Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIGQ13278 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIGQ13278 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RIGQ13278 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIGQ13278 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIGQ13278 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIGQ13278 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIGQ13278 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIGQ13278 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIGQ13278 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIGQ13278 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIGQ13278 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIGQ13278 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIGQ13278 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIGQ13278 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIGQ13278 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIGQ13278 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIGQ13278 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIGQ13278 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIGQ13278 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIGQ13278 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIGQ13278 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIGQ13278 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIGQ13278 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RIGQ13278 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RIGQ13278 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIGQ13278 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIGQ13278 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIGQ13278 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIGQ13278 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIGQ13278 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIGQ13278 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIGQ13278 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIGQ13278 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIGQ13278 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIGQ13278 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIGQ13278 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIGQ13278 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIGQ13278 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIGQ13278 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIGQ13278 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIGQ13278 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIGQ13278 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIGQ13278 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIGQ13278 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIGQ13278 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIGQ13278 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIGQ13278 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIGQ13278 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIGQ13278 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIGQ13278 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIGQ13278 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIGQ13278 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIGQ13278 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIGQ13278 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIGQ13278 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIGQ13278 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIGQ13278 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIGQ13278 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIGQ13278 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIGQ13278 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIGQ13278 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIGQ13278 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIGQ13278 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIGQ13278 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RIGQ13278 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RIGQ13278 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RIGQ13278 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RIGQ13278 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RIGQ13278 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RIGQ13278 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RIGQ13278 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RIGQ13278 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RIGQ13278 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RIGQ13278 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RIGQ13278 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RIGQ13278 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RIGQ13278 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RIGQ13278 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RIGQ13278 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RIGQ13278 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RIGQ13278 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RIGQ13278 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RIGQ13278 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RIGQ13278 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RIGQ13278 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RIGQ13278 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RIGQ13278 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RIGQ13278 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIGQ13278 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIGQ13278 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIGQ13278 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIGQ13278 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIGQ13278 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIGQ13278 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIGQ13278 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIGQ13278 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RIGQ13278 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIGQ13278 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIGQ13278 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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