Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3CQ99985 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms