Protein–RNA interactions for Protein: P09669

COX6C, Cytochrome c oxidase subunit 6C, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6CP09669 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6CP09669 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6CP09669 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6CP09669 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6CP09669 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6CP09669 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6CP09669 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6CP09669 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6CP09669 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6CP09669 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6CP09669 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6CP09669 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6CP09669 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6CP09669 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6CP09669 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX6CP09669 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX6CP09669 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX6CP09669 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX6CP09669 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX6CP09669 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX6CP09669 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX6CP09669 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX6CP09669 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX6CP09669 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX6CP09669 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX6CP09669 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX6CP09669 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX6CP09669 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX6CP09669 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX6CP09669 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX6CP09669 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX6CP09669 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX6CP09669 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX6CP09669 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX6CP09669 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX6CP09669 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX6CP09669 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX6CP09669 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX6CP09669 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX6CP09669 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX6CP09669 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX6CP09669 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX6CP09669 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX6CP09669 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX6CP09669 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX6CP09669 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX6CP09669 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX6CP09669 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX6CP09669 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX6CP09669 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX6CP09669 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COX6CP09669 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX6CP09669 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX6CP09669 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX6CP09669 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX6CP09669 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6CP09669 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6CP09669 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6CP09669 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6CP09669 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6CP09669 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6CP09669 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6CP09669 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6CP09669 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6CP09669 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6CP09669 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6CP09669 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6CP09669 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6CP09669 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6CP09669 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6CP09669 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6CP09669 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6CP09669 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6CP09669 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6CP09669 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6CP09669 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6CP09669 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6CP09669 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6CP09669 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6CP09669 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6CP09669 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6CP09669 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6CP09669 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6CP09669 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6CP09669 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6CP09669 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6CP09669 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
COX6CP09669 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COX6CP09669 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COX6CP09669 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COX6CP09669 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6CP09669 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6CP09669 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6CP09669 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6CP09669 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6CP09669 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6CP09669 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6CP09669 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6CP09669 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6CP09669 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms