Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF6Q96J87 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF6Q96J87 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms