Protein–RNA interactions for Protein: P40550

PDR11, ATP-dependent permease PDR11, yeastyeast

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Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR11P40550 STB1YNL309W 1263 nt15.26■□□□□ 0.03
PDR11P40550 AQY1YPR192W 918 nt15.24■□□□□ 0.03
PDR11P40550 YLR415CYLR415C 339 nt15.23■□□□□ 0.03
PDR11P40550 NAT4YMR069W 858 nt15.22■□□□□ 0.03
PDR11P40550 CCT4YDL143W 1587 nt15.22■□□□□ 0.03
PDR11P40550 ALG3YBL082C 1377 nt15.22■□□□□ 0.03
PDR11P40550 VPS60YDR486C 690 nt15.2■□□□□ 0.02
PDR11P40550 SPC25YER018C 666 nt15.17■□□□□ 0.02
PDR11P40550 MIR1YJR077C 936 nt15.17■□□□□ 0.02
PDR11P40550 SWC5YBR231C 912 nt15.17■□□□□ 0.02
PDR11P40550 GLK1YCL040W 1503 nt15.14■□□□□ 0.01
PDR11P40550 DDR2YOL052C-A 186 nt15.14■□□□□ 0.01
PDR11P40550 CRR1YLR213C 1269 nt15.12■□□□□ 0.01
PDR11P40550 MSF1YPR047W 1410 nt15.11■□□□□ 0.01
PDR11P40550 MIC10YCL057C-A 294 nt15.11■□□□□ 0.01
PDR11P40550 GPI16YHR188C 1833 nt15.1■□□□□ 0.01
PDR11P40550 BDF1YLR399C 2061 nt15.09■□□□□ 0.01
PDR11P40550 THI74YDR438W 1113 nt15.07■□□□□ 0
PDR11P40550 ERF2YLR246W 1080 nt15.07■□□□□ 0
PDR11P40550 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt15.03■□□□□ -0
PDR11P40550 FEN2YCR028C 1539 nt15.02■□□□□ -0
PDR11P40550 SNG1YGR197C 1644 nt15.02□□□□□ -0.01
PDR11P40550 YFL067WYFL067W 528 nt15.01□□□□□ -0.01
PDR11P40550 ANP1YEL036C 1503 nt15.01□□□□□ -0.01
PDR11P40550 VPS75YNL246W 795 nt14.99□□□□□ -0.01
PDR11P40550 SPT8YLR055C 1809 nt14.97□□□□□ -0.01
PDR11P40550 NCP1YHR042W 2076 nt14.96□□□□□ -0.01
PDR11P40550 LYS4YDR234W 2082 nt14.94□□□□□ -0.02
PDR11P40550 DAT1YML113W 747 nt14.93□□□□□ -0.02
PDR11P40550 TAT1YBR069C 1860 nt14.92□□□□□ -0.02
PDR11P40550 SEC11YIR022W 504 nt14.92□□□□□ -0.02
PDR11P40550 PCH2YBR186W 1695 nt14.91□□□□□ -0.02
PDR11P40550 HEM12YDR047W 1089 nt14.9□□□□□ -0.02
PDR11P40550 YMR244WYMR244W 1068 nt14.9□□□□□ -0.02
PDR11P40550 YIR016WYIR016W 798 nt14.86□□□□□ -0.03
PDR11P40550 SHB17YKR043C 816 nt14.83□□□□□ -0.04
PDR11P40550 PAU7YAR020C 168 nt14.83□□□□□ -0.04
PDR11P40550 GUT2YIL155C 1950 nt14.82□□□□□ -0.04
PDR11P40550 UBA4YHR111W 1323 nt14.79□□□□□ -0.04
PDR11P40550 SHM2YLR058C 1410 nt14.79□□□□□ -0.04
PDR11P40550 YGL034CYGL034C 366 nt14.78□□□□□ -0.04
PDR11P40550 TIM17YJL143W 477 nt14.78□□□□□ -0.04
PDR11P40550 SGT2YOR007C 1041 nt14.75□□□□□ -0.05
PDR11P40550 XYL2YLR070C 1071 nt14.74□□□□□ -0.05
PDR11P40550 XDJ1YLR090W 1380 nt14.73□□□□□ -0.05
PDR11P40550 GLR1YPL091W 1452 nt14.73□□□□□ -0.05
PDR11P40550 PIB2YGL023C 1908 nt14.72□□□□□ -0.05
PDR11P40550 YDR010CYDR010C 333 nt14.72□□□□□ -0.05
PDR11P40550 RBG1YAL036C 1110 nt14.7□□□□□ -0.06
PDR11P40550 YSR3YKR053C 1215 nt14.7□□□□□ -0.06
PDR11P40550 NIT1YIL164C 600 nt14.69□□□□□ -0.06
PDR11P40550 RTF1YGL244W 1677 nt14.68□□□□□ -0.06
PDR11P40550 NDI1YML120C 1542 nt14.67□□□□□ -0.06
PDR11P40550 BOP3YNL042W 1191 nt14.66□□□□□ -0.06
PDR11P40550 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt14.62□□□□□ -0.07
PDR11P40550 RBG2YGR173W 1107 nt14.58□□□□□ -0.07
PDR11P40550 PHO89YBR296C 1725 nt14.57□□□□□ -0.08
PDR11P40550 MIC12YBR262C 321 nt14.56□□□□□ -0.08
PDR11P40550 GDH3YAL062W 1374 nt14.55□□□□□ -0.08
PDR11P40550 BNA2YJR078W 1362 nt14.54□□□□□ -0.08
PDR11P40550 PTK1YKL198C 1989 nt14.5□□□□□ -0.09
PDR11P40550 RET2YFR051C 1641 nt14.5□□□□□ -0.09
PDR11P40550 DUT1YBR252W 444 nt14.46□□□□□ -0.09
PDR11P40550 AIM45YPR004C 1035 nt14.44□□□□□ -0.1
PDR11P40550 AVT6YER119C 1347 nt14.43□□□□□ -0.1
PDR11P40550 HHO1YPL127C 777 nt14.41□□□□□ -0.1
PDR11P40550 COQ2YNR041C 1119 nt14.41□□□□□ -0.1
PDR11P40550 RAX1YOR301W 1308 nt14.4□□□□□ -0.1
PDR11P40550 AGP1YCL025C 1902 nt14.38□□□□□ -0.11
PDR11P40550 SFA1YDL168W 1161 nt14.36□□□□□ -0.11
PDR11P40550 YGR201CYGR201C 678 nt14.35□□□□□ -0.11
PDR11P40550 YFL054CYFL054C 1941 nt14.34□□□□□ -0.11
PDR11P40550 YCR087WYCR087W 516 nt14.31□□□□□ -0.12
PDR11P40550 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt14.29□□□□□ -0.12
PDR11P40550 RAD51YER095W 1203 nt14.28□□□□□ -0.12
PDR11P40550 CCA1YER168C 1641 nt14.27□□□□□ -0.12
PDR11P40550 SHH4YLR164W 507 nt14.27□□□□□ -0.12
PDR11P40550 CAB5YDR196C 726 nt14.26□□□□□ -0.13
PDR11P40550 MRP20YDR405W 792 nt14.26□□□□□ -0.13
PDR11P40550 RPM1RPM1 483 nt14.25□□□□□ -0.13
PDR11P40550 SAM1YLR180W 1149 nt14.23□□□□□ -0.13
PDR11P40550 GOR1YNL274C 1053 nt14.2□□□□□ -0.14
PDR11P40550 SDH5YOL071W 489 nt14.15□□□□□ -0.14
PDR11P40550 YLR111WYLR111W 333 nt14.13□□□□□ -0.15
PDR11P40550 YCR102CYCR102C 1107 nt14.12□□□□□ -0.15
PDR11P40550 YMR226CYMR226C 804 nt14.1□□□□□ -0.15
PDR11P40550 RPS14BYJL191W 417 nt14.09□□□□□ -0.15
PDR11P40550 TOM6YOR045W 186 nt14.07□□□□□ -0.16
PDR11P40550 SWE1YJL187C 2460 nt14.07□□□□□ -0.16
PDR11P40550 PEX2YJL210W 816 nt14.06□□□□□ -0.16
PDR11P40550 RPL4BYDR012W 1089 nt14.04□□□□□ -0.16
PDR11P40550 RPL4AYBR031W 1089 nt14.04□□□□□ -0.16
PDR11P40550 NBP35YGL091C 987 nt14.01□□□□□ -0.17
PDR11P40550 AQY2YLL052C 450 nt13.99□□□□□ -0.17
PDR11P40550 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt13.98□□□□□ -0.17
PDR11P40550 DUS1YML080W 1272 nt13.98□□□□□ -0.17
PDR11P40550 RDN18-1RDN18-1 1800 nt13.97□□□□□ -0.17
PDR11P40550 RDN18-2RDN18-2 1800 nt13.97□□□□□ -0.17
PDR11P40550 YNR029CYNR029C 1290 nt13.96□□□□□ -0.18
PDR11P40550 TIR3YIL011W 810 nt13.94□□□□□ -0.18
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