Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TSR2Q969E8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TSR2Q969E8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TSR2Q969E8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TSR2Q969E8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TSR2Q969E8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TSR2Q969E8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TSR2Q969E8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TSR2Q969E8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TSR2Q969E8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TSR2Q969E8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TSR2Q969E8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TSR2Q969E8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TSR2Q969E8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TSR2Q969E8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TSR2Q969E8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TSR2Q969E8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TSR2Q969E8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TSR2Q969E8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TSR2Q969E8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TSR2Q969E8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TSR2Q969E8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TSR2Q969E8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TSR2Q969E8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TSR2Q969E8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TSR2Q969E8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TSR2Q969E8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TSR2Q969E8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TSR2Q969E8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TSR2Q969E8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TSR2Q969E8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TSR2Q969E8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms