Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC17A6Q9P2U8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms