Protein–RNA interactions for Protein: P0CS90

SSC1, Heat shock protein SSC1, mitochondrial, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 654 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSC1P0CS90 TIM23YNR017W 669 nt11.05□□□□□ -0.64
SSC1P0CS90 MCH5YOR306C 1566 nt11.05□□□□□ -0.64
SSC1P0CS90 AQY1YPR192W 918 nt11.05□□□□□ -0.64
SSC1P0CS90 ANP1YEL036C 1503 nt11.04□□□□□ -0.64
SSC1P0CS90 CCA1YER168C 1641 nt11.02□□□□□ -0.64
SSC1P0CS90 YLR179CYLR179C 606 nt11.02□□□□□ -0.65
SSC1P0CS90 STB1YNL309W 1263 nt11□□□□□ -0.65
SSC1P0CS90 SPC25YER018C 666 nt10.99□□□□□ -0.65
SSC1P0CS90 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.98□□□□□ -0.65
SSC1P0CS90 HSP60YLR259C 1719 nt10.97□□□□□ -0.65
SSC1P0CS90 YKL030WYKL030W 606 nt10.96□□□□□ -0.65
SSC1P0CS90 WSC2YNL283C 1512 nt10.95□□□□□ -0.66
SSC1P0CS90 FEN2YCR028C 1539 nt10.94□□□□□ -0.66
SSC1P0CS90 AHT1YHR093W 549 nt10.93□□□□□ -0.66
SSC1P0CS90 GPI16YHR188C 1833 nt10.93□□□□□ -0.66
SSC1P0CS90 BNA2YJR078W 1362 nt10.92□□□□□ -0.66
SSC1P0CS90 FUR4YBR021W 1902 nt10.92□□□□□ -0.66
SSC1P0CS90 MIC12YBR262C 321 nt10.92□□□□□ -0.66
SSC1P0CS90 GLK1YCL040W 1503 nt10.89□□□□□ -0.67
SSC1P0CS90 VPS60YDR486C 690 nt10.89□□□□□ -0.67
SSC1P0CS90 CCT4YDL143W 1587 nt10.88□□□□□ -0.67
SSC1P0CS90 YIR016WYIR016W 798 nt10.85□□□□□ -0.67
SSC1P0CS90 RTG1YOL067C 534 nt10.85□□□□□ -0.67
SSC1P0CS90 YPR064WYPR064W 420 nt10.85□□□□□ -0.67
SSC1P0CS90 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.85□□□□□ -0.67
SSC1P0CS90 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.85□□□□□ -0.67
SSC1P0CS90 ALG3YBL082C 1377 nt10.85□□□□□ -0.67
SSC1P0CS90 AGP1YCL025C 1902 nt10.85□□□□□ -0.67
SSC1P0CS90 SWC5YBR231C 912 nt10.8□□□□□ -0.68
SSC1P0CS90 TAD3YLR316C 969 nt10.79□□□□□ -0.68
SSC1P0CS90 HHO1YPL127C 777 nt10.78□□□□□ -0.68
SSC1P0CS90 ALG12YNR030W 1656 nt10.76□□□□□ -0.69
SSC1P0CS90 MRPL8YJL063C 717 nt10.74□□□□□ -0.69
SSC1P0CS90 YGR201CYGR201C 678 nt10.72□□□□□ -0.69
SSC1P0CS90 PRP4YPR178W 1398 nt10.72□□□□□ -0.69
SSC1P0CS90 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.71□□□□□ -0.69
SSC1P0CS90 YEL076CYEL076C 651 nt10.71□□□□□ -0.69
SSC1P0CS90 XDJ1YLR090W 1380 nt10.71□□□□□ -0.69
SSC1P0CS90 YLR464WYLR464W 651 nt10.71□□□□□ -0.69
SSC1P0CS90 DUS1YML080W 1272 nt10.71□□□□□ -0.69
SSC1P0CS90 YCL074WYCL074W 927 nt10.69□□□□□ -0.7
SSC1P0CS90 BDH1YAL060W 1149 nt10.69□□□□□ -0.7
SSC1P0CS90 Q0182Q0182 405 nt10.67□□□□□ -0.7
SSC1P0CS90 DPS1YLL018C 1674 nt10.66□□□□□ -0.7
SSC1P0CS90 YKR005CYKR005C 1578 nt10.66□□□□□ -0.7
SSC1P0CS90 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.65□□□□□ -0.7
SSC1P0CS90 DUT1YBR252W 444 nt10.65□□□□□ -0.7
SSC1P0CS90 ADO1YJR105W 1023 nt10.63□□□□□ -0.71
SSC1P0CS90 YLR415CYLR415C 339 nt10.62□□□□□ -0.71
SSC1P0CS90 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.61□□□□□ -0.71
SSC1P0CS90 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.61□□□□□ -0.71
SSC1P0CS90 HUA1YGR268C 597 nt10.61□□□□□ -0.71
SSC1P0CS90 AAC1YMR056C 930 nt10.61□□□□□ -0.71
SSC1P0CS90 AVT6YER119C 1347 nt10.58□□□□□ -0.71
SSC1P0CS90 STR3YGL184C 1398 nt10.58□□□□□ -0.72
SSC1P0CS90 GDH3YAL062W 1374 nt10.58□□□□□ -0.72
SSC1P0CS90 BMT6YLR063W 1098 nt10.58□□□□□ -0.72
SSC1P0CS90 YSP3YOR003W 1437 nt10.57□□□□□ -0.72
SSC1P0CS90 YGR259CYGR259C 441 nt10.56□□□□□ -0.72
SSC1P0CS90 GOR1YNL274C 1053 nt10.55□□□□□ -0.72
SSC1P0CS90 SHM2YLR058C 1410 nt10.55□□□□□ -0.72
SSC1P0CS90 SNF1YDR477W 1902 nt10.54□□□□□ -0.72
SSC1P0CS90 TIM17YJL143W 477 nt10.49□□□□□ -0.73
SSC1P0CS90 AQY2YLL052C 450 nt10.49□□□□□ -0.73
SSC1P0CS90 BIO5YNR056C 1686 nt10.47□□□□□ -0.73
SSC1P0CS90 NIT1YIL164C 600 nt10.46□□□□□ -0.73
SSC1P0CS90 YNL115CYNL115C 1935 nt10.45□□□□□ -0.74
SSC1P0CS90 IRC24YIR036C 792 nt10.45□□□□□ -0.74
SSC1P0CS90 DAT1YML113W 747 nt10.43□□□□□ -0.74
SSC1P0CS90 PEX25YPL112C 1185 nt10.43□□□□□ -0.74
SSC1P0CS90 RTN2YDL204W 1182 nt10.41□□□□□ -0.74
SSC1P0CS90 NAR1YNL240C 1476 nt10.41□□□□□ -0.74
SSC1P0CS90 SGT2YOR007C 1041 nt10.4□□□□□ -0.74
SSC1P0CS90 YFL066CYFL066C 1179 nt10.36□□□□□ -0.75
SSC1P0CS90 NBP35YGL091C 987 nt10.34□□□□□ -0.75
SSC1P0CS90 PBP1YGR178C 2169 nt10.33□□□□□ -0.76
SSC1P0CS90 YCR102CYCR102C 1107 nt10.33□□□□□ -0.76
SSC1P0CS90 VPS75YNL246W 795 nt10.33□□□□□ -0.76
SSC1P0CS90 YFR018CYFR018C 1092 nt10.31□□□□□ -0.76
SSC1P0CS90 RPM1RPM1 483 nt10.31□□□□□ -0.76
SSC1P0CS90 HSL7YBR133C 2484 nt10.28□□□□□ -0.76
SSC1P0CS90 UBX6YJL048C 1191 nt10.28□□□□□ -0.76
SSC1P0CS90 YDR094WYDR094W 336 nt10.27□□□□□ -0.77
SSC1P0CS90 ARP6YLR085C 1317 nt10.27□□□□□ -0.77
SSC1P0CS90 PLB1YMR008C 1995 nt10.26□□□□□ -0.77
SSC1P0CS90 CYT2YKL087C 675 nt10.26□□□□□ -0.77
SSC1P0CS90 PRE6YOL038W 765 nt10.26□□□□□ -0.77
SSC1P0CS90 CMP2YML057W 1815 nt10.24□□□□□ -0.77
SSC1P0CS90 SHH4YLR164W 507 nt10.17□□□□□ -0.78
SSC1P0CS90 TIR3YIL011W 810 nt10.16□□□□□ -0.78
SSC1P0CS90 PRM5YIL117C 957 nt10.15□□□□□ -0.78
SSC1P0CS90 PAU7YAR020C 168 nt10.14□□□□□ -0.79
SSC1P0CS90 YDR010CYDR010C 333 nt10.13□□□□□ -0.79
SSC1P0CS90 HEL2YDR266C 1920 nt10.13□□□□□ -0.79
SSC1P0CS90 LSC2YGR244C 1284 nt10.12□□□□□ -0.79
SSC1P0CS90 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.11□□□□□ -0.79
SSC1P0CS90 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.11□□□□□ -0.79
SSC1P0CS90 UTR1YJR049C 1593 nt10.1□□□□□ -0.79
SSC1P0CS90 SHB17YKR043C 816 nt10.1□□□□□ -0.79
SSC1P0CS90 GAP1YKR039W 1809 nt10.1□□□□□ -0.79
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