Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM3Q9BZL3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms