Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDCBP2Q9H190 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SDCBP2Q9H190 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SDCBP2Q9H190 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDCBP2Q9H190 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms