Protein–RNA interactions for Protein: Q92622

RUBCN, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNQ92622 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RUBCNQ92622 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUBCNQ92622 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms