Protein–RNA interactions for Protein: P40157

VID27, Vacuolar import and degradation protein 27, yeastyeast

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Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VID27P40157 GUT2YIL155C 1950 nt12.61□□□□□ -0.39
VID27P40157 RRT5YFR032C 870 nt12.6□□□□□ -0.39
VID27P40157 BDH1YAL060W 1149 nt12.59□□□□□ -0.39
VID27P40157 ERF2YLR246W 1080 nt12.59□□□□□ -0.39
VID27P40157 STB1YNL309W 1263 nt12.59□□□□□ -0.39
VID27P40157 SPC25YER018C 666 nt12.58□□□□□ -0.4
VID27P40157 NVJ2YPR091C 2313 nt12.57□□□□□ -0.4
VID27P40157 YFL066CYFL066C 1179 nt12.57□□□□□ -0.4
VID27P40157 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt12.55□□□□□ -0.4
VID27P40157 YFL067WYFL067W 528 nt12.55□□□□□ -0.4
VID27P40157 CRR1YLR213C 1269 nt12.55□□□□□ -0.4
VID27P40157 DDR2YOL052C-A 186 nt12.55□□□□□ -0.4
VID27P40157 CCT4YDL143W 1587 nt12.55□□□□□ -0.4
VID27P40157 YSP3YOR003W 1437 nt12.54□□□□□ -0.4
VID27P40157 PEX25YPL112C 1185 nt12.54□□□□□ -0.4
VID27P40157 LYS4YDR234W 2082 nt12.5□□□□□ -0.41
VID27P40157 GPI16YHR188C 1833 nt12.5□□□□□ -0.41
VID27P40157 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt12.49□□□□□ -0.41
VID27P40157 VPS60YDR486C 690 nt12.49□□□□□ -0.41
VID27P40157 YLR415CYLR415C 339 nt12.49□□□□□ -0.41
VID27P40157 PIB2YGL023C 1908 nt12.49□□□□□ -0.41
VID27P40157 YNL115CYNL115C 1935 nt12.48□□□□□ -0.41
VID27P40157 BOP3YNL042W 1191 nt12.47□□□□□ -0.41
VID27P40157 RTF1YGL244W 1677 nt12.46□□□□□ -0.41
VID27P40157 ALG3YBL082C 1377 nt12.45□□□□□ -0.42
VID27P40157 SNG1YGR197C 1644 nt12.45□□□□□ -0.42
VID27P40157 ANP1YEL036C 1503 nt12.45□□□□□ -0.42
VID27P40157 FEN2YCR028C 1539 nt12.44□□□□□ -0.42
VID27P40157 SWC5YBR231C 912 nt12.44□□□□□ -0.42
VID27P40157 MIC10YCL057C-A 294 nt12.43□□□□□ -0.42
VID27P40157 HEM12YDR047W 1089 nt12.41□□□□□ -0.42
VID27P40157 SBA1YKL117W 651 nt12.36□□□□□ -0.43
VID27P40157 YIR016WYIR016W 798 nt12.32□□□□□ -0.44
VID27P40157 SPT8YLR055C 1809 nt12.31□□□□□ -0.44
VID27P40157 PTK1YKL198C 1989 nt12.3□□□□□ -0.44
VID27P40157 NAT4YMR069W 858 nt12.28□□□□□ -0.44
VID27P40157 VPS75YNL246W 795 nt12.28□□□□□ -0.44
VID27P40157 MIR1YJR077C 936 nt12.25□□□□□ -0.45
VID27P40157 GLK1YCL040W 1503 nt12.25□□□□□ -0.45
VID27P40157 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt12.22□□□□□ -0.45
VID27P40157 MSF1YPR047W 1410 nt12.2□□□□□ -0.46
VID27P40157 THI74YDR438W 1113 nt12.19□□□□□ -0.46
VID27P40157 TIM17YJL143W 477 nt12.17□□□□□ -0.46
VID27P40157 SHM2YLR058C 1410 nt12.15□□□□□ -0.46
VID27P40157 MIC12YBR262C 321 nt12.15□□□□□ -0.46
VID27P40157 BNA2YJR078W 1362 nt12.14□□□□□ -0.47
VID27P40157 XDJ1YLR090W 1380 nt12.13□□□□□ -0.47
VID27P40157 RAX1YOR301W 1308 nt12.11□□□□□ -0.47
VID27P40157 YFL054CYFL054C 1941 nt12.09□□□□□ -0.47
VID27P40157 PAU7YAR020C 168 nt12.09□□□□□ -0.47
VID27P40157 DAT1YML113W 747 nt12.08□□□□□ -0.48
VID27P40157 NIT1YIL164C 600 nt12.05□□□□□ -0.48
VID27P40157 GDH3YAL062W 1374 nt12.05□□□□□ -0.48
VID27P40157 SHB17YKR043C 816 nt12.03□□□□□ -0.48
VID27P40157 SGT2YOR007C 1041 nt12.03□□□□□ -0.48
VID27P40157 HHO1YPL127C 777 nt12.02□□□□□ -0.49
VID27P40157 UBA4YHR111W 1323 nt12.02□□□□□ -0.49
VID27P40157 YGR201CYGR201C 678 nt12□□□□□ -0.49
VID27P40157 YDR010CYDR010C 333 nt11.98□□□□□ -0.49
VID27P40157 YGL034CYGL034C 366 nt11.98□□□□□ -0.49
VID27P40157 YSR3YKR053C 1215 nt11.93□□□□□ -0.5
VID27P40157 AVT6YER119C 1347 nt11.91□□□□□ -0.5
VID27P40157 AGP1YCL025C 1902 nt11.9□□□□□ -0.5
VID27P40157 CCA1YER168C 1641 nt11.89□□□□□ -0.51
VID27P40157 XYL2YLR070C 1071 nt11.89□□□□□ -0.51
VID27P40157 YMR244WYMR244W 1068 nt11.88□□□□□ -0.51
VID27P40157 RET2YFR051C 1641 nt11.87□□□□□ -0.51
VID27P40157 DUT1YBR252W 444 nt11.87□□□□□ -0.51
VID27P40157 SWE1YJL187C 2460 nt11.85□□□□□ -0.51
VID27P40157 PHO89YBR296C 1725 nt11.84□□□□□ -0.51
VID27P40157 GOR1YNL274C 1053 nt11.83□□□□□ -0.52
VID27P40157 GLR1YPL091W 1452 nt11.83□□□□□ -0.52
VID27P40157 RBG1YAL036C 1110 nt11.81□□□□□ -0.52
VID27P40157 NDI1YML120C 1542 nt11.81□□□□□ -0.52
VID27P40157 YCR087WYCR087W 516 nt11.77□□□□□ -0.53
VID27P40157 YCR102CYCR102C 1107 nt11.76□□□□□ -0.53
VID27P40157 AIM45YPR004C 1035 nt11.75□□□□□ -0.53
VID27P40157 SFA1YDL168W 1161 nt11.72□□□□□ -0.53
VID27P40157 COQ2YNR041C 1119 nt11.72□□□□□ -0.53
VID27P40157 UME6YDR207C 2511 nt11.69□□□□□ -0.54
VID27P40157 BOR1YNL275W 1731 nt11.69□□□□□ -0.54
VID27P40157 MRP20YDR405W 792 nt11.68□□□□□ -0.54
VID27P40157 YJL225CYJL225C 5277 nt11.67□□□□□ -0.54
VID27P40157 NBP35YGL091C 987 nt11.65□□□□□ -0.54
VID27P40157 RBG2YGR173W 1107 nt11.65□□□□□ -0.54
VID27P40157 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt11.65□□□□□ -0.54
VID27P40157 SHH4YLR164W 507 nt11.64□□□□□ -0.55
VID27P40157 DUS1YML080W 1272 nt11.64□□□□□ -0.55
VID27P40157 STR3YGL184C 1398 nt11.61□□□□□ -0.55
VID27P40157 TIR3YIL011W 810 nt11.58□□□□□ -0.56
VID27P40157 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.58□□□□□ -0.56
VID27P40157 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.58□□□□□ -0.56
VID27P40157 AQY2YLL052C 450 nt11.56□□□□□ -0.56
VID27P40157 RPL4BYDR012W 1089 nt11.54□□□□□ -0.56
VID27P40157 RPL4AYBR031W 1089 nt11.54□□□□□ -0.56
VID27P40157 YCL074WYCL074W 927 nt11.53□□□□□ -0.56
VID27P40157 YMR226CYMR226C 804 nt11.52□□□□□ -0.57
VID27P40157 TOM6YOR045W 186 nt11.52□□□□□ -0.57
VID27P40157 POM34YLR018C 900 nt11.51□□□□□ -0.57
VID27P40157 RPS14BYJL191W 417 nt11.5□□□□□ -0.57
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