Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIPK1Q13546 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms