Protein–RNA interactions for Protein: Q03691

ROT1, Protein ROT1, yeastyeast

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ROT1Q03691 YGR038C-AYGR038C-A 1323 nt5.44□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YGR161C-CYGR161C-C 1323 nt5.44□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YJR026WYJR026W 1323 nt5.44□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YJR028WYJR028W 1323 nt5.44□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YAR010CYAR010C 1323 nt5.44□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YLR157C-AYLR157C-A 1323 nt5.44□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YLR227W-AYLR227W-A 1323 nt5.44□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YLR256W-AYLR256W-A 1323 nt5.44□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YML040WYML040W 1323 nt5.44□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YML045W-AYML045W-A 1323 nt5.44□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YMR051CYMR051C 1323 nt5.44□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YNL054W-AYNL054W-A 1323 nt5.44□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YOL103W-AYOL103W-A 1323 nt5.44□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YPL257W-AYPL257W-A 1323 nt5.44□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YPR137C-AYPR137C-A 1323 nt5.44□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YPR158C-CYPR158C-C 1323 nt5.44□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 GUP2YPL189W 1830 nt5.44□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 PYC1YGL062W 3537 nt5.43□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 URA7YBL039C 1740 nt5.43□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 FET3YMR058W 1911 nt5.43□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 RRF1YHR038W 693 nt5.43□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 BOS1YLR078C 735 nt5.43□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YNR062CYNR062C 984 nt5.43□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 ARG1YOL058W 1263 nt5.43□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt5.43□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YBR287WYBR287W 1284 nt5.43□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 IML2YJL082W 2196 nt5.43□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 COM2YER130C 1332 nt5.43□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 VPS4YPR173C 1314 nt5.43□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 MSN2YMR037C 2115 nt5.42□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 PUT1YLR142W 1431 nt5.42□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 HMLALPHA2YCL067C 633 nt5.42□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 MATALPHA2YCR039C 633 nt5.42□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 COX9YDL067C 180 nt5.42□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 DOS2YDR068W 933 nt5.42□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 CIA2YHR122W 696 nt5.42□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 IRC9YJL142C 393 nt5.42□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 GAT3YLR013W 426 nt5.42□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YMR084WYMR084W 789 nt5.42□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 RRG9YNL213C 645 nt5.42□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YOL150CYOL150C 312 nt5.42□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 MUM2YBR057C 1101 nt5.42□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 VNX1YNL321W 2727 nt5.42□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YHR177WYHR177W 1362 nt5.42□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YRF1-4YLR466W 4149 nt5.41□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 LCB2YDR062W 1686 nt5.41□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 UTP7YER082C 1665 nt5.41□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 TGL2YDR058C 981 nt5.41□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt5.41□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 PEX18YHR160C 852 nt5.41□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YML6YML025C 861 nt5.41□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 DLT1YMR126C 1029 nt5.41□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 MDJ2YNL328C 441 nt5.41□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 CAR1YPL111W 1002 nt5.41□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 HUT1YPL244C 1020 nt5.41□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YBR116CYBR116C 528 nt5.41□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 RSA4YCR072C 1548 nt5.4□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 SPR3YGR059W 1539 nt5.4□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 snR7-LsnR7-L 214 nt5.4□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 RRP8YDR083W 1179 nt5.4□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 TLG1YDR468C 675 nt5.4□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 SEH1YGL100W 1050 nt5.4□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 PTI1YGR156W 1278 nt5.4□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YIL152WYIL152W 708 nt5.4□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YLR374CYLR374C 390 nt5.4□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 GPI12YMR281W 915 nt5.4□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 ELA1YNL230C 1140 nt5.4□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YBL094CYBL094C 333 nt5.4□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 PLP2YOR281C 861 nt5.4□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 RPO26YPR187W 468 nt5.4□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 MLC2YPR188C 492 nt5.4□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 STB5YHR178W 2232 nt5.4□□□□□ -1.55
ROT1Q03691 SAG1YJR004C 1953 nt5.4□□□□□ -1.55
ROT1Q03691 MGA1YGR249W 1371 nt5.4□□□□□ -1.55
ROT1Q03691 YEH1YLL012W 1722 nt5.4□□□□□ -1.55
ROT1Q03691 TAF8YML114C 1533 nt5.39□□□□□ -1.55
ROT1Q03691 BI3Q0115 1554 nt5.39□□□□□ -1.55
ROT1Q03691 ERT1YBR239C 1590 nt5.39□□□□□ -1.55
ROT1Q03691 YFR006WYFR006W 1608 nt5.39□□□□□ -1.55
ROT1Q03691 YCR108CYCR108C 192 nt5.39□□□□□ -1.55
ROT1Q03691 YDL183CYDL183C 963 nt5.39□□□□□ -1.55
ROT1Q03691 GIM4YEL003W 336 nt5.39□□□□□ -1.55
ROT1Q03691 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt5.39□□□□□ -1.55
ROT1Q03691 NQM1YGR043C 1002 nt5.39□□□□□ -1.55
ROT1Q03691 SYN8YAL014C 768 nt5.39□□□□□ -1.55
ROT1Q03691 PRM9YAR031W 897 nt5.39□□□□□ -1.55
ROT1Q03691 SEC14YMR079W 915 nt5.39□□□□□ -1.55
ROT1Q03691 YNL320WYNL320W 855 nt5.39□□□□□ -1.55
ROT1Q03691 YOR114WYOR114W 885 nt5.39□□□□□ -1.55
ROT1Q03691 YOR238WYOR238W 912 nt5.39□□□□□ -1.55
ROT1Q03691 SUP45YBR143C 1314 nt5.39□□□□□ -1.55
ROT1Q03691 YMR1YJR110W 2067 nt5.38□□□□□ -1.55
ROT1Q03691 DBP9YLR276C 1785 nt5.38□□□□□ -1.55
ROT1Q03691 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.38□□□□□ -1.55
ROT1Q03691 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.38□□□□□ -1.55
ROT1Q03691 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.38□□□□□ -1.55
ROT1Q03691 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.38□□□□□ -1.55
ROT1Q03691 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.38□□□□□ -1.55
ROT1Q03691 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.38□□□□□ -1.55
ROT1Q03691 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.7 ms