Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN17

LIN28B, Protein lin-28 homolog B, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28BQ6ZN17 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.135e-11■■■■■ 37.3
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LIN28BQ6ZN17 PUM2-207ENST00000429419 547 ntTSL 56.33□□□□□ -1.43e-8■■■■■ 36.7
LIN28BQ6ZN17 PUM2-205ENST00000420234 562 ntTSL 55.03□□□□□ -1.63e-8■■■■■ 36.7
LIN28BQ6ZN17 RPL36A-207ENST00000489407 373 ntTSL 24.26□□□□□ -1.736e-14■■■■■ 36.7
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LIN28BQ6ZN17 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.062e-10■■■■■ 36.7
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LIN28BQ6ZN17 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.285e-11■■■■■ 36.6
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LIN28BQ6ZN17 TMEM164-202ENST00000372068 5566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.561e-8■■■■■ 36.6
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