Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC47Q96A33 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC47Q96A33 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC47Q96A33 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms