Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms