Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSNK2A1P68400 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK2A1P68400 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms