Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y597

KCTD3, BTB/POZ domain-containing protein KCTD3, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD3Q9Y597 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCTD3Q9Y597 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms