Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms