Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
SCARB2Q14108 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms