Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL1

TMEM74, Transmembrane protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM74Q96NL1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM74Q96NL1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM74Q96NL1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM74Q96NL1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM74Q96NL1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM74Q96NL1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM74Q96NL1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM74Q96NL1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM74Q96NL1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM74Q96NL1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM74Q96NL1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM74Q96NL1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM74Q96NL1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM74Q96NL1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM74Q96NL1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM74Q96NL1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM74Q96NL1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM74Q96NL1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM74Q96NL1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM74Q96NL1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM74Q96NL1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM74Q96NL1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM74Q96NL1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM74Q96NL1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM74Q96NL1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM74Q96NL1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM74Q96NL1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM74Q96NL1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM74Q96NL1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM74Q96NL1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM74Q96NL1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM74Q96NL1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM74Q96NL1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM74Q96NL1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM74Q96NL1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM74Q96NL1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM74Q96NL1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM74Q96NL1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM74Q96NL1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM74Q96NL1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM74Q96NL1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM74Q96NL1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms