12.74□□□□□ -0.37
YJL171CP46992 TRM5YHR070W 1500 nt12.72□□□□□ -0.37
YJL171CP46992 YLR415CYLR415C 339 nt12.71□□□□□ -0.37
YJL171CP46992 AQY1YPR192W 918 nt12.7□□□□□ -0.38
YJL171CP46992 snR78snR78 87 nt12.69□□□□□ -0.38
YJL171CP46992 YDR008CYDR008C 351 nt12.67□□□□□ -0.38
YJL171CP46992 MSF1YPR047W 1410 nt12.66□□□□□ -0.38
YJL171CP46992 YHL044WYHL044W 708 nt12.66□□□□□ -0.38
YJL171CP46992 URE2YNL229C 1065 nt12.66□□□□□ -0.38
YJL171CP46992 STB1YNL309W 1263 nt12.66□□□□□ -0.38
YJL171CP46992 CCT4YDL143W 1587 nt12.65□□□□□ -0.38
YJL171CP46992 YPL168WYPL168W 1293 nt12.64□□□□□ -0.39
YJL171CP46992 THI74YDR438W 1113 nt12.62□□□□□ -0.39
YJL171CP46992 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt12.62□□□□□ -0.39
YJL171CP46992 SPC25YER018C 666 nt12.61□□□□□ -0.39
YJL171CP46992 YHL050CYHL050C 2094 nt12.6□□□□□ -0.39
YJL171CP46992 MIR1YJR077C 936 nt12.6□□□□□ -0.39
YJL171CP46992 DDR2YOL052C-A 186 nt12.6□□□□□ -0.39
YJL171CP46992 SWC5YBR231C 912 nt12.59□□□□□ -0.39
YJL171CP46992 ATF2YGR177C 1608 nt12.59□□□□□ -0.39
YJL171CP46992 AST1YBL069W 1290 nt12.58□□□□□ -0.4
YJL171CP46992 VPS60YDR486C 690 nt12.57□□□□□ -0.4
YJL171CP46992 GPI16YHR188C 1833 nt12.55□□□□□ -0.4
YJL171CP46992 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt12.55□□□□□ -0.4
YJL171CP46992 ARA2YMR041C 1008 nt12.53□□□□□ -0.4
YJL171CP46992 YMR244WYMR244W 1068 nt12.53□□□□□ -0.4
YJL171CP46992 ALG3YBL082C 1377 nt12.53□□□□□ -0.4
YJL171CP46992 VPS75YNL246W 795 nt12.51□□□□□ -0.41
YJL171CP46992 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt12.49□□□□□ -0.41
YJL171CP46992 YFL067WYFL067W 528 nt12.49□□□□□ -0.41
YJL171CP46992 Q0182Q0182 405 nt12.49□□□□□ -0.41
YJL171CP46992 FEN2YCR028C 1539 nt12.47□□□□□ -0.41
YJL171CP46992 ERF2YLR246W 1080 nt12.47□□□□□ -0.41
YJL171CP46992 DAT1YML113W 747 nt12.47□□□□□ -0.41
YJL171CP46992 STD1YOR047C 1335 nt12.46□□□□□ -0.41
YJL171CP46992 PAU7YAR020C 168 nt12.44□□□□□ -0.42
YJL171CP46992 SPT8YLR055C 1809 nt12.44□□□□□ -0.42
YJL171CP46992 SKG1YKR100C 1068 nt12.43□□□□□ -0.42
YJL171CP46992 UTP6YDR449C 1323 nt12.41□□□□□ -0.42
YJL171CP46992 GLR1YPL091W 1452 nt12.4□□□□□ -0.42
YJL171CP46992 PUS9YDL036C 1389 nt12.4□□□□□ -0.42
YJL171CP46992 ANP1YEL036C 1503 nt12.39□□□□□ -0.43
YJL171CP46992 YGL034CYGL034C 366 nt12.39□□□□□ -0.43
YJL171CP46992 CRR1YLR213C 1269 nt12.39□□□□□ -0.43
YJL171CP46992 YIR016WYIR016W 798 nt12.36□□□□□ -0.43
YJL171CP46992 ABZ2YMR289W 1125 nt12.36□□□□□ -0.43
YJL171CP46992 SNG1YGR197C 1644 nt12.36□□□□□ -0.43
YJL171CP46992 MIC10YCL057C-A 294 nt12.35□□□□□ -0.43
YJL171CP46992 UBA4YHR111W 1323 nt12.35□□□□□ -0.43
YJL171CP46992 HAS1YMR290C 1518 nt12.32□□□□□ -0.44
YJL171CP46992 HEM12YDR047W 1089 nt12.32□□□□□ -0.44
YJL171CP46992 IRC14YOR135C 342 nt12.32□□□□□ -0.44
YJL171CP46992 GTT3YEL017W 1014 nt12.31□□□□□ -0.44
YJL171CP46992 TIM17YJL143W 477 nt12.31□□□□□ -0.44
YJL171CP46992 SHB17YKR043C 816 nt12.31□□□□□ -0.44
YJL171CP46992 NDI1YML120C 1542 nt12.31□□□□□ -0.44
YJL171CP46992 XYL2YLR070C 1071 nt12.3□□□□□ -0.44
YJL171CP46992 PEX27YOR193W 1131 nt12.3□□□□□ -0.44
YJL171CP46992 YSR3YKR053C 1215 nt12.29□□□□□ -0.44
YJL171CP46992 RBG1YAL036C 1110 nt12.28□□□□□ -0.44
YJL171CP46992 YLR122CYLR122C 378 nt12.28□□□□□ -0.44
YJL171CP46992 RBG2YGR173W 1107 nt12.27□□□□□ -0.45
YJL171CP46992 SEC11YIR022W 504 nt12.27□□□□□ -0.45
YJL171CP46992 SHM2YLR058C 1410 nt12.24□□□□□ -0.45
YJL171CP46992 LYS4YDR234W 2082 nt12.23□□□□□ -0.45
YJL171CP46992 NCP1YHR042W 2076 nt12.22□□□□□ -0.45
YJL171CP46992 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt12.22□□□□□ -0.45
YJL171CP46992 YDR010CYDR010C 333 nt12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 487.7 ms