Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CA9Q16790 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CA9Q16790 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CA9Q16790 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CA9Q16790 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CA9Q16790 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CA9Q16790 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CA9Q16790 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CA9Q16790 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CA9Q16790 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CA9Q16790 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CA9Q16790 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CA9Q16790 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CA9Q16790 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CA9Q16790 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CA9Q16790 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CA9Q16790 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CA9Q16790 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CA9Q16790 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CA9Q16790 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CA9Q16790 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CA9Q16790 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CA9Q16790 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CA9Q16790 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CA9Q16790 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CA9Q16790 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CA9Q16790 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CA9Q16790 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CA9Q16790 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CA9Q16790 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CA9Q16790 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CA9Q16790 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CA9Q16790 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CA9Q16790 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CA9Q16790 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CA9Q16790 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CA9Q16790 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CA9Q16790 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CA9Q16790 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CA9Q16790 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CA9Q16790 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CA9Q16790 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CA9Q16790 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CA9Q16790 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CA9Q16790 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CA9Q16790 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CA9Q16790 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CA9Q16790 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CA9Q16790 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CA9Q16790 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CA9Q16790 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CA9Q16790 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CA9Q16790 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CA9Q16790 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CA9Q16790 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CA9Q16790 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CA9Q16790 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CA9Q16790 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CA9Q16790 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CA9Q16790 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CA9Q16790 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CA9Q16790 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CA9Q16790 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CA9Q16790 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CA9Q16790 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CA9Q16790 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CA9Q16790 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CA9Q16790 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CA9Q16790 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CA9Q16790 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CA9Q16790 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CA9Q16790 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CA9Q16790 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CA9Q16790 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CA9Q16790 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CA9Q16790 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CA9Q16790 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CA9Q16790 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CA9Q16790 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CA9Q16790 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CA9Q16790 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CA9Q16790 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CA9Q16790 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CA9Q16790 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CA9Q16790 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CA9Q16790 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CA9Q16790 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CA9Q16790 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CA9Q16790 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CA9Q16790 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CA9Q16790 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CA9Q16790 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CA9Q16790 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CA9Q16790 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CA9Q16790 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CA9Q16790 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CA9Q16790 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CA9Q16790 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CA9Q16790 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CA9Q16790 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms