Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC34Q96HJ3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms