Protein–RNA interactions for Protein: P36012

CSE4, Histone H3-like centromeric protein CSE4, yeastyeast

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE4P36012 TRM5YHR070W 1500 nt14.35□□□□□ -0.11
CSE4P36012 YNL115CYNL115C 1935 nt14.35□□□□□ -0.11
CSE4P36012 SEC11YIR022W 504 nt14.31□□□□□ -0.12
CSE4P36012 SPC25YER018C 666 nt14.3□□□□□ -0.12
CSE4P36012 YLR415CYLR415C 339 nt14.3□□□□□ -0.12
CSE4P36012 NAT4YMR069W 858 nt14.3□□□□□ -0.12
CSE4P36012 STB1YNL309W 1263 nt14.3□□□□□ -0.12
CSE4P36012 PCH2YBR186W 1695 nt14.3□□□□□ -0.12
CSE4P36012 CCT4YDL143W 1587 nt14.27□□□□□ -0.12
CSE4P36012 GUT2YIL155C 1950 nt14.25□□□□□ -0.13
CSE4P36012 ATF2YGR177C 1608 nt14.24□□□□□ -0.13
CSE4P36012 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt14.23□□□□□ -0.13
CSE4P36012 GLK1YCL040W 1503 nt14.21□□□□□ -0.13
CSE4P36012 DDR2YOL052C-A 186 nt14.2□□□□□ -0.14
CSE4P36012 GPI16YHR188C 1833 nt14.19□□□□□ -0.14
CSE4P36012 MSF1YPR047W 1410 nt14.17□□□□□ -0.14
CSE4P36012 VPS60YDR486C 690 nt14.17□□□□□ -0.14
CSE4P36012 YFL067WYFL067W 528 nt14.17□□□□□ -0.14
CSE4P36012 MIR1YJR077C 936 nt14.17□□□□□ -0.14
CSE4P36012 ERF2YLR246W 1080 nt14.17□□□□□ -0.14
CSE4P36012 PIB2YGL023C 1908 nt14.15□□□□□ -0.14
CSE4P36012 SWC5YBR231C 912 nt14.15□□□□□ -0.14
CSE4P36012 NCP1YHR042W 2076 nt14.13□□□□□ -0.15
CSE4P36012 ALG3YBL082C 1377 nt14.13□□□□□ -0.15
CSE4P36012 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt14.13□□□□□ -0.15
CSE4P36012 THI74YDR438W 1113 nt14.12□□□□□ -0.15
CSE4P36012 VPS75YNL246W 795 nt14.12□□□□□ -0.15
CSE4P36012 NME1NME1 340 nt14.12□□□□□ -0.15
CSE4P36012 CRR1YLR213C 1269 nt14.11□□□□□ -0.15
CSE4P36012 FEN2YCR028C 1539 nt14.09□□□□□ -0.15
CSE4P36012 YGR139WYGR139W 339 nt14.08□□□□□ -0.16
CSE4P36012 ANP1YEL036C 1503 nt14.07□□□□□ -0.16
CSE4P36012 SPT8YLR055C 1809 nt14.04□□□□□ -0.16
CSE4P36012 SNG1YGR197C 1644 nt14.01□□□□□ -0.17
CSE4P36012 RTF1YGL244W 1677 nt14□□□□□ -0.17
CSE4P36012 DAT1YML113W 747 nt13.97□□□□□ -0.17
CSE4P36012 YMR244WYMR244W 1068 nt13.97□□□□□ -0.17
CSE4P36012 MIC10YCL057C-A 294 nt13.97□□□□□ -0.17
CSE4P36012 YIR016WYIR016W 798 nt13.96□□□□□ -0.17
CSE4P36012 HEM12YDR047W 1089 nt13.95□□□□□ -0.18
CSE4P36012 BOP3YNL042W 1191 nt13.95□□□□□ -0.18
CSE4P36012 LYS4YDR234W 2082 nt13.95□□□□□ -0.18
CSE4P36012 PAU7YAR020C 168 nt13.89□□□□□ -0.19
CSE4P36012 PTK1YKL198C 1989 nt13.89□□□□□ -0.19
CSE4P36012 YGL034CYGL034C 366 nt13.86□□□□□ -0.19
CSE4P36012 TIM17YJL143W 477 nt13.86□□□□□ -0.19
CSE4P36012 UBA4YHR111W 1323 nt13.86□□□□□ -0.19
CSE4P36012 GLR1YPL091W 1452 nt13.83□□□□□ -0.2
CSE4P36012 SHB17YKR043C 816 nt13.82□□□□□ -0.2
CSE4P36012 SHM2YLR058C 1410 nt13.8□□□□□ -0.2
CSE4P36012 YDR010CYDR010C 333 nt13.75□□□□□ -0.21
CSE4P36012 YSR3YKR053C 1215 nt13.75□□□□□ -0.21
CSE4P36012 XDJ1YLR090W 1380 nt13.74□□□□□ -0.21
CSE4P36012 XYL2YLR070C 1071 nt13.72□□□□□ -0.21
CSE4P36012 NDI1YML120C 1542 nt13.71□□□□□ -0.21
CSE4P36012 NIT1YIL164C 600 nt13.7□□□□□ -0.22
CSE4P36012 SGT2YOR007C 1041 nt13.7□□□□□ -0.22
CSE4P36012 RBG2YGR173W 1107 nt13.69□□□□□ -0.22
CSE4P36012 RBG1YAL036C 1110 nt13.67□□□□□ -0.22
CSE4P36012 MIC12YBR262C 321 nt13.67□□□□□ -0.22
CSE4P36012 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt13.66□□□□□ -0.22
CSE4P36012 BNA2YJR078W 1362 nt13.64□□□□□ -0.23
CSE4P36012 GDH3YAL062W 1374 nt13.63□□□□□ -0.23
CSE4P36012 RET2YFR051C 1641 nt13.61□□□□□ -0.23
CSE4P36012 PHO89YBR296C 1725 nt13.6□□□□□ -0.23
CSE4P36012 RAX1YOR301W 1308 nt13.56□□□□□ -0.24
CSE4P36012 YFL054CYFL054C 1941 nt13.56□□□□□ -0.24
CSE4P36012 YCR087WYCR087W 516 nt13.55□□□□□ -0.24
CSE4P36012 AIM45YPR004C 1035 nt13.54□□□□□ -0.24
CSE4P36012 YGR201CYGR201C 678 nt13.53□□□□□ -0.24
CSE4P36012 HHO1YPL127C 777 nt13.52□□□□□ -0.25
CSE4P36012 YMR226CYMR226C 804 nt13.46□□□□□ -0.25
CSE4P36012 AVT6YER119C 1347 nt13.45□□□□□ -0.26
CSE4P36012 COQ2YNR041C 1119 nt13.44□□□□□ -0.26
CSE4P36012 MRP20YDR405W 792 nt13.41□□□□□ -0.26
CSE4P36012 SFA1YDL168W 1161 nt13.39□□□□□ -0.27
CSE4P36012 SAM1YLR180W 1149 nt13.34□□□□□ -0.27
CSE4P36012 GOR1YNL274C 1053 nt13.34□□□□□ -0.27
CSE4P36012 DUT1YBR252W 444 nt13.34□□□□□ -0.27
CSE4P36012 YCR102CYCR102C 1107 nt13.32□□□□□ -0.28
CSE4P36012 SWE1YJL187C 2460 nt13.31□□□□□ -0.28
CSE4P36012 AGP1YCL025C 1902 nt13.31□□□□□ -0.28
CSE4P36012 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt13.28□□□□□ -0.28
CSE4P36012 YLR111WYLR111W 333 nt13.26□□□□□ -0.29
CSE4P36012 RPL4BYDR012W 1089 nt13.24□□□□□ -0.29
CSE4P36012 RPL4AYBR031W 1089 nt13.24□□□□□ -0.29
CSE4P36012 CCA1YER168C 1641 nt13.23□□□□□ -0.29
CSE4P36012 SHH4YLR164W 507 nt13.2□□□□□ -0.3
CSE4P36012 RPS14BYJL191W 417 nt13.19□□□□□ -0.3
CSE4P36012 NBP35YGL091C 987 nt13.17□□□□□ -0.3
CSE4P36012 RAD51YER095W 1203 nt13.15□□□□□ -0.3
CSE4P36012 SDH5YOL071W 489 nt13.15□□□□□ -0.3
CSE4P36012 CLB6YGR109C 1143 nt13.14□□□□□ -0.31
CSE4P36012 TIR3YIL011W 810 nt13.13□□□□□ -0.31
CSE4P36012 RAD23YEL037C 1197 nt13.12□□□□□ -0.31
CSE4P36012 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt13.12□□□□□ -0.31
CSE4P36012 CAB5YDR196C 726 nt13.11□□□□□ -0.31
CSE4P36012 TOM6YOR045W 186 nt13.1□□□□□ -0.31
CSE4P36012 PAC11YDR488C 1602 nt13.09□□□□□ -0.31
CSE4P36012 UTH1YKR042W 1098 nt13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.4 ms