Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTD1Q8N815 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms