Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CSNK1A1P48729 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CSNK1A1P48729 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSNK1A1P48729 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSNK1A1P48729 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSNK1A1P48729 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSNK1A1P48729 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSNK1A1P48729 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSNK1A1P48729 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSNK1A1P48729 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSNK1A1P48729 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSNK1A1P48729 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSNK1A1P48729 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSNK1A1P48729 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSNK1A1P48729 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSNK1A1P48729 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSNK1A1P48729 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSNK1A1P48729 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSNK1A1P48729 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSNK1A1P48729 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSNK1A1P48729 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSNK1A1P48729 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSNK1A1P48729 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSNK1A1P48729 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSNK1A1P48729 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSNK1A1P48729 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSNK1A1P48729 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSNK1A1P48729 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSNK1A1P48729 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSNK1A1P48729 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms