Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3R1

NDST4, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST4Q9H3R1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NDST4Q9H3R1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDST4Q9H3R1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms