Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2J2

EPB41L3, Band 4.1-like protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L3Q9Y2J2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPB41L3Q9Y2J2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPB41L3Q9Y2J2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPB41L3Q9Y2J2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPB41L3Q9Y2J2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPB41L3Q9Y2J2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPB41L3Q9Y2J2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPB41L3Q9Y2J2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPB41L3Q9Y2J2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPB41L3Q9Y2J2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPB41L3Q9Y2J2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPB41L3Q9Y2J2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPB41L3Q9Y2J2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41L3Q9Y2J2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41L3Q9Y2J2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41L3Q9Y2J2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41L3Q9Y2J2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41L3Q9Y2J2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41L3Q9Y2J2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41L3Q9Y2J2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41L3Q9Y2J2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41L3Q9Y2J2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41L3Q9Y2J2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41L3Q9Y2J2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41L3Q9Y2J2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41L3Q9Y2J2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41L3Q9Y2J2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41L3Q9Y2J2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41L3Q9Y2J2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41L3Q9Y2J2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41L3Q9Y2J2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41L3Q9Y2J2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41L3Q9Y2J2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41L3Q9Y2J2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41L3Q9Y2J2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41L3Q9Y2J2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41L3Q9Y2J2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41L3Q9Y2J2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41L3Q9Y2J2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms