Protein–RNA interactions for Protein: P25044

PTP1, Tyrosine-protein phosphatase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PTP1P25044 ERF2YLR246W 1080 nt10.4□□□□□ -0.74
PTP1P25044 PCH2YBR186W 1695 nt10.39□□□□□ -0.75
PTP1P25044 YFL067WYFL067W 528 nt10.37□□□□□ -0.75
PTP1P25044 STB1YNL309W 1263 nt10.37□□□□□ -0.75
PTP1P25044 SPC25YER018C 666 nt10.36□□□□□ -0.75
PTP1P25044 DDR2YOL052C-A 186 nt10.36□□□□□ -0.75
PTP1P25044 PRE6YOL038W 765 nt10.34□□□□□ -0.75
PTP1P25044 GPI16YHR188C 1833 nt10.34□□□□□ -0.75
PTP1P25044 YLR415CYLR415C 339 nt10.33□□□□□ -0.76
PTP1P25044 PEX25YPL112C 1185 nt10.33□□□□□ -0.76
PTP1P25044 ATF2YGR177C 1608 nt10.33□□□□□ -0.76
PTP1P25044 CCT4YDL143W 1587 nt10.32□□□□□ -0.76
PTP1P25044 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.32□□□□□ -0.76
PTP1P25044 CRR1YLR213C 1269 nt10.31□□□□□ -0.76
PTP1P25044 GUT2YIL155C 1950 nt10.31□□□□□ -0.76
PTP1P25044 BDH1YAL060W 1149 nt10.3□□□□□ -0.76
PTP1P25044 SWC5YBR231C 912 nt10.29□□□□□ -0.76
PTP1P25044 NCP1YHR042W 2076 nt10.29□□□□□ -0.76
PTP1P25044 YJL225CYJL225C 5277 nt10.28□□□□□ -0.76
PTP1P25044 YSP3YOR003W 1437 nt10.28□□□□□ -0.76
PTP1P25044 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.28□□□□□ -0.76
PTP1P25044 BOP3YNL042W 1191 nt10.27□□□□□ -0.77
PTP1P25044 MCH5YOR306C 1566 nt10.26□□□□□ -0.77
PTP1P25044 YFL066CYFL066C 1179 nt10.26□□□□□ -0.77
PTP1P25044 BOR1YNL275W 1731 nt10.25□□□□□ -0.77
PTP1P25044 VPS60YDR486C 690 nt10.25□□□□□ -0.77
PTP1P25044 YNL115CYNL115C 1935 nt10.25□□□□□ -0.77
PTP1P25044 ANP1YEL036C 1503 nt10.23□□□□□ -0.77
PTP1P25044 FEN2YCR028C 1539 nt10.23□□□□□ -0.77
PTP1P25044 RTF1YGL244W 1677 nt10.22□□□□□ -0.77
PTP1P25044 HEM12YDR047W 1089 nt10.22□□□□□ -0.77
PTP1P25044 SNG1YGR197C 1644 nt10.21□□□□□ -0.78
PTP1P25044 LYS4YDR234W 2082 nt10.2□□□□□ -0.78
PTP1P25044 NAT4YMR069W 858 nt10.19□□□□□ -0.78
PTP1P25044 ALG3YBL082C 1377 nt10.18□□□□□ -0.78
PTP1P25044 VPS75YNL246W 795 nt10.16□□□□□ -0.78
PTP1P25044 GLK1YCL040W 1503 nt10.16□□□□□ -0.78
PTP1P25044 SPT8YLR055C 1809 nt10.14□□□□□ -0.79
PTP1P25044 MIC10YCL057C-A 294 nt10.13□□□□□ -0.79
PTP1P25044 PIB2YGL023C 1908 nt10.13□□□□□ -0.79
PTP1P25044 YIR016WYIR016W 798 nt10.12□□□□□ -0.79
PTP1P25044 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.11□□□□□ -0.79
PTP1P25044 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.11□□□□□ -0.79
PTP1P25044 RPM1RPM1 483 nt10.09□□□□□ -0.79
PTP1P25044 TIM17YJL143W 477 nt10.08□□□□□ -0.8
PTP1P25044 MIR1YJR077C 936 nt10.07□□□□□ -0.8
PTP1P25044 MSF1YPR047W 1410 nt10.07□□□□□ -0.8
PTP1P25044 BNA2YJR078W 1362 nt10.06□□□□□ -0.8
PTP1P25044 THI74YDR438W 1113 nt10.06□□□□□ -0.8
PTP1P25044 PAU7YAR020C 168 nt10.05□□□□□ -0.8
PTP1P25044 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.04□□□□□ -0.8
PTP1P25044 PTK1YKL198C 1989 nt10.02□□□□□ -0.81
PTP1P25044 RAX1YOR301W 1308 nt9.99□□□□□ -0.81
PTP1P25044 YMR244WYMR244W 1068 nt9.98□□□□□ -0.81
PTP1P25044 MIC12YBR262C 321 nt9.98□□□□□ -0.81
PTP1P25044 XDJ1YLR090W 1380 nt9.98□□□□□ -0.81
PTP1P25044 SHM2YLR058C 1410 nt9.98□□□□□ -0.81
PTP1P25044 YGR201CYGR201C 678 nt9.93□□□□□ -0.82
PTP1P25044 DAT1YML113W 747 nt9.93□□□□□ -0.82
PTP1P25044 YFL054CYFL054C 1941 nt9.92□□□□□ -0.82
PTP1P25044 HHO1YPL127C 777 nt9.91□□□□□ -0.82
PTP1P25044 GLR1YPL091W 1452 nt9.91□□□□□ -0.82
PTP1P25044 GDH3YAL062W 1374 nt9.9□□□□□ -0.82
PTP1P25044 UBA4YHR111W 1323 nt9.9□□□□□ -0.82
PTP1P25044 SHB17YKR043C 816 nt9.89□□□□□ -0.83
PTP1P25044 SGT2YOR007C 1041 nt9.88□□□□□ -0.83
PTP1P25044 YGL034CYGL034C 366 nt9.87□□□□□ -0.83
PTP1P25044 NIT1YIL164C 600 nt9.86□□□□□ -0.83
PTP1P25044 YSR3YKR053C 1215 nt9.86□□□□□ -0.83
PTP1P25044 ALG12YNR030W 1656 nt9.83□□□□□ -0.84
PTP1P25044 RBG2YGR173W 1107 nt9.83□□□□□ -0.84
PTP1P25044 YCR087WYCR087W 516 nt9.81□□□□□ -0.84
PTP1P25044 AVT6YER119C 1347 nt9.81□□□□□ -0.84
PTP1P25044 YDR010CYDR010C 333 nt9.8□□□□□ -0.84
PTP1P25044 RET2YFR051C 1641 nt9.79□□□□□ -0.84
PTP1P25044 GOR1YNL274C 1053 nt9.79□□□□□ -0.84
PTP1P25044 XYL2YLR070C 1071 nt9.76□□□□□ -0.85
PTP1P25044 PHO89YBR296C 1725 nt9.76□□□□□ -0.85
PTP1P25044 NDI1YML120C 1542 nt9.75□□□□□ -0.85
PTP1P25044 CCA1YER168C 1641 nt9.72□□□□□ -0.85
PTP1P25044 YCR102CYCR102C 1107 nt9.72□□□□□ -0.85
PTP1P25044 RBG1YAL036C 1110 nt9.72□□□□□ -0.85
PTP1P25044 AIM45YPR004C 1035 nt9.72□□□□□ -0.85
PTP1P25044 SWE1YJL187C 2460 nt9.69□□□□□ -0.86
PTP1P25044 AGP1YCL025C 1902 nt9.69□□□□□ -0.86
PTP1P25044 MRP20YDR405W 792 nt9.68□□□□□ -0.86
PTP1P25044 YMR226CYMR226C 804 nt9.68□□□□□ -0.86
PTP1P25044 SAM1YLR180W 1149 nt9.63□□□□□ -0.87
PTP1P25044 DUT1YBR252W 444 nt9.63□□□□□ -0.87
PTP1P25044 DUS1YML080W 1272 nt9.61□□□□□ -0.87
PTP1P25044 COQ2YNR041C 1119 nt9.61□□□□□ -0.87
PTP1P25044 SFA1YDL168W 1161 nt9.59□□□□□ -0.87
PTP1P25044 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.58□□□□□ -0.88
PTP1P25044 NAR1YNL240C 1476 nt9.57□□□□□ -0.88
PTP1P25044 RPL4BYDR012W 1089 nt9.56□□□□□ -0.88
PTP1P25044 CLB6YGR109C 1143 nt9.56□□□□□ -0.88
PTP1P25044 TIR3YIL011W 810 nt9.56□□□□□ -0.88
PTP1P25044 RPL4AYBR031W 1089 nt9.56□□□□□ -0.88
PTP1P25044 NBP35YGL091C 987 nt9.55□□□□□ -0.88
PTP1P25044 HSP60YLR259C 1719 nt9.55□□□□□ -0.88
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