Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
NebE9Q1W3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
NebE9Q1W3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
NebE9Q1W3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
NebE9Q1W3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
NebE9Q1W3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
NebE9Q1W3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
NebE9Q1W3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
NebE9Q1W3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
NebE9Q1W3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
NebE9Q1W3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
NebE9Q1W3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
NebE9Q1W3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
NebE9Q1W3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
NebE9Q1W3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
NebE9Q1W3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
NebE9Q1W3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
NebE9Q1W3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
NebE9Q1W3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
NebE9Q1W3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
NebE9Q1W3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
NebE9Q1W3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
NebE9Q1W3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
NebE9Q1W3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
NebE9Q1W3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
NebE9Q1W3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
NebE9Q1W3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
NebE9Q1W3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
NebE9Q1W3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
NebE9Q1W3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
NebE9Q1W3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
NebE9Q1W3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
NebE9Q1W3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
NebE9Q1W3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
NebE9Q1W3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
NebE9Q1W3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NebE9Q1W3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
NebE9Q1W3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
NebE9Q1W3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
NebE9Q1W3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
NebE9Q1W3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
NebE9Q1W3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NebE9Q1W3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NebE9Q1W3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NebE9Q1W3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NebE9Q1W3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NebE9Q1W3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
NebE9Q1W3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
NebE9Q1W3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NebE9Q1W3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
NebE9Q1W3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
NebE9Q1W3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
NebE9Q1W3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
NebE9Q1W3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
NebE9Q1W3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
NebE9Q1W3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
NebE9Q1W3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
NebE9Q1W3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
NebE9Q1W3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
NebE9Q1W3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
NebE9Q1W3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
NebE9Q1W3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NebE9Q1W3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NebE9Q1W3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NebE9Q1W3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NebE9Q1W3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NebE9Q1W3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NebE9Q1W3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NebE9Q1W3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NebE9Q1W3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NebE9Q1W3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NebE9Q1W3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NebE9Q1W3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NebE9Q1W3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NebE9Q1W3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NebE9Q1W3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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