Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

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Length 274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCSO14618 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCSO14618 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCSO14618 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCSO14618 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCSO14618 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCSO14618 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCSO14618 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCSO14618 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCSO14618 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCSO14618 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCSO14618 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCSO14618 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCSO14618 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCSO14618 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCSO14618 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCSO14618 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCSO14618 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCSO14618 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSO14618 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSO14618 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSO14618 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSO14618 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSO14618 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSO14618 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSO14618 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSO14618 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSO14618 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSO14618 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSO14618 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSO14618 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSO14618 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCSO14618 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCSO14618 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCSO14618 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCSO14618 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCSO14618 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCSO14618 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCSO14618 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCSO14618 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCSO14618 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCSO14618 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCSO14618 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCSO14618 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCSO14618 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSO14618 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSO14618 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSO14618 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSO14618 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSO14618 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSO14618 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSO14618 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSO14618 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSO14618 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSO14618 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSO14618 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSO14618 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSO14618 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSO14618 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSO14618 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSO14618 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSO14618 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSO14618 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSO14618 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSO14618 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSO14618 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSO14618 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSO14618 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSO14618 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSO14618 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSO14618 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSO14618 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSO14618 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSO14618 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCSO14618 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCSO14618 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCSO14618 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCSO14618 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCSO14618 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCSO14618 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCSO14618 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCSO14618 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCSO14618 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCSO14618 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCSO14618 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCSO14618 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCSO14618 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCSO14618 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCSO14618 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCSO14618 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCSO14618 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCSO14618 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCSO14618 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCSO14618 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCSO14618 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCSO14618 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCSO14618 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCSO14618 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCSO14618 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCSO14618 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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