Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
RUNX2Q13950 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RUNX2Q13950 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNX2Q13950 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNX2Q13950 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNX2Q13950 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNX2Q13950 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNX2Q13950 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
RUNX2Q13950 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
RUNX2Q13950 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNX2Q13950 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNX2Q13950 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RUNX2Q13950 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNX2Q13950 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RUNX2Q13950 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNX2Q13950 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNX2Q13950 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNX2Q13950 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNX2Q13950 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNX2Q13950 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RUNX2Q13950 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RUNX2Q13950 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNX2Q13950 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNX2Q13950 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RUNX2Q13950 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNX2Q13950 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNX2Q13950 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNX2Q13950 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX2Q13950 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX2Q13950 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX2Q13950 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX2Q13950 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX2Q13950 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX2Q13950 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX2Q13950 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX2Q13950 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX2Q13950 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNX2Q13950 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RUNX2Q13950 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNX2Q13950 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RUNX2Q13950 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNX2Q13950 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNX2Q13950 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNX2Q13950 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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