Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRIQ3A6PVS8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRIQ3A6PVS8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms