Protein–RNA interactions for Protein: P40479

SDP1, Dual-specificity protein phosphatase SDP1, yeastyeast

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SDP1P40479 DDR2YOL052C-A 186 nt9.82□□□□□ -0.84
SDP1P40479 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.8□□□□□ -0.84
SDP1P40479 YLR235CYLR235C 399 nt9.8□□□□□ -0.84
SDP1P40479 ANP1YEL036C 1503 nt9.78□□□□□ -0.84
SDP1P40479 HSP60YLR259C 1719 nt9.76□□□□□ -0.85
SDP1P40479 PTH1YHR189W 573 nt9.75□□□□□ -0.85
SDP1P40479 TIM23YNR017W 669 nt9.75□□□□□ -0.85
SDP1P40479 SPP1YPL138C 1062 nt9.75□□□□□ -0.85
SDP1P40479 CCA1YER168C 1641 nt9.74□□□□□ -0.85
SDP1P40479 SPC25YER018C 666 nt9.74□□□□□ -0.85
SDP1P40479 STB1YNL309W 1263 nt9.72□□□□□ -0.85
SDP1P40479 GLK1YCL040W 1503 nt9.71□□□□□ -0.86
SDP1P40479 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.7□□□□□ -0.86
SDP1P40479 YLR179CYLR179C 606 nt9.7□□□□□ -0.86
SDP1P40479 BNA2YJR078W 1362 nt9.69□□□□□ -0.86
SDP1P40479 FUR4YBR021W 1902 nt9.69□□□□□ -0.86
SDP1P40479 MIC12YBR262C 321 nt9.69□□□□□ -0.86
SDP1P40479 GPI16YHR188C 1833 nt9.68□□□□□ -0.86
SDP1P40479 FEN2YCR028C 1539 nt9.67□□□□□ -0.86
SDP1P40479 AHT1YHR093W 549 nt9.66□□□□□ -0.86
SDP1P40479 YKL030WYKL030W 606 nt9.65□□□□□ -0.86
SDP1P40479 WSC2YNL283C 1512 nt9.64□□□□□ -0.87
SDP1P40479 RPM1RPM1 483 nt9.63□□□□□ -0.87
SDP1P40479 CCT4YDL143W 1587 nt9.62□□□□□ -0.87
SDP1P40479 VPS60YDR486C 690 nt9.6□□□□□ -0.87
SDP1P40479 YIR016WYIR016W 798 nt9.6□□□□□ -0.87
SDP1P40479 YPR064WYPR064W 420 nt9.6□□□□□ -0.87
SDP1P40479 AGP1YCL025C 1902 nt9.56□□□□□ -0.88
SDP1P40479 HHO1YPL127C 777 nt9.56□□□□□ -0.88
SDP1P40479 ALG3YBL082C 1377 nt9.55□□□□□ -0.88
SDP1P40479 PRP4YPR178W 1398 nt9.55□□□□□ -0.88
SDP1P40479 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.55□□□□□ -0.88
SDP1P40479 YEL076CYEL076C 651 nt9.55□□□□□ -0.88
SDP1P40479 YLR464WYLR464W 651 nt9.55□□□□□ -0.88
SDP1P40479 YGR201CYGR201C 678 nt9.54□□□□□ -0.88
SDP1P40479 SWC5YBR231C 912 nt9.54□□□□□ -0.88
SDP1P40479 ALG12YNR030W 1656 nt9.54□□□□□ -0.88
SDP1P40479 TAD3YLR316C 969 nt9.53□□□□□ -0.88
SDP1P40479 YCL074WYCL074W 927 nt9.51□□□□□ -0.89
SDP1P40479 DPS1YLL018C 1674 nt9.5□□□□□ -0.89
SDP1P40479 RTG1YOL067C 534 nt9.49□□□□□ -0.89
SDP1P40479 DUS1YML080W 1272 nt9.48□□□□□ -0.89
SDP1P40479 YKR005CYKR005C 1578 nt9.47□□□□□ -0.89
SDP1P40479 AAC1YMR056C 930 nt9.47□□□□□ -0.89
SDP1P40479 BMT6YLR063W 1098 nt9.46□□□□□ -0.9
SDP1P40479 XDJ1YLR090W 1380 nt9.46□□□□□ -0.9
SDP1P40479 UME6YDR207C 2511 nt9.45□□□□□ -0.9
SDP1P40479 BDH1YAL060W 1149 nt9.41□□□□□ -0.9
SDP1P40479 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.39□□□□□ -0.91
SDP1P40479 YGR259CYGR259C 441 nt9.39□□□□□ -0.91
SDP1P40479 YLR415CYLR415C 339 nt9.38□□□□□ -0.91
SDP1P40479 STR3YGL184C 1398 nt9.37□□□□□ -0.91
SDP1P40479 CSM2YIL132C 642 nt9.37□□□□□ -0.91
SDP1P40479 GDH3YAL062W 1374 nt9.37□□□□□ -0.91
SDP1P40479 GOR1YNL274C 1053 nt9.36□□□□□ -0.91
SDP1P40479 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.35□□□□□ -0.91
SDP1P40479 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.35□□□□□ -0.91
SDP1P40479 AVT6YER119C 1347 nt9.35□□□□□ -0.91
SDP1P40479 IRC24YIR036C 792 nt9.35□□□□□ -0.91
SDP1P40479 DUT1YBR252W 444 nt9.35□□□□□ -0.91
SDP1P40479 HUA1YGR268C 597 nt9.34□□□□□ -0.91
SDP1P40479 SNF1YDR477W 1902 nt9.33□□□□□ -0.92
SDP1P40479 MCH5YOR306C 1566 nt9.31□□□□□ -0.92
SDP1P40479 SHM2YLR058C 1410 nt9.31□□□□□ -0.92
SDP1P40479 YSP3YOR003W 1437 nt9.31□□□□□ -0.92
SDP1P40479 MRPL8YJL063C 717 nt9.3□□□□□ -0.92
SDP1P40479 TIM17YJL143W 477 nt9.29□□□□□ -0.92
SDP1P40479 BIO5YNR056C 1686 nt9.28□□□□□ -0.92
SDP1P40479 RTN2YDL204W 1182 nt9.26□□□□□ -0.93
SDP1P40479 AQY2YLL052C 450 nt9.26□□□□□ -0.93
SDP1P40479 DAT1YML113W 747 nt9.26□□□□□ -0.93
SDP1P40479 ADO1YJR105W 1023 nt9.25□□□□□ -0.93
SDP1P40479 MET8YBR213W 825 nt9.25□□□□□ -0.93
SDP1P40479 NAR1YNL240C 1476 nt9.23□□□□□ -0.93
SDP1P40479 NIT1YIL164C 600 nt9.22□□□□□ -0.93
SDP1P40479 PBP1YGR178C 2169 nt9.21□□□□□ -0.94
SDP1P40479 YNL115CYNL115C 1935 nt9.18□□□□□ -0.94
SDP1P40479 PEX25YPL112C 1185 nt9.18□□□□□ -0.94
SDP1P40479 YCR102CYCR102C 1107 nt9.17□□□□□ -0.94
SDP1P40479 CLB6YGR109C 1143 nt9.17□□□□□ -0.94
SDP1P40479 CYT2YKL087C 675 nt9.17□□□□□ -0.94
SDP1P40479 NBP35YGL091C 987 nt9.16□□□□□ -0.94
SDP1P40479 SGT2YOR007C 1041 nt9.15□□□□□ -0.94
SDP1P40479 VPS75YNL246W 795 nt9.14□□□□□ -0.95
SDP1P40479 ARP6YLR085C 1317 nt9.12□□□□□ -0.95
SDP1P40479 PLB1YMR008C 1995 nt9.08□□□□□ -0.96
SDP1P40479 YFR018CYFR018C 1092 nt9.07□□□□□ -0.96
SDP1P40479 YFL066CYFL066C 1179 nt9.05□□□□□ -0.96
SDP1P40479 FRE6YLL051C 2139 nt9.04□□□□□ -0.96
SDP1P40479 LSC2YGR244C 1284 nt9.03□□□□□ -0.96
SDP1P40479 TIR3YIL011W 810 nt9.02□□□□□ -0.97
SDP1P40479 PAU21YOR394W 495 nt8.99□□□□□ -0.97
SDP1P40479 PAU22YPL282C 495 nt8.99□□□□□ -0.97
SDP1P40479 ALD4YOR374W 1560 nt8.96□□□□□ -0.97
SDP1P40479 PRM5YIL117C 957 nt8.95□□□□□ -0.98
SDP1P40479 HIF1YLL022C 1158 nt8.95□□□□□ -0.98
SDP1P40479 PAU7YAR020C 168 nt8.95□□□□□ -0.98
SDP1P40479 GAP1YKR039W 1809 nt8.95□□□□□ -0.98
SDP1P40479 UTR1YJR049C 1593 nt8.94□□□□□ -0.98
SDP1P40479 SHH4YLR164W 507 nt8.92□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.4 ms