Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV11

Putative UPF0633 protein ENSP00000303136, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VV11 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q5VV11 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q5VV11 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q5VV11 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q5VV11 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q5VV11 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q5VV11 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q5VV11 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q5VV11 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q5VV11 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q5VV11 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q5VV11 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q5VV11 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q5VV11 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q5VV11 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q5VV11 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q5VV11 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q5VV11 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q5VV11 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q5VV11 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q5VV11 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q5VV11 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q5VV11 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q5VV11 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q5VV11 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q5VV11 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Q5VV11 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Q5VV11 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VV11 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VV11 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VV11 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VV11 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VV11 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VV11 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VV11 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VV11 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VV11 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VV11 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VV11 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VV11 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VV11 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VV11 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VV11 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VV11 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VV11 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VV11 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VV11 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VV11 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VV11 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VV11 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VV11 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VV11 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VV11 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VV11 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VV11 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VV11 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VV11 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VV11 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VV11 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VV11 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VV11 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VV11 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VV11 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VV11 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VV11 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VV11 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VV11 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VV11 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VV11 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VV11 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VV11 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VV11 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VV11 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VV11 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VV11 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VV11 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VV11 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VV11 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VV11 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VV11 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VV11 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VV11 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VV11 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VV11 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VV11 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VV11 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VV11 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q5VV11 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q5VV11 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q5VV11 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Q5VV11 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q5VV11 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q5VV11 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q5VV11 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q5VV11 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q5VV11 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q5VV11 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q5VV11 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q5VV11 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q5VV11 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms