Protein–RNA interactions for Protein: P35736

YKL050C, Uncharacterized protein YKL050C, yeast

Predictions only

Length 922 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL050C	P35736	RDN37-2	RDN37-2	5354 nt		11.64	□□□□□ -0.55
YKL050C	P35736	WSC2	YNL283C	1512 nt		11.62	□□□□□ -0.55
YKL050C	P35736	YHR056W-A	YHR056W-A	435 nt		11.62	□□□□□ -0.55
YKL050C	P35736	YDL086C-A	YDL086C-A	435 nt		11.6	□□□□□ -0.55
YKL050C	P35736	YEL076C-A	YEL076C-A	651 nt		11.6	□□□□□ -0.55
YKL050C	P35736	YEL076C	YEL076C	651 nt		11.6	□□□□□ -0.55
YKL050C	P35736	AHT1	YHR093W	549 nt		11.6	□□□□□ -0.55
YKL050C	P35736	YLR464W	YLR464W	651 nt		11.6	□□□□□ -0.55
YKL050C	P35736	STB1	YNL309W	1263 nt		11.59	□□□□□ -0.55
YKL050C	P35736	SPC25	YER018C	666 nt		11.58	□□□□□ -0.56
YKL050C	P35736	ANP1	YEL036C	1503 nt		11.58	□□□□□ -0.56
YKL050C	P35736	SWE1	YJL187C	2460 nt		11.57	□□□□□ -0.56
YKL050C	P35736	YDR524C-B	YDR524C-B	201 nt		11.56	□□□□□ -0.56
YKL050C	P35736	MRPL8	YJL063C	717 nt		11.55	□□□□□ -0.56
YKL050C	P35736	YPR064W	YPR064W	420 nt		11.54	□□□□□ -0.56
YKL050C	P35736	YJL225C	YJL225C	5277 nt		11.51	□□□□□ -0.57
YKL050C	P35736	FEN2	YCR028C	1539 nt		11.5	□□□□□ -0.57
YKL050C	P35736	GPI16	YHR188C	1833 nt		11.5	□□□□□ -0.57
YKL050C	P35736	RAX1	YOR301W	1308 nt		11.5	□□□□□ -0.57
YKL050C	P35736	CCT4	YDL143W	1587 nt		11.49	□□□□□ -0.57
YKL050C	P35736	VPS60	YDR486C	690 nt		11.48	□□□□□ -0.57
YKL050C	P35736	HUA1	YGR268C	597 nt		11.48	□□□□□ -0.57
YKL050C	P35736	TAD3	YLR316C	969 nt		11.48	□□□□□ -0.57
YKL050C	P35736	ADO1	YJR105W	1023 nt		11.45	□□□□□ -0.58
YKL050C	P35736	ALG3	YBL082C	1377 nt		11.44	□□□□□ -0.58
YKL050C	P35736	MIC12	YBR262C	321 nt		11.42	□□□□□ -0.58
YKL050C	P35736	YIR016W	YIR016W	798 nt		11.41	□□□□□ -0.58
YKL050C	P35736	CCA1	YER168C	1641 nt		11.41	□□□□□ -0.58
YKL050C	P35736	tL(GAG)G	tL(GAG)G	82 nt		11.4	□□□□□ -0.58
YKL050C	P35736	BNA2	YJR078W	1362 nt		11.4	□□□□□ -0.59
YKL050C	P35736	SWC5	YBR231C	912 nt		11.39	□□□□□ -0.59
YKL050C	P35736	BDH1	YAL060W	1149 nt		11.36	□□□□□ -0.59
YKL050C	P35736	AGP1	YCL025C	1902 nt		11.29	□□□□□ -0.6
YKL050C	P35736	YLR415C	YLR415C	339 nt		11.28	□□□□□ -0.6
YKL050C	P35736	RPM1	RPM1	483 nt		11.27	□□□□□ -0.61
YKL050C	P35736	YSP3	YOR003W	1437 nt		11.26	□□□□□ -0.61
YKL050C	P35736	HHO1	YPL127C	777 nt		11.26	□□□□□ -0.61
YKL050C	P35736	YGR201C	YGR201C	678 nt		11.22	□□□□□ -0.61
YKL050C	P35736	XDJ1	YLR090W	1380 nt		11.2	□□□□□ -0.62
YKL050C	P35736	FUR4	YBR021W	1902 nt		11.2	□□□□□ -0.62
YKL050C	P35736	BOR1	YNL275W	1731 nt		11.2	□□□□□ -0.62
YKL050C	P35736	HSP60	YLR259C	1719 nt		11.17	□□□□□ -0.62
YKL050C	P35736	YNL115C	YNL115C	1935 nt		11.15	□□□□□ -0.62
YKL050C	P35736	PEX25	YPL112C	1185 nt		11.15	□□□□□ -0.62
YKL050C	P35736	SHM2	YLR058C	1410 nt		11.13	□□□□□ -0.63
YKL050C	P35736	DUT1	YBR252W	444 nt		11.13	□□□□□ -0.63
YKL050C	P35736	GLK1	YCL040W	1503 nt		11.13	□□□□□ -0.63
YKL050C	P35736	GDH3	YAL062W	1374 nt		11.13	□□□□□ -0.63
YKL050C	P35736	YFL066C	YFL066C	1179 nt		11.12	□□□□□ -0.63
YKL050C	P35736	YFR018C	YFR018C	1092 nt		11.12	□□□□□ -0.63
YKL050C	P35736	TIM17	YJL143W	477 nt		11.1	□□□□□ -0.63
YKL050C	P35736	DUS1	YML080W	1272 nt		11.1	□□□□□ -0.63
YKL050C	P35736	UME6	YDR207C	2511 nt		11.1	□□□□□ -0.63
YKL050C	P35736	AVT6	YER119C	1347 nt		11.09	□□□□□ -0.63
YKL050C	P35736	YDR094W	YDR094W	336 nt		11.08	□□□□□ -0.64
YKL050C	P35736	PRE6	YOL038W	765 nt		11.08	□□□□□ -0.64
YKL050C	P35736	UBX6	YJL048C	1191 nt		11.07	□□□□□ -0.64
YKL050C	P35736	YCL074W	YCL074W	927 nt		11.06	□□□□□ -0.64
YKL050C	P35736	NIT1	YIL164C	600 nt		11.05	□□□□□ -0.64
YKL050C	P35736	GOR1	YNL274C	1053 nt		11.04	□□□□□ -0.64
YKL050C	P35736	RDN18-1	RDN18-1	1800 nt		11.02	□□□□□ -0.65
YKL050C	P35736	RDN18-2	RDN18-2	1800 nt		11.02	□□□□□ -0.65
YKL050C	P35736	VPS75	YNL246W	795 nt		11.01	□□□□□ -0.65
YKL050C	P35736	STR3	YGL184C	1398 nt		11.01	□□□□□ -0.65
YKL050C	P35736	SGT2	YOR007C	1041 nt		10.99	□□□□□ -0.65
YKL050C	P35736	PRP4	YPR178W	1398 nt		10.98	□□□□□ -0.65
YKL050C	P35736	DAT1	YML113W	747 nt		10.97	□□□□□ -0.65
YKL050C	P35736	YKR005C	YKR005C	1578 nt		10.95	□□□□□ -0.66
YKL050C	P35736	RRT5	YFR032C	870 nt		10.93	□□□□□ -0.66
YKL050C	P35736	AQY2	YLL052C	450 nt		10.92	□□□□□ -0.66
YKL050C	P35736	DPS1	YLL018C	1674 nt		10.92	□□□□□ -0.66
YKL050C	P35736	PAU16	YKL224C	372 nt		10.91	□□□□□ -0.66
YKL050C	P35736	YGR259C	YGR259C	441 nt		10.88	□□□□□ -0.67
YKL050C	P35736	YCR102C	YCR102C	1107 nt		10.86	□□□□□ -0.67
YKL050C	P35736	NBP35	YGL091C	987 nt		10.85	□□□□□ -0.67
YKL050C	P35736	ALG12	YNR030W	1656 nt		10.85	□□□□□ -0.67
YKL050C	P35736	BMT6	YLR063W	1098 nt		10.84	□□□□□ -0.67
YKL050C	P35736	FRE6	YLL051C	2139 nt		10.83	□□□□□ -0.68
YKL050C	P35736	AAC1	YMR056C	930 nt		10.83	□□□□□ -0.68
YKL050C	P35736	MIR1	YJR077C	936 nt		10.82	□□□□□ -0.68
YKL050C	P35736	PAU7	YAR020C	168 nt		10.81	□□□□□ -0.68
YKL050C	P35736	RTN2	YDL204W	1182 nt		10.8	□□□□□ -0.68
YKL050C	P35736	SNF1	YDR477W	1902 nt		10.78	□□□□□ -0.68
YKL050C	P35736	YDR010C	YDR010C	333 nt		10.78	□□□□□ -0.68
YKL050C	P35736	SHB17	YKR043C	816 nt		10.76	□□□□□ -0.69
YKL050C	P35736	IRC24	YIR036C	792 nt		10.74	□□□□□ -0.69
YKL050C	P35736	SHH4	YLR164W	507 nt		10.72	□□□□□ -0.69
YKL050C	P35736	ARP6	YLR085C	1317 nt		10.72	□□□□□ -0.69
YKL050C	P35736	THI74	YDR438W	1113 nt		10.7	□□□□□ -0.7
YKL050C	P35736	UBA4	YHR111W	1323 nt		10.69	□□□□□ -0.7
YKL050C	P35736	TIR3	YIL011W	810 nt		10.69	□□□□□ -0.7
YKL050C	P35736	PLB1	YMR008C	1995 nt		10.68	□□□□□ -0.7
YKL050C	P35736	YFL015W-A	YFL015W-A	318 nt		10.68	□□□□□ -0.7
YKL050C	P35736	BIO5	YNR056C	1686 nt		10.68	□□□□□ -0.7
YKL050C	P35736	RET2	YFR051C	1641 nt		10.68	□□□□□ -0.7
YKL050C	P35736	MCH5	YOR306C	1566 nt		10.67	□□□□□ -0.7
YKL050C	P35736	NAT4	YMR069W	858 nt		10.66	□□□□□ -0.7
YKL050C	P35736	SFA1	YDL168W	1161 nt		10.65	□□□□□ -0.7
YKL050C	P35736	MSF1	YPR047W	1410 nt		10.64	□□□□□ -0.71
YKL050C	P35736	LSC2	YGR244C	1284 nt		10.63	□□□□□ -0.71

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