Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
NebE9Q1W3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
NebE9Q1W3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
NebE9Q1W3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
NebE9Q1W3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
NebE9Q1W3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
NebE9Q1W3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
NebE9Q1W3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
NebE9Q1W3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
NebE9Q1W3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
NebE9Q1W3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
NebE9Q1W3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
NebE9Q1W3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
NebE9Q1W3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
NebE9Q1W3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
NebE9Q1W3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
NebE9Q1W3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
NebE9Q1W3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
NebE9Q1W3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
NebE9Q1W3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
NebE9Q1W3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
NebE9Q1W3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
NebE9Q1W3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
NebE9Q1W3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
NebE9Q1W3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
NebE9Q1W3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
NebE9Q1W3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
NebE9Q1W3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
NebE9Q1W3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
NebE9Q1W3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
NebE9Q1W3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
NebE9Q1W3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
NebE9Q1W3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
NebE9Q1W3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
NebE9Q1W3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
NebE9Q1W3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NebE9Q1W3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
NebE9Q1W3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
NebE9Q1W3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
NebE9Q1W3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
NebE9Q1W3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
NebE9Q1W3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NebE9Q1W3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NebE9Q1W3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NebE9Q1W3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NebE9Q1W3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NebE9Q1W3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
NebE9Q1W3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
NebE9Q1W3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NebE9Q1W3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
NebE9Q1W3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
NebE9Q1W3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
NebE9Q1W3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
NebE9Q1W3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
NebE9Q1W3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
NebE9Q1W3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
NebE9Q1W3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
NebE9Q1W3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
NebE9Q1W3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
NebE9Q1W3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
NebE9Q1W3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
NebE9Q1W3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NebE9Q1W3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NebE9Q1W3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NebE9Q1W3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NebE9Q1W3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NebE9Q1W3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NebE9Q1W3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NebE9Q1W3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NebE9Q1W3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NebE9Q1W3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NebE9Q1W3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NebE9Q1W3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NebE9Q1W3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NebE9Q1W3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms